Basic Information

Symbol
AKT1S1
RNA class
mRNA
Alias
AKT1 Substrate 1 PRAS40 Lobe 40 KDa Proline-Rich AKT Substrate Proline-Rich AKT1 Substrate 1 MGC2865 Proline-Rich Akt Substrate, 40 KDa AKT1 Substrate 1 (Proline-Rich) AKT1 Substrate 1 (Proline Rich)
Location (GRCh38)
19:49869033-49879470
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001098633.4
Sequence length
1775.0 nt
GC content
0.6411

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-767.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -796.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 572.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098632.2 NCBI
AUAUUGUAUACUGGAAUUGAAGCCAAGGAGGUACCAUUUUGCUCGAGGG… 2025 nt 0.6296
NM_001098633.4 NCBI
ACCAUUUUGCUCGAGGGCAUGGCCUAAGCCGGUCAGCUAAGGCCAUGUU… 1775 nt 0.6411
NM_001278159.2 NCBI
AUUUCCUGUUUUCUUCCUAGACCAGUGGGUCCUCCCUGGACCCCGGGCG… 2032 nt 0.6329
NM_001278160.2 NCBI
CUUCUUCAGGUCCCACUGCUGACCGCCAGACCAAACUCCUACAGCUGCC… 1843 nt 0.6435
NM_032375.5 NCBI
AUAUUGUAUACUGGAAUUGAAGCCAAGGAGGUACCAUUUUGCUCGAGGG… 2447 nt 0.6212
Summary

AKT1S1 is a proline-rich substrate of AKT (MIM 164730) that binds 14-3-3 protein (see YWHAH, MIM 113508) when phosphorylated (Kovacina et al., 2003 [PubMed 12524439]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

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