Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_025165.3
Sequence Length
1755 nt
GC Content
0.4934
AGAGGAGGUGGCGGUGGUGGCCCUCGCCUGUGGCCCCCGUGCUGCUUGCACUCGAACUCGUCGCCAUGGAGGAGCUCCAGGAGCCUCUGAGAGGACAGCUCCGGCUCUGCUUCACGCAAGCUGCCCGGACUAGCCUCUUACUGCUCAGGCUCAACGACGCUGCCCUGCGGGCGCUGCAAGAGUGUCAGCGGCAACAGGUACGGCCGGUGAUUGCUUUCCAAGGCCACCGAGGGUAUCUGAGACUCCCAGGCCCUGGUUGGUCCUGCCUCUUCUCCUUCAUAGUGUCCCAGUGUUGUCAGGAGGGCGCUGGUGGUAGCUUGGACCUUGUGUGCCAACGCUUCCUCAGGUCUGGGCCUAACAGCCUCCACUGCCUGGGCUCACUCAGGGAGCGCCUCAUUAUUUGGGCAGCCAUGGAUUCUAUCCCAGCCCCAUCAUCAGUUCAGGGACACAACCUGACUGAAGAUGCCAGACAUCCUGAGAGUUGGCAGAACACAGGAGGCUAUUCUGAAGGAGAUGCAGUAUCACAGCCACAGAUGGCACUAGAGGAGGUGUCAGUGUCAGAUCCACUGGCAAGCAACCAAGGACAGUCACUCCCAGGAUCCUCAAGGGAGCACAUGGCACAGUGGGAAGUGAGAAGCCAGACCCAUGUUCCAAACAGAGAACCUGUUCAGGCACUGCCUUCCUCUGCCAGCCGGAAACGUCUGGACAAGAAACGUUCAGUGCCUGUAGCCACUGUAGAACUGGAAGAAAAGAGGUUCAGAACUCUGCCUUUAGUGCCAAGCCCCCUACAAGGCCUGACCAAUCAGGAUUUACAAGAGGGAGAAGAUUGGGAGCAAGAAGAUGAGGACAUGGACCCCAGAUUAGAACACAGUUCCUCAGUUCAAGAAGAUUCUGAAUCCCCAAGUCCUGAAGAUAUACCAGACUACCUCCUGCAAUACAGGGCCAUCCACAGUGCAGAACAGCAACAUGCCUAUGAGCAGGACUUUGAGACAGAUUAUGCUGAAUACCGCAUCCUGCAUGCCCGUGUUGGGACUGCAAGCCAAAGGUUCAUAGAGCUGGGAGCAGAGAUUAAAAGAGUUCGGCGAGGAACUCCAGAAUACAAGGUCCUGGAAGACAAGAUAAUCCAGGAAUAUAAAAAGUUCAGGAAGCAGUACCCAAGUUACAGAGAAGAAAAGCGUCGCUGUGAGUACCUUCACCAGAAAUUGUCCCACAUUAAAGGUCUCAUCCUGGAGUUUGAGGAAAAGAACAGGGGCAGCUGAAGUUAUCAAGGGAAUUUUUGAGCCUCUGCUUAGUGAAACACAAAGGAACAAAGCAGCUAUAAACUAAAUAGAAUGCAACUAUCUGCUUUUCUUAUGCUGACCACUGGAGUCCAUGGUGGCAAGUAGAGAGCUGCUCUAGGUUCUUGAGGUUUGGUUUUCAUUAUUAAUUUUUAGGGUAUGGGCACUGUGCAAAGACUCCAUAGCUGUGCCUAGGAGUCUAGGAAAAGUGACAGAGGCUUGGCUUUUUUACCUUUAGUUCAGCCAAGUCAUUUUCAAGUCCUGAGAAAUGACAUCAUCUUCAGGAUAAAAUAAUGAGGACAUUAGACAAACCAAACUAAGUGAAUUUUAGCCUGGUAGCCUCUCUAAGGAAACAGUAAUAAUAACUUCUGAUAAGAGUUAAAAGAACUUGUAGCAUACCUGGAUAUAAUGGGAAAGGGCCUGGGUGUUACCCAUGUACUGAAAAUGAACUUUUACCAACAUGGCUAAAAAAUUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-579.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -612.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 437.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.((((((((.(((..(((((...((((((.((((((((.((((((.....((.((((.((.((((((((...((((((.(((((((..((.(((((....((((.....))))...)))))))..)))))))......))))))...)).)))..))).)))))).))...)))))).)))))).)).))...)))))))))..)))..))).(((((.(.(((((..(((.......)))))))).).)))))))))))))))))..((((((((.(((.((((((.(((((((..((((((((.(((((((..(....)..)))).))).))((((((((((((.....(((((((.((.((((((....)))))).)).(((.((.....))))).....((..((((...(((((..((((.(((((.((((.......))))))))).)))).(((.....)))...))))).))))..)))))))))..((((..((...((......))...)).))))((((((((((((...((((((((.......)))))))).....(((...(((((..(((((..((...))..)))))....(((.(((.((((...((......))..))))))).)))(((((.....)))))(((((((((......((((((((.((....)).)))).).)))......))))))))).....))))).....)))