Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_007188.5
Sequence Length
4656 nt
GC Content
0.6031
AUAGAGCCCUCAGUGGGAUGAGGGUGAAACUGCUAUUGCCGGCGGCUCCUGUUUUACCGCGUCAGCAUGCUGGUGCAUUUAUUUCGGGUCGGGAUUCGGGGUGGCCCAUUCCCAGGCAGGCUGCUACCGCCCCUCCGCUUCCAGACAUUCUCAGCUGUCAGGUACUCUGAUGGCUACCGCAGCUCCUCCCUCCUCCGGGCCGUGGCCCACCUGCGGUCCCAGCUCUGGGCCCACCUCCCUCGAGCCCCCCUAGCUCCCAGAUGGAGCCCCUCUGCCUGGUGCUGGGUUGGGGGAGCCCUGCUAGGCCCCAUGGUACUGAGUAAGCAUCCCCACCUCUGCCUUGUGGCCCUGUGUGAGGCAGAAGAGGCCCCUCCUGCCAGCUCCACACCCCAUGUCGUGGGGUCUCGCUUUAACUGGAAGCUCUUCUGGCAGUUUCUGCACCCCCACCUGCUGGUCCUGGGGGUAGCCGUCGUGCUGGCCUUGGGUGCGGCACUCGUGAAUGUACAGAUCCCCCUGCUCCUGGGCCAGCUGGUAGAGGUCGUGGCCAAGUACACAAGGGACCACGUAGGGAGUUUCAUGACUGAGUCCCAGAAUCUCAGCACCCACCUGCUUAUCCUCUAUGGUGUCCAGGGACUGCUGACCUUCGGGUACCUGGUGCUGCUGUCCCACGUUGGCGAGCGCAUGGCUGUGGACAUGCGGAGGGCCCUCUUCAGCUCCCUGCUCCGACAAGACAUCACCUUCUUUGACGCCAAUAAGACAGGGCAGCUGGUGAGCCGCUUGACAACUGACGUGCAGGAGUUUAAGUCAUCCUUCAAGCUUGUCAUCUCCCAGGGGCUGCGAAGCUGCACCCAGGUGGCAGGCUGCCUGGUGUCCCUGUCCAUGCUGUCGACACGCCUCACGCUGCUGCUGAUGGUGGCCACACCAGCCCUGAUGGGAGUGGGCACCCUGAUGGGCUCAGGCCUCCGAAAAUUGUCUCGCCAGUGUCAGGAGCAGAUCGCCAGGGCAAUGGGCGUAGCAGACGAGGCCCUGGGCAAUGUGCGGACUGUGCGUGCCUUCGCCAUGGAGCAACGGGAAGAGGAGCGCUAUGGGGCAGAGCUGGAAGCCUGCCGCUGCCGGGCAGAGGAGCUGGGCCGCGGCAUCGCCUUGUUCCAAGGGCUUUCCAACAUCGCCUUCAACUGCAUGGUCUUGGGUACCCUAUUUAUUGGGGGCUCCCUUGUGGCCGGACAGCAGCUGACAGGGGGAGACCUCAUGUCCUUCCUGGUGGCCUCCCAGACAGUGCAAAGGUCCAUGGCCAACCUCUCUGUCCUGUUUGGGCAGGUGGUCCGGGGGCUGAGUGCAGGUGCCCGGGUCUUUGAGUACAUGGCCCUGAACCCCUGCAUCCCACUGUCUGGGGGCUGCUGCGUCCCCAAAGAGCAGCUGCGUGGCUCCGUUACAUUUCAGAACGUCUGCUUCAGCUACCCCUGCCGCCCCGGCUUCGAGGUGCUGAAAGACUUCACCCUGACGCUGCCCCCUGGCAAGAUCGUGGCCCUCGUGGGCCAGUCUGGCGGAGGAAAGACCACCGUGGCUUCCCUGCUGGAGCGCUUCUACGACCCCACGGCAGGCGUGGUGAUGCUGGAUGGGCGGGACCUGCGCACCCUUGACCCCUCCUGGCUCCGGGGCCAGGUUGUCGGCUUCAUCAGCCAGGAGCCCGUCCUGUUUGGGACGACCAUCAUGGAAAACAUCCGCUUUGGGAAGCUGGAAGCUUCCGAUGAAGAGGUGUACACAGCCGCCCGGGAAGCGAAUGCUCACGAGUUCAUCACCAGCUUCCCCGAGGGCUACAACACGGUCGUCGGUGAACGGGGCACUACCCUGUCUGGGGGCCAGAAGCAGCGCCUGGCCAUCGCCCGAGCCCUUAUCAAGCAGCCCACGGUGCUGAUACUGGAUGAAGCUACCAGCGCGCUGGAUGCAGAGUCCGAGCGGGUUGUACAGGAGGCCCUGGACCGGGCCAGUGCAGGCCGCACGGUGCUGGUAAUUGCCCACCGGCUCAGCACUGUCCGUGGGGCCCACUGCAUUGUCGUCAUGGCCGAUGGCCGUGUCUGGGAGGCUGGGACACAUGAAGAGCUCCUGAAGAAAGGCGGGCUAUACGCCGAGCUCAUCCGGAGGCAGGCCCUGGAUGCCCCGAGGACAGCGGCCCCACCGCCCAAAAAGCCAGAAGGCCCCAGGAGCCACCAGCACAAGUCCUGAGAAGGGCCCCCUGAGGUGUGGUCGCUGCCAAGCAUCAGUGUUAGGGCUGGGGCUCAGCCUGGGGGAGCCUACUGGGGACUGAGCCCCCAGGAGGGCCAGCAUGUGGAGAGUCGCUGCGGCUGCUCCUGCUCACAAUAAAGCCGGGGCCGAGCAGCUGGCAGGGGAGGCCAAUCCCUCCCUCCCCUCCCCAGUCCUGCCGGCUGCCUCCCUCCCACCAGAGUCUGCCAGAGUCAUUGGGCUGCAAUGGGCAGAGACAGAGUUCCACGAGACACCUCCACUCUAUUCUCCCUUUGCCCAGACCCCUCCAGACCUCUCAAGAGACGUUCUGGCCAGUCUCCCUGCCCCACCCAGCAGCUUCAAAUUGGCCAGGCCUACAGUAGCUCCAGGGAAUUUUUAAAAAUCAGGGUCUGGAAGUGGGCCUGGGAAUUCAAACCUAGGCUCUUCCCACACCCUUGCUAGGACCUCACUUCCCUAGACUGGCGACUGACUCCCUCUCCUGUGUCCCCACUCCCUCCAUGGGAGAAGGAGCCUAUCCCCUGGCUCACCCCGGGACCCACAGUCCCCAUCUUCCAAACAACCUCCCUCCUUUCUCCCUGCACAGUGAACACAGUCCUGAUUUCUAGAUUUCACCUCCCCUCCCCACCCACAAGGGACACAGGCCUAACAGGGCCCAACACUUGGGUCAGGGUAGGAGGGACGGGGCCACAAUGGCCAGUUCCCACGAGAAGCGCCAGCCUGCCUGGCUGUCUUCCACCGGCCCUGCCCUGUGUGCCUGGCGUCUUUCACCCACUGAGAUUGUGAACCAGCCUCCAUCUACACCAAGAACACCCAGCACUGAAGGAGAUGGGAGGGGCUGAUGCCCACCUGGAGCUCUCUGCUUCCUGCCCACAGUGCUGACGAGUACAGAGCUAAAUGGAGCAGCUACUGCAGAAUCCAGUACAGAAUCGGUCCAGGAGGGUGCGGCUGUGGACAGGCCAGCAUCCCCAGCAGGUUCUGGGAGGCGCACCUUGAAAGGGGAAGGCAGACAUCCUGAGUGAUGGGCGCCUGUGGCCCUGAGACUGUGGAUGAGGGGGCUAGGCUCCAGCUGGCUUCUGAGGGGCCUGGAAAGGCACACAAGUAGGUCCUUGGCUGAACUGGUGCCCCAGCAGGACCUCGUGUCCCUGCACUGCUGCAGAUGCAUCAGCCCUCCCCAUGUUGGUGCCGCUGUCACUUCCUACUGGGAUCCUUCCCCUAUCCAGCCACAUCCAGGCUGUGGGACUACACGGUGCCCUGUUCCCCUGGGCAGGAGAAGAGGUGGUACCUGCAAUGCACCUUCACAGCCAGGCAAGCAUUCUGGAUUUACCCUGUGUAAAGAAGGGUGGUACCCUCUUUCAGGGGUGUGAUACAGUGCAUUGAUGGAGCAGCUGGUGCUGCUGGGAGGCCAGCCUGGAAGAGGCAGCAGUGGCUCAAGUUUGCGUGCAGGAGCCAGAGUGGGACCCACGGGCUCUUGUGGGUGUGGUUUAGAACUAGAUGGUGCUUUGGGGACAAGCCAUCCAAAAACCCCAGGCCCACAUCCACCCUGAUUUGAUAUCCCACUUCCUGACAGAUCAGAGGCUGUGUCUUUAAGCAGUGGAGGUCCAGGAGCAGAGCCUGGGGCUGGUUCACAGCUAAACCCCUCCUUAGGGCAGCCCAGAGUAGGGCCUCAGCUGGCAAGUCCACAAGCCCUGCUGGGGCCCUGCUUGUUGGCCUGACCCCUCCCUCACCAGGCAGCCAGCCAAGGUGGUUCCUGCUUCACCCACUCAGUCAUCAGCCUCAGGCUGCCCAAAAUGCCUCUGACACCAGAUUUAUAUCUUCUGGGCGGCUUCUUUAAAUCCAGCCCUUCACCCGCCCCCUAGAGAAGCAGUGAAACCCCUUGGCUAGUCCAGCUGGAAGAGCUAGACCGCAGGAGCCGCGCCGUCUUCCUAACCUCGCCUCGGCCUUCGCUCCACAGUGGAGAGUGGGAGCCUAGCUGUGCUUGAUGCUGAAUGCCUGUUUUGAGAGUGUGAGUGGGAUCAUCUACAGUAAAUACUUGCAAAGCAUGGCACUGUGGCUCUGGGGAGCUGGUACGCCUGUGCUGUAACCAUGGUACUCAGUCCUUCCAAAGUGUUUAUUAAUCAAGCACCUGUCAUGUGCCAUUGAGCCCACGAUGGGGAAUGAGGACAGUCCCUGCCCCCAUGAAGCUUGUGUCCUGUUGGGAGGACAGACAGGUGGCCCAGCAGUUGCAGCAUGGUGUGUGCACACGUUUGGCUGGUGGAACCAUGUUUCUACCACUCAUGGUCAAAAAAAGCCCACCAAAGUCCUGGGAGUUCACAUCUGUGUGAUGAUACGGCAACAUUGUUUGUAAUGGAAAGACUGGACACCCCCAGUGCCCAUCAGUGGGGGAGUCAUUAAAUAAACUAUGGUAUGUGCACAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2004.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2079.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 1166.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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