Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_017436.7

Sequence Length

2092 nt

GC Content

0.6420

ACUGCCCUCCGGCCGCCGCGCCGCCCGCCCGCCGGGGCCCCGCUGUCCGCCGCCCGCCGCCGCUGGAGCUAGAGAUGGAUUUGCAGCCGCUGCAAGUGUGUGGAAGGGCCGUGUUCGUGUUGGCAAAGAAGGUCGGCUGCUGAGCCAGGGCGUGUCUCCCGGAGGCCUGUGGGCUGCCAGGAUCCCCACCUCUCUGCAAUGGGCUGCCCAGGCUGACCAGCCGGUUCCUGCUGGAAGCUCCUGGUCUGAUCUGGGGAUACCAUGUCCAAGCCCCCCGACCUCCUGCUGCGGCUGCUCCGGGGCGCCCCAAGGCAGCGGGUCUGCACCCUGUUCAUCAUCGGCUUCAAGUUCACGUUUUUCGUCUCCAUCAUGAUCUACUGGCACGUUGUGGGAGAGCCCAAGGAGAAAGGGCAGCUCUAUAACCUGCCAGCAGAGAUCCCCUGCCCCACCUUGACACCCCCCACCCCACCCUCCCACGGCCCCACUCCAGGCAACAUCUUCUUCCUGGAGACUUCAGACCGGACCAACCCCAACUUCCUGUUCAUGUGCUCGGUGGAGUCGGCCGCCAGAACUCACCCCGAAUCCCACGUGCUGGUCCUGAUGAAAGGGCUUCCGGGUGGCAACGCCUCUCUGCCCCGGCACCUGGGCAUCUCACUUCUGAGCUGCUUCCCGAAUGUCCAGAUGCUCCCGCUGGACCUGCGGGAGCUGUUCCGGGACACACCCCUGGCCGACUGGUACGCGGCCGUGCAGGGGCGCUGGGAGCCCUACCUGCUGCCCGUGCUCUCCGACGCCUCCAGGAUCGCACUCAUGUGGAAGUUCGGCGGCAUCUACCUGGACACGGACUUCAUUGUUCUCAAGAACCUGCGGAACCUGACCAACGUGCUGGGCACCCAGUCCCGCUACGUCCUCAACGGCGCGUUCCUGGCCUUCGAGCGCCGGCACGAGUUCAUGGCGCUGUGCAUGCGGGACUUCGUGGACCACUACAACGGCUGGAUCUGGGGUCACCAGGGCCCGCAGCUGCUCACGCGGGUCUUCAAGAAGUGGUGUUCCAUCCGCAGCCUGGCCGAGAGCCGCGCCUGCCGCGGCGUCACCACCCUGCCCCCUGAGGCCUUCUACCCCAUCCCCUGGCAGGACUGGAAGAAGUACUUUGAGGACAUCAACCCCGAGGAGCUGCCGCGGCUGCUCAGUGCCACCUAUGCUGUCCACGUGUGGAACAAGAAGAGCCAGGGCACGCGGUUCGAGGCCACGUCCAGGGCACUGCUGGCCCAGCUGCAUGCCCGCUACUGCCCCACGACGCACGAGGCCAUGAAAAUGUACUUGUGAGGGGCCCGCCAGGUCACCUCCCCAACCUGCUCCUGAUGGGGCACUGGGCCGCCCUUCCCGGGGAGGCAAGAUUGAGGGCCCGGGAGAGGGAGGCCCGAGCUGCCACCGGGCUUAGGCAGGCUGUUGAGGAGCUGUGGGAGCAGGCCCAGUGGGAGGCUGUGGACACCCCGAGGACAGUGUCCUGUCUCGAGGCAGGGCUGACACAUGGUGCCAUAGCCAGCGGAGGGCGCUCAGUGAGUGCCCCGGGCCUUCUAGACAACAGGCAGGAAGGAUGAACCUCAGGGCACCCCCAGGUGGUGCGGAAAGCCAGGCAGUUGGGACAGAGGUGCCCACGAGGGCAGAGGCCGGUGCUAAGGGGAUGGGGAAGAAGGGACAAGAUUCCCAGAGAGGAGAGGAGGCUGUUGGUAGGAAAGUGGCAGGGCUGGGGGAGACCCAGCCCCAAGGGUCCGGGGCGGAGGAUGCUUUGUUCUUUUCUGGUUUUGGUUCCUCUUUCGCGGGGGGUGGGGGAGGUCAACAGGGACUGAGUGGGGCAGAGGCCCAGAAGUGCCAGCCUGGGGAGCCGUUUGGGGGCAGCCCCUUCUGCCCACCCCAUCCUUCUUCCUCUCCAGAGAUGCCAGGGGGGCGUGUAUGCUCUGCCCCUUCCCUCAGACAGGGGCUGGGUGGGGAGGCUCUUUAGGCUCAGGAGAAGCAUUUUAAAGAAACCCCCACCCUGCCGCCCGCAUUAUAAACACAGGAGAAUAAUCAAUAGAAUAAAAGUGACCGACUGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-928.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -964.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 635.46

