Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001387437.1

Sequence Length

1584 nt

GC Content

0.4085

AACUUCAAAGCAAAAUGAAGUUCUUUCUGUUGCUUUUCACCAUUGGGUUCUGCUGGGCUCAGUAUUCCCCAAAUACACAACAAGGACGGACAUCUAUUGUUCAUCUGUUUGAAUGGCGAUGGGUUGAUAUUGCUCUUGAAUGUGAGCGAUAUUUAGCUCCCAAGGGAUUUGGAGGGGUUCAGGUCUCUCCACCAAAUGAAAAUGUUGCAAUUCACAACCCUUUCAGACCUUGGUGGGAAAGAUACCAACCAGUUAGCUAUAAAUUAUGCACAAGAUCUGGAAAUGAAGAUGAAUUUAGAAACAUGGUGACUAGAUGUAACAAUGUUGGGGUUCGUAUUUAUGUGGAUGCUGUAAUUAAUCAUAUGUCUGGUAAUGCUGUGAGUGCAGGAACAAGCAGUACCUGUGGAAGUUACUUCAACCCUGGAAGUAGGGACUUUCCAGCAGUCCCAUAUUCUGGAUGGGAUUUUAAUGAUGGUAAAUGUAAAACUGGAAGUGGAGAUAUCGAGAACUACAAUGAUGCUACUCAGGUCAGAGAUUGUCGUCUGGUUGGUCUUCUUGAUCUUGCACUGGAGAAAGAUUAUGUGCGUUCCAAGAUUGCCGAAUAUAUGAAUCAUCUCAUUGACAUUGGUGUUGCAGGGUUCAGACUUGAUGCUUCCAAGCACAUGUGGCCUGGAGACAUAAAGGCAAUUUUGGACAAACUGCAUAAUCUAAACAGUAACUGGUUCCCUGCAGGAAGUAAACCUUUCAUUUACCAGGAGGUAAUUGAUCUGGGUGGUGAGCCAAUUAAAAGCAGUGACUACUUUGGAAAUGGCCGGGUGACAGAAUUCAAGUAUGGUGCAAAACUCGGCACAGUUAUUCGCAAGUGGAAUGGAGAGAAGAUGUCUUACCUAAAGAACUGGGGAGAAGGUUGGGGUUUCAUGCCUUCUGACAGAGCACUUGUCUUUGUGGAUAACCAUGACAAUCAACGAGGACAUGGGGCUGGAGGAGCCUCUAUUCUUACCUUCUGGGAUGCUAGGCUGUAUAAAAUGGCAGUUGGAUUUAUGCUUGCUCAUCCUUAUGGUUUUACACGAGUAAUGUCAAGCUACCGUUGGCCAAGACAGUUUCAAAAUGGAAACGAUGUUAAUGAUUGGGUUGGGCCACCAAAUAAUAAUGGAGUAAUUAAAGAAGUUACUAUUAAUCCAGACACUACUUGUGGCAAUGACUGGGUCUGUGAACAUCGAUGGCGCCAAAUAAGGAACAUGGUUAAUUUCCGCAAUGUAGUGGAUGGCCAGCCUUUUACAAACUGGUAUGAUAAUGGGAGCAACCAAGUGGCUUUUGGGAGAGGAAACAGAGGAUUCAUUGUUUUCAACAAUGAUGACUGGACAUUUUCUUUAACUUUGCAAACUGGUCUUCCUGCUGGCACAUACUGUGAUGUCAUUUCUGGAGAUAAAAUUAAUGGCAAUUGCACAGGCAUUAAAAUCUACGUUUCUGACGAUGGCAAAGCUCAUUUUUCUAUUAGUAACUCUGCUGAGGAUCCAUUUAUUGCAAUUCAUGCUGAAUCUAAAUUAUAAAAUUUAAAAUUAAAUGCAUAUCCUCAAAACAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-434.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -465.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 530.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((........)))))))......((((((.......(((((((((....)))))))))...(((((...........(((..((((((((.((.(((((((((((...((((..((((..((((((((((........)))))))))).....))))(((((((((((....)))))))))))(((((((.(((((..((((.......))))..)))))....)))))))..((((.(((((((((.............(((.((((..(((((..(((((.((((((((...(((((.((.((.....)).)).))))).)))))))).)))))..((.((..((((((..(((((.(((((.(..(.((((....)))).)...).))).)).))))).))))))..)).))((((((((....)).)))))).((((((((.......))))))))....((((((((..((((...((.((.((....)).)).))...))))....))))).)))..)))))..))))))))))))))))..))))..(((((((..((((..((((((((((.((((((((((((((.....((((.....((((.....(((..(((((...(((((((....))).))))