Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032375.5
Sequence Length
2447 nt
GC Content
0.6212
AUAUUGUAUACUGGAAUUGAAGCCAAGGAGGUACCAUUUUGCUCGAGGGCAUGGCCUAAGCCGGUCAGCUAAGGCCAUGUUAAUACGGGGCUGUCCCAUCUCUCUGCGGGGCGCGACAGCUGGAAGAGCCGAACGGAUAAGAGAAGAGGAGGUGAGAGGAGCUGUACACCACAAGAGGCACUGAGGGACUCAGGAUAACGGGAUGAAGCCGUCAGUGCCCCCAGAAACGAAGCGGCCCCGGACGAAUUUCUGAGUCACCGUCGCGAGAAAGCGGGCUGAGCCGCCAUUUUGAAGCCUGGCAAACCGAAGCAAGAAAUGCUGCCGUGUUGGAUCUUUGCCAGCCUUCGUGCCGAAUGGGAGCAGGUUGGAGGGAGGGAGAGCCAAUAUACACUAUGGGCUGAUUAAGCCCGGUUGGCUGCCAUGUUGUUAACGAGCACCGAUUUCCUCUACUUUUGUCGAAGAAGUUUAUUGUGGGUCAGGGACGUCAGGUCGCUUGCCUUCGUUUACUGUGGUCAUGAUUGAGCAUAUGAGGACGGCCAUUAUUGUUGGGGGCAAAUGGAAAUGCUCUAGGCGGGGCCAUUUUUCUUAGGGGCAAGCUGUCGUCACCCUUGUCAACUGGUUCGGAUGAAGCCCCUGUGGCCGCCAUCUUGAUCUCGGGCGGCCCCGAUAAGGGAGGCGGAGUGUGCGGAGAGGAGGCGGGGCAACUGCGCGGACGUGACGCAAGGCGCCGCCAUGUCUUUUGAGGGCGGUGACGGCGCCGGGCCGGCCAUGCUGGCUACGGGCACGGCGCGGAUGGCGUCGGGGCGCCCCGAGGAGCUGUGGGAGGCCGUGGUGGGGGCCGCUGAGCGCUUCCGGGCCCGGACUGGCACGGAGCUGGUGCUGCUGACCGCGGCCCCGCCGCCACCACCCCGCCCGGGCCCCUGUGCCUAUGCUGCCCAUGGUCGAGGAGCCCUGGCGGAGGCAGCGCGCCGUUGCCUCCACGACAUCGCACUGGCCCACAGGGCUGCCACUGCUGCUCGGCCUCCUGCGCCCCCACCAGCACCACAGCCACCCAGUCCCACACCCAGCCCACCCCGGCCUACCCUGGCCAGAGAGGACAACGAGGAGGACGAGGAUGAGCCCACAGAGACAGAGACCUCCGGGGAGCAGCUGGGCAUUAGUGAUAAUGGAGGGCUCUUUGUGAUGGAUGAGGACGCCACCCUCCAGGACCUUCCCCCCUUCUGUGAGUCAGACCCCGAGAGUACAGAUGAUGGCAGCCUGAGCGAGGAGACCCCCGCCGGCCCCCCCACCUGCUCAGUGCCCCCAGCCUCAGCCCUACCCACACAGCAGUACGCCAAGUCCCUGCCUGUGUCUGUGCCCGUCUGGGGCUUCAAGGAGAAGAGGACAGAGGCGCGGUCAUCAGAUGAGGAGAAUGGGCCGCCCUCUUCGCCCGACCUGGACCGCAUCGCGGCGAGCAUGCGCGCGCUGGUGCUGCGAGAGGCCGAGGACACCCAGGUCUUCGGGGACCUGCCACGGCCGCGGCUUAACACCAGCGACUUCCAGAAGCUGAAGCGGAAAUAUUGAAGUCCAGGGAGGGAGCGCCCCGGGCCGCGUCCGCCCCGUCCCACACUACGCCCCCGCCCCACUCCCGGGGCCUGCUAAUCUGAGGCCGAUCCGGGACCGGCCUCCUUGCGUCUCCCAUUCCCAAGAUUGUCCCGCCUCUGCCAAUCCCCGCCGUCCUUCCAGCCCACGACCUGCCGCGCCGAGGAGCGGCAUCUGUCCCGUUUCCCGAUUGGGUCUGUCGUCUCUCUCCGCCUAGCGACAGAUUCCUUCUAUUAAGGGAUUGGCUCGCUGAGUUCUAAGCUCUAAAUGGGUCAACUCCUUUGUUUUCCGCCUAGCGACAAGGGAUUUGCUCGCACGGCAUUGGCUCCAUCCCCUAGUCGCUGGACAGCUCUUUUUUUGAUUGGCUCAAAUCCUGUAAAGGGCUUGACCAGUCUCUACAUAGUCACCGUCCGCUUUUCCUGAGUUCUCCCUCCCAAUUGGCUCCAGCUUCCUGGGGGCGUGGCCAAGCCCUCCUCUUCCCAGAAUUGGCCCGGGGCCUUCAAUUUACGUUCUUUACACUACGGGGACUGGGGUCGUCUUUGCCCACGUCCCGACAACUUGUUCCCUGACCCCCUCAGGGAUGGCCCCAAACUGUCCCUGCCUCUGGCACCCCCUUUCAUUGGUUCCAUCCAUCCCCACAACAGCCUGCCAAUCGAAGCCCGUCCCUGCAUCCAGGAUGGUACCAGCUCCCGCCCCUCGCCCCCCACCUCCACAGGUGCCUUAAAGGGCCCUCGUCCACCCAAGGUGGGGGGCAGGGGCCCUCACUCUCCGGCCCUGGUGUGGGGGAGAGAGUGAGGGGUUGGGGGAUCGGCAGUUGGGAGGGGCGCUCUGAGAUUAAAGAGUUUUACCUCUGAGAUAAAUGUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1050.