Basic Information

Symbol
ABCB8
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily B Member 8 MITOSUR M-ABC1 MABC1 EST328128 ATP-Binding Cassette Sub-Family B Member 8, Mitochondrial ATP-Binding Cassette, Sub-Family B (MDR/TAP), Member 8 Mitochondrial Potassium Channel ATP-Binding Subunit Mitochondrial ATP-Binding Cassette 1 Mitochondrial Sulfonylurea-Receptor Mitochondrial ABC Protein EC 3.6.3
Location (GRCh38)
7:151028422-151047782
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007188.5
Sequence length
4656.0 nt
GC content
0.6031

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2004.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2079.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1166.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282291.2 NCBI
AUAGAGCCCUCAGUGGGAUGAGGGUGAAACUGCUAUUGCCGGCGGCUCC… 4707 nt 0.6014
NM_001282292.2 NCBI
AUAGAGCCCUCAGUGGGAUGAGGGUGAAACUGCUAUUGCCGGCGGCUCC… 4581 nt 0.6025
NM_001282293.2 NCBI
AUAGAGCCCUCAGUGGGAUGAGGGUGAAACUGCUAUUGCCGGCGGCUCC… 4343 nt 0.5989
NM_007188.5 NCBI
AUAGAGCCCUCAGUGGGAUGAGGGUGAAACUGCUAUUGCCGGCGGCUCC… 4656 nt 0.6031
Summary

This nuclear gene encodes a multi-pass membrane protein that is targeted to the mitochondrial inner membrane. The encoded protein is an ATP-dependent transporter that may mediate the passage of organic and inorganic molecules out of the mitochondria. Loss of function of the related gene in mouse results in a disruption of iron homeostasis between the mitochondria and cytosol. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples from individuals with a known time of death revealed that the ABCB8 shows a decreased expression pattern over time, clustering separately from the main down-regulated gene cluster [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].