Basic Information

Symbol
ALDH7A1
RNA class
mRNA
Alias
Aldehyde Dehydrogenase 7 Family Member A1 Alpha-Aminoadipic Semialdehyde Dehydrogenase Alpha-AASA Dehydrogenase P6c Dehydrogenase ATQ1 EPD PDE Delta1-Piperideine-6-Carboxylate Dehydrogenase Betaine Aldehyde Dehydrogenase 26g Turgor Protein Homolog Antiquitin-1 Delta1-Piperideine-6-Carboxylate Dehydrogenease Aldehyde Dehydrogenase 7 Family, Member A1 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Aldehyde Dehydrogenase Family 7 Member A1 Antiquitin 1 EC 1.2.1.31 EC 1.2.1.3 EC 1.2.1.8 EC 1.2.1 EPEO4
Location (GRCh38)
5:126531200-126595362
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001182.5
Sequence length
4765.0 nt
GC content
0.4497

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1638.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1721.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1053.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001182.5 NCBI
AUCCCGAGUCCCGGGCUCAGUAUGUGGCGCCUUCCUCGCGCGCUGUGUG… 4765 nt 0.4497
NM_001201377.2 NCBI
AUCCCGAGUCCCGGGCUCAGUAUGUGGCGCCUUCCUCGCGCGCUGUGUG… 4765 nt 0.4497
NM_001202404.2 NCBI
AUCCCGAGUCCCGGGCUCAGUAUGUGGCGCCUUCCUCGCGCGCUGUGUG… 4573 nt 0.4485
Summary

The protein encoded by this gene is a member of subfamily 7 in the aldehyde dehydrogenase gene family. These enzymes are thought to play a major role in the detoxification of aldehydes generated by alcohol metabolism and lipid peroxidation. This particular member has homology to a previously described protein from the green garden pea, the 26g pea turgor protein. It is also involved in lysine catabolism that is known to occur in the mitochondrial matrix. Recent reports show that this protein is found both in the cytosol and the mitochondria, and the two forms likely arise from the use of alternative translation initiation sites. An additional variant encoding a different isoform has also been found for this gene. Mutations in this gene are associated with pyridoxine-dependent epilepsy. Several related pseudogenes have also been identified. [provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ALDH7A1 was down-regulated in brain tissue at 8 hours (0.457-fold) and 24 hours (0.480-fold) following whole-body irradiation with 10 Gy γ-rays, identifying it as a metabolism marker responsive to ionizing radiation [Zhao et al. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-2418].