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1093.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 497.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((....(((....)))...)))).(((((..((((((((((((((((.(((......))).)))))))))......(((((((((((.((((((((...(((.(..(.....)..).)))...))))...)))).((((.(((.((.((((((((.....)))...((((((((.((..(((...........)))..)).)))))))).........(((..((((((((.(.((((.(((..........((......))(((((..(((((......((((.((((((((((((((((.....))))......))))...)))))))).))))..(((....((((((.((((((.((((((((((((((...........(((((.....)))))((.(((..((((((((((...((((((..((((((.((.((....)).)).))))))....(.((((.((.(((.....))).)).)))).)......((((.(((....))).))))(((.((((((.....((.(((((((.((((((...((((...))))...))))))))))))).))...)))))).)))((((((((..((((..((((............(((((((............)))))))(((((..(((((((((.(((.(((((.(((((((((((((...(((.(((((.(((((((((.((((..........((.((((((.(..((((...(((((((...)))))))..(((.((((.(((((((((.(((((((((...((((.((((((((.(((.(.(((((((((.((((((((.....(((((.(((((((...((...((((((((.((...(((((...))))).........(((.((((.(((..(((.(((.....))))))..))).)))).)))((((((((((...)))))))))).......((((..((((....((((.((....)).))))))))...))))....)).))))))))...))..)))))))(((.((((((...((((((((......))))..............(((((.(.......................).)))))))))....)))))).....))).....((..((((((((((.....))))))).)))..))..((((..((.((.....((((((..((.........)).))))))....)).)))))).(((.((....)).))).))))).......))))))))))))))).)).).)))...)))))).........(((...(((((..(((((.(((((((..((((...((((.....))))....))))))))))).)).)))...))).))...))).))))))....(((..((((((((((((.((.....)))))))..((((((((..((....(((((.((.....(((((((....))))))))).)))))...))....))))))))..((((....((....))))))........)))))))..))).))))))))))))..)))))).)))))))......))))))))))))).(((((((((((.(......))))))...)))))).))))..))))))))).)..............)))))))...))).....)))))).))))))).)).)))(((.((((((........))))))...)))))))))))).)))))(((((((((.............))))))))).........(((((((((((((((..(((((...)))))....)))))))).)))))))...)))).)))).))))))))...)))))).)))))).)))).))).)).......((.((((....((......((((((.((((.((((....)))).)))))))))).......)).....))))))......)).))))))))))))..))))))...))))))....))))))))..))))).........))))))).).)))))))))))......(((..........)))(((((((((..........)))).)))))........))))))).))).)))).))))))))))).....((((((.((.(((.(.(((((((((((((((.......................)))))).)))).((((((.((....))))))))...........((((((.(((((((((((..(((((.((((....))))))).)).......)))))))))))))))))((((((((((...(((......)))