Basic Information

Symbol
ABCB4
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily B Member 4 PFIC-3 MDR2 GBD1 MDR3 PGY3 ATP-Binding Cassette, Sub-Family B (MDR/TAP), Member 4 ATP-Binding Cassette Sub-Family B Member 4 Phosphatidylcholine Translocator ABCB4 Multidrug Resistance Protein 3 P-Glycoprotein 3 P-Glycoprotein-3/Multiple Drug Resistance-3 Multiple Drug Resistance 3 EC 3.6.3.44 EC 7.6.2.1 EC 3.6.3 MDR2/3 ABC21 ICP3
Location (GRCh38)
7:87401696-87480435
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Cause of death analysis Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000443.4
Sequence length
4293.0 nt
GC content
0.4442

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1274.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1359.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1018.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000443.4 NCBI
AGCGCCCGCGCGUCCAGAGGCCCUGCCAGACACGCGCGAGGUUCGAGGC… 4293 nt 0.4442
NM_018849.3 NCBI
AGCGCCCGCGCGUCCAGAGGCCCUGCCAGACACGCGCGAGGUUCGAGGC… 4314 nt 0.4439
NM_018850.3 NCBI
AGCGCCCGCGCGUCCAGAGGCCCUGCCAGACACGCGCGAGGUUCGAGGC… 4152 nt 0.4468
Summary

The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MDR/TAP subfamily. Members of the MDR/TAP subfamily are involved in multidrug resistance as well as antigen presentation. This gene encodes a full transporter and member of the p-glycoprotein family of membrane proteins with phosphatidylcholine as its substrate. The function of this protein has not yet been determined; however, it may involve transport of phospholipids from liver hepatocytes into bile. Alternative splicing of this gene results in several products of undetermined function. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ABCB4 was upregulated in common in splenocytes at day 7 post-injury following both burn and trauma-hemorrhage, where it was identified as a gene expression marker associated with the immune response [Lederer et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00086.2007]. In a porcine model of alcohol-induced liver fibrosis, the ABCB4 was found to be downregulated in fibrotic livers and is categorized as a transporter involved in chemotherapeutic efflux [Yasmin et al. DOI:10.1016/J.Biochi.2020.12.022]. A study in mice demonstrated that the ABCB4 gene, involved in bile acid secretion, was significantly up-regulated by alcohol in alcoholic liver disease (ALD) mice, and intervention with Gentiana dahurica Fisch ethanol extract (GDEE) further up-regulated its expression [Cao et al. DOI:10.1016/J.Jep.2020.113422].