Basic Information

Symbol
ETV5
RNA class
mRNA
Alias
ETS Variant Transcription Factor 5 ERM ETS Translocation Variant 5 Ets-Related Protein ERM Ets-Related Molecule Ets Variant Gene 5 (Ets-Related Molecule) ETS Variant 5
Location (GRCh38)
3:186046314-186110318
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004454.3
Sequence length
4082.0 nt
GC content
0.4838

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1313.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1388.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1071.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004454.3 NCBI
AGAGUCCAGCCGCUGGUGCGCGGAGCGGUUCACCGUCUUCGGAGCGGUU… 4082 nt 0.4838
Summary

Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Involved in cellular response to oxidative stress; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025] CIViC Summary for ETV5 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly downregulated the transcription factor ETV5 in astrocytes, microglia, and oligodendrocytes within the cortical brain regions, as revealed by single-cell RNA sequencing analysis [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].