Basic Information

Symbol
ALCAM
RNA class
mRNA
Alias
Activated Leukocyte Cell Adhesion Molecule MEMD CD166 CD166 Antigen Activated Leucocyte Cell Adhesion Molecule
Location (GRCh38)
3:105366706-105576909
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001627.4
Sequence length
4701.0 nt
GC content
0.3957

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1220.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1313.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1180.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001243280.2 NCBI
AGAGCAGCCCGGAGACCGCUGCCGCCGCUGCCGCUGCUACCACCGCUGC… 4662 nt 0.3953
NM_001243281.2 NCBI
AGAGCAGCCCGGAGACCGCUGCCGCCGCUGCCGCUGCUACCACCGCUGC… 2750 nt 0.4469
NM_001243283.2 NCBI
AGAGCAGCCCGGAGACCGCUGCCGCCGCUGCCGCUGCUACCACCGCUGC… 1773 nt 0.4264
NM_001627.4 NCBI
AGAGCAGCCCGGAGACCGCUGCCGCCGCUGCCGCUGCUACCACCGCUGC… 4701 nt 0.3957
Summary

This gene encodes activated leukocyte cell adhesion molecule (ALCAM), also known as CD166 (cluster of differentiation 166), which is a member of a subfamily of immunoglobulin receptors with five immunoglobulin-like domains (VVC2C2C2) in the extracellular domain. This protein binds to T-cell differentiation antigene CD6, and is implicated in the processes of cell adhesion and migration. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found. [provided by RefSeq, Aug 2011] CIViC Summary for ALCAM Gene

Forensic Context

A study in humans identified that activated leukocyte cell adhesion molecule (CD166) was up-regulated in the plasma of patients with alcohol-associated hepatitis, where it functioned as an inflammatory mediator associated with T-cell adhesion and was part of a protein signature linked to disease severity [Argemi et al. DOI:10.1016/J.Ajpath.2022.08.009].