Basic Information

Symbol
AK3
RNA class
mRNA
Alias
Adenylate Kinase 3 GTP:AMP Phosphotransferase AK3, Mitochondrial AKL3L1 AK3L1 AK6 Adenylate Kinase 3 Alpha-Like 1 Adenylate Kinase Isozyme 3 EC 2.7.4.10 AKL3L Adenylate Kinase 6, Adenylate Kinase 3 Like 1 GTP:AMP Phosphotransferase, Mitochondrial Adenylate Kinase 3 Like 1 Adenylate Kinase 6 EC 2.7.4 FIX
Location (GRCh38)
9:4709556-4742043
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016282.4
Sequence length
4219.0 nt
GC content
0.4020

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1283.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1365.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1042.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199852.2 NCBI
AGUAGCCGCCUGCUAGUGGCGCUGCUAGCCGGCCGGCGCAGGCUGCCGA… 4099 nt 0.3996
NM_001199853.2 NCBI
ACACACUCUUUUACGUUAUUUAUAAAAGAGUCUCACUCAAUGGAAGCUG… 4025 nt 0.3801
NM_001199855.2 NCBI
GAGUGGGCGCCAGGUGGAGGUGGGGCCAGGGUUGUCAAGGGAGCACGAA… 4032 nt 0.3864
NM_001199856.2 NCBI
CCUCAUCAUUUAGCAACCUCCAUCCUGAUCAGUCAGCAGCCAUCAGCCA… 4098 nt 0.3809
NM_016282.4 NCBI
AGUAGCCGCCUGCUAGUGGCGCUGCUAGCCGGCCGGCGCAGGCUGCCGA… 4219 nt 0.4020
Summary

The protein encoded by this gene is a GTP:ATP phosphotransferase that is found in the mitochondrial matrix. Several transcript variants encoding a few different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that adenylate kinase 3α (Ak3) was commonly down-regulated in liver tissue following in vivo irradiation of Kupffer or endothelial cells with α-particles, showing less than half the expression compared to non-irradiated controls [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].