Basic Information

Symbol
A4GALT
RNA class
mRNA
Alias
Alpha 1,4-Galactosyltransferase (P1PK Blood Group) A14GALT Lactosylceramide 4-Alpha-Galactosyltransferase Globotriaosylceramide Synthase CD77 Synthase Gb3 Synthase Gb3S P(K) UDP-Galactose:Beta-D-Galactosyl-Beta1-R 4-Alpha-D-Galactosyltransferase Alpha 1,4-Galactosyltransferase (P Blood Group) Alpha-1,4-N-Acetylglucosaminyltransferase Alpha-1,4-Galactosyltransferase P One Antigen (P Blood Group) P1/Pk Synthase Alpha4Gal-T1 EC 2.4.1.228 A4GALT1 P1 Alpha 1,4-Galactosyltransferase (Globotriaosylceramide Synthase, P Blood Group) Alpha 14-Galactosyltransferase P Blood Group (P One Antigen) P(K) Antigen Synthase P1PK PK
Location (GRCh38)
22:42691010-42721298
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017436.7
Sequence length
2092.0 nt
GC content
0.6420

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-928.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -964.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 635.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318038.3 NCBI
AGCAAAUAACUGGAAUUCCGCAAACACUGGGGUGAUGCAGGCAAUGCCC… 2155 nt 0.6320
NM_017436.7 NCBI
ACUGCCCUCCGGCCGCCGCGCCGCCCGCCCGCCGGGGCCCCGCUGUCCG… 2092 nt 0.6420
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the transfer of galactose to lactosylceramide to form globotriaosylceramide, which has been identified as the P(k) antigen of the P blood group system. This protein, a type II membrane protein found in the Golgi, is also required for the synthesis of the bacterial verotoxins receptor. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that burn injury to the hind paw induced transcriptomic remodeling in the primary somatosensory cortex, where the A4GALT gene was specifically upregulated one hour post-injury [Erdei et al. DOI:10.3390/ijms26083538].