Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001354.6
Sequence Length
3573 nt
GC Content
0.4153
GAAAGUGUGUAGCACCUCCACCUUCUCUCUCUCUCUCCCUCUCCCUCUCCUGCCAGCCAAGUGAAGACAUGCUUACUUCCCCUUCACCUUCCUUCAUGAUGUUACCAUUGGAAUGACAUACUGCAUCCUAUAGUUAUACCAUCCACUCUGAAAUCAAUGUGAAUUUAACUUCAGUUCCAUACAGAAACUUCUUUUCCACAGGUAAGAAACGGUUGAACUGGAUGCAAUUUUUAUCACAGCUUGUGUAAGACUGCCUCUGUCCCUCCUCUCACAUGCCAUUGGUUAACCAGCAGACAGUGUGCUCAGGGGCGUUGCCAGCUCAUUGCUCUUAUAGCCUGUGAGGGAGGAAGAAACAUUUGCUAACCAGGCCAGUGACAGAAAUGGAUUCGAAAUACCAGUGUGUGAAGCUGAAUGAUGGUCACUUCAUGCCUGUCCUGGGAUUUGGCACCUAUGCGCCUGCAGAGGUUCCUAAAAGUAAAGCUCUAGAGGCCGUCAAAUUGGCAAUAGAAGCCGGGUUCCACCAUAUUGAUUCUGCACAUGUUUACAAUAAUGAGGAGCAGGUUGGACUGGCCAUCCGAAGCAAGAUUGCAGAUGGCAGUGUGAAGAGAGAAGACAUAUUCUACACUUCAAAGCUUUGGAGCAAUUCCCAUCGACCAGAGUUGGUCCGACCAGCCUUGGAAAGGUCACUGAAAAAUCUUCAAUUGGACUAUGUUGACCUCUAUCUUAUUCAUUUUCCAGUGUCUGUAAAGCCAGGUGAGGAAGUGAUCCCAAAAGAUGAAAAUGGAAAAAUACUAUUUGACACAGUGGAUCUCUGUGCCACAUGGGAGGCCAUGGAGAAGUGUAAAGAUGCAGGAUUGGCCAAGUCCAUCGGGGUGUCCAACUUCAACCACAGGCUGCUGGAGAUGAUCCUCAACAAGCCAGGGCUCAAGUACAAGCCUGUCUGCAACCAGGUGGAAUGUCAUCCUUACUUCAACCAGAGAAAACUGCUGGAUUUCUGCAAGUCAAAAGACAUUGUUCUGGUUGCCUAUAGUGCUCUGGGAUCCCAUCGAGAAGAACCAUGGGUGGACCCGAACUCCCCGGUGCUCUUGGAGGACCCAGUCCUUUGUGCCUUGGCAAAAAAGCACAAGCGAACCCCAGCCCUGAUUGCCCUGCGCUACCAGCUGCAGCGUGGGGUUGUGGUCCUGGCCAAGAGCUACAAUGAGCAGCGCAUCAGACAGAACGUGCAGGUGUUUGAAUUCCAGUUGACUUCAGAGGAGAUGAAAGCCAUAGAUGGCCUAAACAGAAAUGUGCGAUAUUUGACCCUUGAUAUUUUUGCUGGCCCCCCUAAUUAUCCAUUUUCUGAUGAAUAUUAACAUGGAGGGCAUUGCAUGAGGUCUGCCAGAAGGCCCUGCGUGUGGAUGGUGACACAGAGGAUGGCUCUAUGCUGGUGACUGGACACAUCGCCUCUGGUUAAAUCUCUCCUGCUUGGCGACUUCAGUAAGCUACAGCUAAGCCCAUCGGCCGGAAAAGAAAGACAAUAAUUUUGUUUUUCAUUUUGAAAAAAUUAAAUGCUCUCUCCUAAAGAUUCUUCACCUACUUUGGUCUCCAUAACUUCUAUGUUUUCUCUCCUUCUGACACACUAGUGCCCCCAAAUUGUGAUUUGCCUAUACGUUUAGGGCCGGGGUUGGAAGAUGUUAACAACCAUUUAAGAUUCAUUUCUGCAGUGGGAGUGGGUGGAGUUUCACCCUCUGGGAAAGGGGCAGGUGACAGGUAUUUAUCAGUCAGUGCCUCUCUAGCUCUUGUAGGAAGAAGCACACGCAGGAUGGAGUCUAGAGGAUGAGCGAUAUUGACUAGCAAUUCAUGGGCUCCCUCCAGCAGUGCGAGGGUCAGAGUUUCUGGAGCCUUGGGAGGAGGCAUCCCUGUGAGGGGGGGUUAGGGAGAUGGGAGGGCACCAGGAAAAGUGAUUAGAAGUCAGGUAUGGGAAGGCUAAAUAGGACAGAGUCGAGUACAUCUCUGCUUGGAAAAACAUAUCAACACCCUUUUUUUUGAUCAUUAUAUCUUGUUCAUAAAAGAAAACUUUCCACAUUGUUUUAACAAACCCCACAGCUGAGAGUCAGGCCUGAAUCUUUGAUGUGUGCCCAUUCACAACGUUGACCCUAUUGGUUUGUGGUGGGGCAGGACAUCGAAGAUAUCAUUGACUCAUCACAUUCCCCUGAAUAGCUCAUAUUUAGAAAAUAUUCUUAGAUUGUAAAAAUGUACUGUUCAUUUGUUAUAUGCAAUCUUUUAAAUGUUUUAUACUUUAAACAAGGCAUAGUUACAAGUAUAAAACAUAAAUAUCCCAAAGCCAUUAUGCAUGGCACUCAAGAUUAAAAUGGGAAAUAAUACAUCUAAUAAAUCAAAUGUUCCAAGACUUCAAAUGUCUUUUGGAAACAGGCUAUGUAAAACAGCACACUGGUUUCAAACUUUGGUAAAUUUUAAGAAGAACUCUUACAAAGGCAUUUAAUUCUUAUACAUAAUUUUCAGGGGAACUAAUCAAAUCAGCUAAUCAUGAAGACAUGAUUUUCGUUUUAGAAAACACUUUUGAAAACUUGGGAUAAUCUCAUGUCUUAAUGAUCAAAGCAUUAUGAGAAGGACAGUGGUUUUUUACCUGGGCACACUUUCUAACACAUUUACUCUCCACUAUUCGUACUCUGGUAGCCAUGUUAACCCCAUCAGAGAUUCCUUCUCAAGCCAUGUCUCAGAGCUGAUAGGCAUCCCAGCAAGUUUUGCAGCUCACAAUUUUUCUGUAAAUUACUUAUUCUAUAAAAUUGGAAGAGGCCAUAAACUUUGGAGGGCCCUAGACCAAUUUUUUGGAUUAUUUCUGGUCUACUCUCAUUCCGUUGAUGAUCUUAGAUAUUCUCUGCAUUAAAUAUCACCUCUAGGCUGAGAAAUCCACCAAAAAAUAUUUCUAGCUCAGCGUUUUCCUCCAAAUCUUCAAUGGAAGAUCAUAAUGUGAACUCUGCAUCUCCAUGUUAAAGUUUAAUGGACAUUCACACUUAGCAUGUCUCAAAGAAAUCUCAUGUAAACCAUGGCCAUCCUGUUCUACCUUAACUUUCUGAGUCUAUGGAAUGAUAAUUUCACAUCUCAUAAACUUGACUGAUGUAAGUGUCAAGAAAAGAUUGACAUUUUGUUAAAACUUCGUAGCCAAGUGUGUAACGCUUAAGCAGACUUUCAUAUUUCAAAUCUCUAUAGCACGUGUAACUCUUUUUUCAAGAUGUGAAAUAAUCAUUAGGUCAGUCAUUUGUAAAUAGUACGGCUGCUGUGGGCUUUUUCCAGUUCUUCACCAUCCAUUUUUAUAAAACUCUUAUUGUUAAAAAAAAAAAGUUACUCAGAAUUUCAUAAAGCCAAACACCUGAUUUCAGGAACACUUGAGAUGUAAGAAAAUUUUAUAGGGACCUCCAAUCACUAAUUUUCCUAUUUUUUCUCUCAAAGAAAUGCUGAAGGGAGGAAUUCAGGUUGAAUGAAAGGAAAUAGUAACUUACAGCCAUAUAGAGUUAUAAAGACUUCUUGUAAAUGUGAACAUAUGGUAAAAUAUAAAAACAUGUAUUUUUGAAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1004.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1071.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 771.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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