Basic Information

Symbol
AKR1C2
RNA class
mRNA
Alias
Aldo-Keto Reductase Family 1 Member C2 DD2 HAKRD MCDR2 BABP DDH2 DD Dihydrodiol Dehydrogenase 2; Bile Acid Binding Protein; 3-Alpha Hydroxysteroid Dehydrogenase, Type III Testicular 17,20-Desmolase Deficiency Chlordecone Reductase Homolog HAKRD 3-Alpha-HSD3 DD/BABP DD-2 TDD Aldo-Keto Reductase Family 1, Member C2 (Dihydrodiol Dehydrogenase 2; Bile Acid Binding Protein; 3-Alpha Hydroxysteroid Dehydrogenase, Type III) Dihydrodiol Dehydrogenase/Bile Acid-Binding Protein Trans-1,2-Dihydrobenzene-1,2-Diol Dehydrogenase Type III 3-Alpha-Hydroxysteroid Dehydrogenase Type II Dihydrodiol Dehydrogenase Pseudo-Chlordecone Reductase Dihydrodiol Dehydrogenase 2 AKR1C-Pseudo EC 1.1.1.112 EC 1.1.1.209 EC 1.1.1.357 EC 1.1.1.53 EC 1.1.1.62 EC 1.3.1.20 EC 1.-.-.- EC 1.1.1 SRXY8 HBAB
Location (GRCh38)
10:4987775-5018031
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001393392.1
Sequence length
3215.0 nt
GC content
0.4109

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-907.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -964.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 745.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135241.3 NCBI
GCUAACCAGGCCAGUGACAGAAAUGGAUUCGAAAUACCAGUGUGUGAAG… 941 nt 0.4230
NM_001321027.2 NCBI
GCUAACCAGGCCAGUGACAGAAAUGGAUUCGAAAUACCAGUGUGUGAAG… 3137 nt 0.4103
NM_001354.6 NCBI
GAAAGUGUGUAGCACCUCCACCUUCUCUCUCUCUCUCCCUCUCCCUCUC… 3573 nt 0.4153
NM_001393392.1 NCBI
GCUAACCAGGCCAGUGACAGAAAUGGAUUCGAAAUACCAGUGUGUGAAG… 3215 nt 0.4109
NM_205845.3 NCBI
GAAAGUGUGUAGCACCUCCACCUUCUCUCUCUCUCUCCCUCUCCCUCUC… 3473 nt 0.4172
Summary

This gene encodes a member of the aldo/keto reductase superfamily, which consists of more than 40 known enzymes and proteins. These enzymes catalyze the conversion of aldehydes and ketones to their corresponding alcohols using NADH and/or NADPH as cofactors. The enzymes display overlapping but distinct substrate specificity. This enzyme binds bile acid with high affinity, and shows minimal 3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase activity. This gene shares high sequence identity with three other gene members and is clustered with those three genes at chromosome 10p15-p14. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in healthy young women using a monozygotic twin design demonstrated that mRNA expression of the AKR1C2 gene in isolated adipocytes was significantly higher in heavier co-twins compared to their leaner sisters [Vihma et al. DOI:10.1016/j.steroids.2018.08.006]. In a separate human intervention study, the AKR1C2 gene was found to be downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term weight loss [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].