...)))))..))).....))))))))..))))))))))))...))))))))))))...(((...))).)))).))))))).....((((.(((.(((((....))))).)))...)))).....)))).....))))))...((((((((((..(((((((((..((..((......))..))....))))))).))....)))).)))))).))))).)).))))))))..))).......)))))((((((.((((.((...((((.((.(.(((((.((.(((((((((.(((..........))).))))))))).((((((.....))))))............((((....))))(((((........)))))((((((((((((((....((((((((((.((((....))))((((..((((....))))...))))(((((......)))))((((((...((((.(((((.(((((..........((((((((((.....))))))......))))..........)))))..))))).))))....))))))......))))..)))))).............((((......))))(((((((((....(((......))).......(((((..((((.((.((....(..((((((((...((...((((((((...))))))))...)).....))))))))..)...))..))))))))))).)))))).)))..((((((((((((...............)))))).)))))))))))))..))))))).))))))).))).)))))).)))).))))))...)))))).....(((((((.((((((..(((.....)))......((((((....))))))....))))))...)))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((((........))))))}...((((((((({.(((((({(((({{({(({|||||||}||.,,||||....,.,,,,..(({.(((((.....})))}.}}}||||}..{{{,..,(((({((((((((((........)))))))))),}))})}}}(((((((((((....))))))))))}((((((,.(((((..((((.......))))..)))))....}))))))..,{{{.{((((((((...{{.......,{,|}{(({.,((({,..,{{{{,{{,{{{{{...,{(({,((.(({,{{,||,,,.,}|||{,|||||}|{|||,,,,||,||,}|||||,..,,,||}}}}}|}|..{|{|||,.{{{{{{,.||.,|}}}}}}|}|}||{||||||{{|,.||{{{|}}})),,}))}}})))},|(((((((.......)))))))}....{{{(((({..((((...((.((.((....)).)).))...)))}.,..))))),))}..||}}}..}}}}},)))))))))),,}))),.|||||{{,,({,,..((((((((((.((((((((((((((.....{(((.....{{{{.....{{{..(((((..{((,,{({....|}},|}|}.,.)))))..))).,.,.)))))))}..))))))))))))...))))))))))))...{||,..))),}))),})))))).....,{{{.(((.(((((....))))).)))..,)))))))))||||.,,.,{||}||...}}.}}}),|,..)))}.})))))))))|(((,,((((({(((({..(((((((.(((((({....{{|{{((|{{{(({{|{||{|||..((({......)))).((((((({((....,),.))))))){,{{{,,,..,||||{(((({(((,,{{{{{...,,}.,}|||||,}.((((((.....))))))..,}}}}.{{,,.,|{{{{{{{{((((((,...,,{,|,|||{,{{|,|,|{{{{{,,,,|{(|,.,|},....|,}}})}},,|||.,|||.}}}}}}|||,.,,},(((((......)))}|((((((...((((.(((((.(((((..........((((((((({.....}))))),.....))))..........)))))..})))).))))..,.))))))}.}}}}|||,...,})),.},}|||||...|||||,.....)))}|||{{{{((.,,.{{(.....,))}.......(((((..{(({,({.((....{,.{((((({{,,,{{...((((((((...))))))))...)),....))))))))..},..))..}})))}})))).)))))).}}}.|||{|.(((((((...||{||,....,{||||,|.....,,,,).)))}}}...,,.,}}}}}}},,)}})))),,})})}}},)}))}},))))))).)))))))........,.}))))..})))))))))}.{{{{{{....}}}}}}....,,,,,...................