...))))))))))....)))))...).)))..)).))))))(((((........)))))....)))).)))..)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,,,{.{({{........})},...,)))}(((((..((((((((((((((((.(((......))).)))))))))......(((((((((((.((((((((...(((.(..,........}.)))...)))}..,)))).((((.(((.((.(((((,((.....,,..{.((((((((.((..(((...........)))..)).)))))))).........({{..((((((((.(.(({(((((.,........{{,,,...|}(((((..(((((.....,((((.((((((((((((((((.....})))......))))...)))))))).))))}.{((....((((((.(({(((,((((((((((((((...........(((((.....)))))((.(((..((((((((((...((((((..((((((.((.((....)).)).))))))...{(,((((.(({(((,....}}}.}}.)))).}},,...((((.(((....))).)))),((,((((((.....{{,(({((((,({{{((...{{{|,..}))),,,))}}}}}}}}}}},}}|},))}}||,||,((((((((..{,((,.({{,.||||},...{.(((((((............))))))),|}||,,|||{||||{.{{(.({(({{{((((((((((((..,{{(.(((,{.(((((((((,((((.,,.,,,...,|.||||{{.|.,{{||,,.(((((((...)))))))..(((.((((.(((((((((.((((((((((((,.({.(((((((..,((..((((((((((.((..{((((....((((((((.{.((...((.({,((,({{((.....})))).,,))))),.},..,}.).))))))))..)}))}}..)).((....(((((((.(((..((((((((((((((...)))))))))).{{....}}....(((((...)))))))))..))).)))))))....)))))))))))))).))))}))|,|(,.((((..{.....,,({.{.(.((((......)))).).}.)).,.....},.))))..}}.||.,|||.,,{{,.......,))).((((.(({,(((((((...(((....(((((((((((((((.....))))))).)}..,))))))((,...,})...{.((((({..((.,....,..}}.)))))).}..((..(((.{.(((.((....}),)))})))..)).))).)))))))))))))){((((({(,,.{{(..(((((((((.((.....))..)))}})))))..)))...}.)))))))).,..{{.(((((((...{.(((.((.((.((......}).)).)).))),,))))))).|),..((((((((((((.((.....)))))))..((((((((,{((....(((((.((.....(((((((....))))))))).))))),),))....}))))))).|((((....,|.,..)}))},........)))))))..))).))))))))))))..)))))).)))))))......})))}))))))}..{((((((((((.{......|)))))...)))))).)))),,))))))))).,....,},,.,),,}))))))),,,)}},...}}))))),)))))}}.)),)))|{{.((((((.,....,.))))))...}||||}}}}}}}{{..(((((((((((.............)))))))))))..))....{{||||{(((((((..(((({...}))))....)))))))}.||||||||,.,}||,},,),)))))))),..)))))).)))))),}))).))).)).......((.((((.(,,{{......((((((.((((.((((....)))).)))))))))).......)).....))))))......)).))))))))))))..}},}})}}.))))))..,,))))))))..))))).,.,.,,..))))))).).)))))))),}}......{((..........}))(((((,{(({........}))),.)))))........))))))).))).)))).))))))))))).....((((((.((.(((.(.(((((.,({{(((((..,..,,................}}}}}}.}}}|,((((,,,{{....})))))))..,,,},....((((((.(((((((((((..(((((.((((....))))))).)).......)))))))))))))))))((((((((((...(((,.....))),,.))))))))))},..)))))...).)))..)).))))))(((((........)))))....)))).)))..)))))....
Back