Basic Information

Symbol
AMY2B
RNA class
mRNA
Alias
Amylase Alpha 2B 1,4-Alpha-D-Glucan Glucanohydrolase 2B Amylase Alpha 2B (Pancreatic) Carcinoid Alpha-Amylase Alpha-Amylase 2B EC 3.2.1.1 AMY2 Amylase, Alpha 2B; Pancreatic Glycogenase AMY3 HXA
Location (GRCh38)
1:103553815-103579534
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001387437.1
Sequence length
1584.0 nt
GC content
0.4085

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-434.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -465.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 530.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001386109.1 NCBI
GCAGCAAACUGAGCAGAGGAGAGAAGACAGUGGUUUGCUUAGGAAACAG… 2083 nt 0.4052
NM_001387437.1 NCBI
AACUUCAAAGCAAAAUGAAGUUCUUUCUGUUGCUUUUCACCAUUGGGUU… 1584 nt 0.4085
NM_020978.4 NCBI
UAAAAUGAUUAGGUACCUAGUAUCAACCUAGCCAUCCAACCUUAUAUUA… 2253 nt 0.3839
Summary

Amylases are secreted proteins that hydrolyze 1,4-alpha-glucoside bonds in oligosaccharides and polysaccharides, and thus catalyze the first step in digestion of dietary starch and glycogen. The human genome has a cluster of several amylase genes that are expressed at high levels in either salivary gland or pancreas. This gene encodes an amylase isoenzyme produced by the pancreas. [provided by RefSeq, Jun 2013]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the AMY2B is present in semen and vaginal secretion and is distinguishable from salivary alpha-amylase 1 by mass spectrometry [Van Steendam et al. DOI:10.1007/s00414-012-0747-x]. A review of forensic proteomics literature notes that the AMY2B is a protein marker found in saliva for body fluid identification [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].