......((((........)))).)))))))))))).))))......))))))))....(((((((((....(.((((..(((((..((((.......((((((..((.................))..))))))))))..))....)))...))))))))))))))......))))).)..))))))))))))).))).)).......(((......)))......))))))((((((........(((......))).........))))))..(((.(((((((..((((...((...(((((...))))).)).)))).........((((((......))))))............(((((((...........))))))).....(((((((((.....((((((...(.((((((.((.(.....).)).)))))).).((((..(((.....(((((........((((((..((((........))))..))).(((((((....((((((........))))))...)))))))(((.(((...))).))).......(((.((((.......))))..)))........((((((....((((.((((.(((...)))))))))))....))))))((((.(((((((((..((((((((((((((((((..((((((((.(.(((((((.((..............)).)))))))..).))))))))...(((.((.(((((((((...(((....)))...))))))))).)).))).((((((((..(((....))).))))))))..))))))))))))......))))))...(((((.....))))).(((....(((.....)))...)))......(((((.((....))))))).))))))))).))))..))))))))...)))..))))...(((((...))))).))))))....))))))))).)))))))))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((.((((((((.(((..(((((...((((,({((((((((.((((((.....{(.((((.{(.((((((((...((((((.(((((((..((.((((({..,(({{...,,)))}.),)))))))..)))))))..,...))))))...)).))).,))).)})))),.}...)))))).))))))},).))...)))))))))..)))..))).((((({(.(((((..(((.{....,))))))))}),})))))))))}))))))..(((((({(.(((.((((((.(((((((..((((((({,{,((((({(({((({({((({{|||,|{({((((((((((,,...{{|,,,,.{{|((||{(|,,.))}))),)),(((.{{.....})))).{{..,(({,...,}})},)}..((((.(((({{((((.......))))))))).)))),|||,...})))}),))))))}..,}}}})),||||..{(((..{{.,,{{,.,.,,}..,,)).}}},((((((((((((.({((({{{((,,,,...}}))))))..,.,}}..{{.,.,({{(((((,.{,.,,|}..))))}....{||.,{,.||||..}||,....}),..,|||}||{|,,,((((.,...|||||(((((((((......((((((((.((....)).)))).),}))......))))))))).,},},)))).}}}})))......((((........)))).)))))))))))).}}|{{{{...|}}|||||....|||||,|||....|,|||,...,,{{{(({,,.,{{{..((((((..((.................))..)))))),|||..,....}))).,,))))}}})))),,},,...}))))).}..))))))))))))).))).}}......,(((......))}.,.,},))))))((((((....,,..(({....,,))}......,,.))))))..({(((((((((..((((...((...{((((...)))))})}.)))).........((((((......))))))............(((((((...........))))))).....(((((((((.....((((((...{.((((((.((.(.....}.)).)))))).}.((((..(((.....(((((........((({{{..((((......}.)))).,|||,({(((((,,{,{{{{{{.,{,,,,.}}}))),},))|||||(({.(((...))).,||{{...{{(((({{{{.......||||...,,...,,,}))))))))}}.{(((.{(((.(((...))))))))))}}}||||||||||||||{{||||||,,((((({((((((((((((..{(((((((.{.(((((((,,,,,...,....,.,,}}.}))))))..}.)))))))}...{((.{{.(((((((((...{{{....,))...))))))))).)).))}.((((((((..{((....))).))))))))..)))))))))}}}.......,,||||,,||{{|.....})))).,))))})}}))}}},.,}..{{{{{.....(((({{((....)))))))..,..)))})).,}..}))))))))...)))..))))...{((((...))))).))))))....))))))))).)))))))))}.............
Back