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(((((((.((.(((..((((........))))..))).))..)))((((.((((..((((((...((((.((((..((((((((.(((.(.(.((.(..((((((((...((.(((((..((.((.....)).))..))))).))(((((.(((((((((((..((((.((((((.......)))..........))).)))))))))((((((..(.((((....)))).)..))))))...))))))))))))))).....))))..).))).).))).))))))))...((((.(......(((((.(((.((((.(((((........((((((.......(((.....))).........(((((.((((((.((((((((...((((.........))))...)))))))).))))))...)))))(((((((((((.(((((..((((((((((..(((((.((((((((.((((.((.((((((..((((((((.(((((((((((((.((.....((..((((.((((.((.(..((((((((((.(...((((......((((((((.((((((((.(((((((..(..(((((...(((((((((..(.(((((((((((.((((((((((((((((....))))...........))))))))..((((((((.......))))))))......(((......))).(((((.(......)))))))))).))))))..))))).).....))))))))).))))).......)..)))))))))))....))))..)))))).)).......))))...).))))))))))..).)).))))....))))..))......(((.(((.(((..((((((((...........((((((...............))))))((((.(((.......)))))))..))))))))..)))..))).)))...)))))).))))))))).))))(((((((..........))))))).....)))).))))))))....((((..(((..((..((((((.....)))))).)).)))..))))...(((.((((((((.((((((((((((((((..((.((((.....)))).))..)........((((..((((((..((((..((.((.((((..(((.......))))))).))..))..))))..)))).))..)))).((((.(((((.(((((((.(((.(((((((((..((((((.((((((........((((((..(((....)))..)))))).(((((((...(((((((((.((...(((((((((...(((((((((((((.(((((((((((....((....))....))))))).)))).))))).)).)))).))..((....)).((((.......))))..)))))))))(((...))).((((((((.((((.....(.((((..((((((....)))))))))).)....))))))))))))..(.(.((((((((...))))))))).)((((..........)))).)).))).)).))))..)))).)))...))))))))))...))...))))))))).))).)))))))....)))).).))))..)))).))))))))))).)))))).........)))))...)))).)).)))))).)).))).........((((((((.....)))))))).......(((.((.((((((.(((....((......))....))))))))).)).)))))))))))))..)))))(((...))).))))))))).))(((((..........)))))))))))..))))))))))))...)))))).)))))))).))))...))))))....))..)).))))((((((((...((((((((.....)).)))))).((((((((.(..(((((((((((....).)))...)))))))..)))))))))........)))).....)))).))))....................((((.....))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

......(((((((.{(,({(,.{{{,,,.,,.,,)))),.,||.,,{{({{,(((.{,((,.((((((...((((.((((..(((({{{|.||{.(,(.{{{(,.(((({,,{,,||,|{{{((..,{.,{|||||},,|,|}}}},((({({({{,(({(((((((.,,((((,{{{,{{,..,,,,},}},,.},..,||}},})))}}))}((((((..(.((((....)))).)..)))))).,.})))))}),,}}}})}}}..)))).})})))},,))).)))))})),..((((,{,,,,..(((((.(((.({((.{{{{{........((((((,......(((.....))).........(((((.((((((.(((((((({{.((((.........))))..))))))))).))))))...)))))({(((((((((,(((((..((((((((((.((,.....{((((...,((((((.{........},))))))|(((((,.,((((.,{,.,...{{{.....}||..,|}|.}||||||}}}|}}}}|(((({{{,{,(((,(((,,((,({({,.((({((,,,,..|||||}}}{|||||{(({.({,(((((((((({(,{((((((((.((((....}))).}}}...{{{..{(((({(..((((((((.......))))))))......(((......))).(((((.(......))))))},||{,||||{{.||,,,.....}},)),)))),})),}...{{.{{{.{{,|||||,({{....)))}..}))))).))}.}}...))))}}})})...|||..{{{{{||.},,,.}}.))))}.}}}.....|,(((((({.((((((((.(((((.(((((((((((.{.((((((((({{,,,{.|..((((.(.({...((((((((((((.((({(.{{{(.(((.(((.......(((((,...(((((.(((((((((((((..........))))))))........))))))))))....))))))))))).)))}).))).))}})))))))))..}}}|)))),,}}}))))}((((.((((((((((((((((..((.((((.....)))).))..)......{,{({{.,((((((.,((((.,{{.(({(((({{.,,,{,,,{..|,}})).,}..}}.,}}|}.,||||,||{{||}}.((((,,({{{.((((((|.{({.{((((((((.|{|||((.,((((({{,,....((((((..(((....)))..)))))).(((((((,,.{((((((((((,,..(((((((((,.{(((((((((((((.(((((((((((....((....))....)))))))})))).))))),}).)))).))}|{{{,.}}|}}}||}}},.}}))}}}}))})))|))||{.,,))}.((((((((.((((....,,.(({,,,((((((....)))))))))).).,..))))))))))))..|.{.((((((((...))))))))}})|||||||...,...})}}.)),})).}}..)))..)))}.})),..))))))))))..,))}..))))))))).})).)))))))....)))).,.}))),.)))),})))))))))).))))((((......))))....))))).}}..))))))),.))))..))))).))))))))...,.))))))}),..))},)))))))|||||,.||,}}},,,......))}}}}))},,,,,....}.))))))))))))..))))},{|...,,).))))))))).))((({{..,,....}})))))))))))..}})))))))}))}..)))))).)}}})))).))))...)))))).}..)}..))},)))|.|,..}}...((((((((.....)).)))))).((((((((.(..(((((((((((....),}))...)))))))..))))))))){{{.....)))...........))))....................{(((.....))),