Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018850.3
Sequence Length
4152 nt
GC Content
0.4468
AGCGCCCGCGCGUCCAGAGGCCCUGCCAGACACGCGCGAGGUUCGAGGCUGAGAUGGAUCUUGAGGCGGCAAAGAACGGAACAGCCUGGCGCCCCACGAGCGCGGAGGGCGACUUUGAACUGGGCAUCAGCAGCAAACAAAAAAGGAAAAAAACGAAGACAGUGAAAAUGAUUGGAGUAUUAACAUUGUUUCGAUACUCCGAUUGGCAGGAUAAAUUGUUUAUGUCGCUGGGUACCAUCAUGGCCAUAGCUCACGGAUCAGGUCUCCCCCUCAUGAUGAUAGUAUUUGGAGAGAUGACUGACAAAUUUGUUGAUACUGCAGGAAACUUCUCCUUUCCAGUGAACUUUUCCUUGUCGCUGCUAAAUCCAGGCAAAAUUCUGGAAGAAGAAAUGACUAGAUAUGCAUAUUACUACUCAGGAUUGGGUGCUGGAGUUCUUGUUGCUGCCUAUAUACAAGUUUCAUUUUGGACUUUGGCAGCUGGUCGACAGAUCAGGAAAAUUAGGCAGAAGUUUUUUCAUGCUAUUCUACGACAGGAAAUAGGAUGGUUUGACAUCAACGACACCACUGAACUCAAUACGCGGCUAACAGAUGACAUCUCCAAAAUCAGUGAAGGAAUUGGUGACAAGGUUGGAAUGUUCUUUCAAGCAGUAGCCACGUUUUUUGCAGGAUUCAUAGUGGGAUUCAUCAGAGGAUGGAAGCUCACCCUUGUGAUAAUGGCCAUCAGCCCUAUUCUAGGACUCUCUGCAGCCGUUUGGGCAAAGAUACUCUCGGCAUUUAGUGACAAAGAACUAGCUGCUUAUGCAAAAGCAGGCGCCGUGGCAGAAGAGGCUCUGGGGGCCAUCAGGACUGUGAUAGCUUUCGGGGGCCAGAACAAAGAGCUGGAAAGGUAUCAGAAACAUUUAGAAAAUGCCAAAGAGAUUGGAAUUAAAAAAGCUAUUUCAGCAAACAUUUCCAUGGGUAUUGCCUUCCUGUUAAUAUAUGCAUCAUAUGCACUGGCCUUCUGGUAUGGAUCCACUCUAGUCAUAUCAAAAGAAUAUACUAUUGGAAAUGCAAUGACAGUUUUUUUUUCAAUCCUAAUUGGAGCUUUCAGUGUUGGCCAGGCUGCCCCAUGUAUUGAUGCUUUUGCCAAUGCAAGAGGAGCAGCAUAUGUGAUCUUUGAUAUUAUUGAUAAUAAUCCUAAAAUUGACAGUUUUUCAGAGAGAGGACACAAACCAGACAGCAUCAAAGGGAAUUUGGAGUUCAAUGAUGUUCACUUUUCUUACCCUUCUCGAGCUAACGUCAAGAUCUUGAAGGGCCUCAACCUGAAGGUGCAGAGUGGGCAGACGGUGGCCCUGGUUGGAAGUAGUGGCUGUGGGAAGAGCACAACGGUCCAGCUGAUACAGAGGCUCUAUGACCCUGAUGAGGGCACAAUUAACAUUGAUGGGCAGGAUAUUAGGAACUUUAAUGUAAACUAUCUGAGGGAAAUCAUUGGUGUGGUGAGUCAGGAGCCGGUGCUGUUUUCCACCACAAUUGCUGAAAAUAUUUGUUAUGGCCGUGGAAAUGUAACCAUGGAUGAGAUAAAGAAAGCUGUCAAAGAGGCCAACGCCUAUGAGUUUAUCAUGAAAUUACCACAGAAAUUUGACACCCUGGUUGGAGAGAGAGGGGCCCAGCUGAGUGGUGGGCAGAAGCAGAGGAUCGCCAUUGCACGUGCCCUGGUUCGCAACCCCAAGAUCCUUCUGCUGGAUGAGGCCACGUCAGCAUUGGACACAGAAAGUGAAGCUGAGGUACAGGCAGCUCUGGAUAAGGCCAGAGAAGGCCGGACCACCAUUGUGAUAGCACACCGACUGUCUACGGUCCGAAAUGCAGAUGUCAUCGCUGGGUUUGAGGAUGGAGUAAUUGUGGAGCAAGGAAGCCACAGCGAACUGAUGAAGAAGGAAGGGGUGUACUUCAAACUUGUCAACAUGCAGACAUCAGGAAGCCAGAUCCAGUCAGAAGAAUUUGAACUAAAUGAUGAAAAGGCUGCCACUAGAAUGGCCCCAAAUGGCUGGAAAUCUCGCCUAUUUAGGCAUUCUACUCAGAAAAACCUUAAAAAUUCACAAAUGUGUCAGAAGAGCCUUGAUGUGGAAACCGAUGGACUUGAAGCAAAUGUGCCACCAGUGUCCUUUCUGAAGGUCCUGAAACUGAAUAAAACAGAAUGGCCCUACUUUGUCGUGGGAACAGUAUGUGCCAUUGCCAAUGGGGGGCUUCAGCCGGCAUUUUCAGUCAUAUUCUCAGAGAUCAUAGCGAUUUUUGGACCAGGCGAUGAUGCAGUGAAGCAGCAGAAGUGCAACAUAUUCUCUUUGAUUUUCUUAUUUCUGGGAAUUAUUUCUUUUUUUACUUUCUUCCUUCAGGGUUUCACGUUUGGGAAAGCUGGCGAGAUCCUCACCAGAAGACUGCGGUCAAUGGCUUUUAAAGCAAUGCUAAGACAGGACAUGAGCUGGUUUGAUGACCAUAAAAACAGUACUGGUGCACUUUCUACAAGACUUGCCACAGAUGCUGCCCAAGUCCAAGGAGCCACAGGAACCAGGUUGGCUUUAAUUGCACAGAAUAUAGCUAACCUUGGAACUGGUAUUAUCAUAUCAUUUAUCUACGGUUGGCAGUUAACCCUAUUGCUAUUAGCAGUUGUUCCAAUUAUUGCUGUGUCAGGAAUUGUUGAAAUGAAAUUGUUGGCUGGAAAUGCCAAAAGAGAUAAAAAAGAACUGGAAGCUGCUGGAAAGAUUGCAACAGAGGCAAUAGAAAAUAUUAGGACAGUUGUGUCUUUGACCCAGGAAAGAAAAUUUGAAUCAAUGUAUGUUGAAAAAUUGUAUGGACCUUACAGGGUGUUUUCUGCAAUUGUAUUUGGUGCAGUGGCUCUAGGACAUGCCAGUUCAUUUGCUCCAGACUAUGCUAAAGCUAAGCUGUCUGCAGCCCACUUAUUCAUGCUGUUUGAAAGACAACCUCUGAUUGACAGCUACAGUGAAGAGGGGCUGAAGCCUGAUAAAUUUGAAGGAAAUAUAACAUUUAAUGAAGUCGUGUUCAACUAUCCCACCCGAGCAAACGUGCCAGUGCUUCAGGGGCUGAGCCUGGAGGUGAAGAAAGGCCAGACACUAGCCCUGGUGGGCAGCAGUGGCUGUGGGAAGAGCACGGUGGUCCAGCUCCUGGAGCGGUUCUACGACCCCUUGGCGGGGACAGUGCUUCUCGAUGGUCAAGAAGCAAAGAAACUCAAUGUCCAGUGGCUCAGAGCUCAACUCGGAAUCGUGUCUCAGGAGCCUAUCCUAUUUGACUGCAGCAUUGCCGAGAAUAUUGCCUAUGGAGACAACAGCCGGGUUGUAUCACAGGAUGAAAUUGUGAGUGCAGCCAAAGCUGCCAACAUACAUCCUUUCAUCGAGACGUUACCCCACAAAUAUGAAACAAGAGUGGGAGAUAAGGGGACUCAGCUCUCAGGAGGUCAAAAACAGAGGAUUGCUAUUGCCCGAGCCCUCAUCAGACAACCUCAAAUCCUCCUGUUGGAUGAAGCUACAUCAGCUCUGGAUACUGAAAGUGAAAAGGUUGUCCAAGAAGCCCUGGACAAAGCCAGAGAAGGCCGCACCUGCAUUGUGAUUGCUCACCGCCUGUCCACCAUCCAGAAUGCAGACUUAAUAGUGGUGUUUCAGAAUGGGAGAGUCAAGGAGCAUGGCACGCAUCAGCAGCUGCUGGCACAGAAAGGCAUCUAUUUUUCAAUGGUCAGUGUCCAGGCUGGGACACAGAACUUAUGAACUUUUGCUACAGUAUAUUUUAAAAAUAAAUUCAAAUUAUUCUACCAUUUUAUCUGACUUGUAAAAUAAGUUUCUGGUUUGUCAUCAUAAAACAUAGGUAUGUCUGUCUCAUUCUAGAUCAAUUUAGAAGACCCAAUUUGGGGUUUAUUACGGCAUUUGAAAUUUGAGAGUUAGAAGUGACACCUGUCUUGAUGAAGUAUUGAAACAACAGGCUAGCUCUCCCUAAGUUAUUAGAAACAUCCAGAAAAAGAACAAAAUUCAAGGUAAGUACAGGUGUAGAAAUAUAGAAGCCACAGACAUAGGGAAAUGGUCUUAUGGUCCUGAAUGGGUUGGGUAGACAGGAAAGUUUGGGAAUAAUUUUCCCAAGUACAAAAGAAAAAUAAAUUGUUCAAUAGCCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1238.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1319.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 1050.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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