Basic Information

Symbol
ABCC5
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily C Member 5 MOAT-C MRP5 SMRP EST277145 ATP-Binding Cassette, Sub-Family C (CFTR/MRP), Member 5 ATP-Binding Cassette Sub-Family C Member 5 Multi-Specific Organic Anion Transporter C Multidrug Resistance-Associated Protein 5 PABC11 Canalicular Multispecific Organic Anion Transporter C EC 7.6.2.- EC 7.6.2.2 ABC33 MOATC
Location (GRCh38)
3:183919934-184017939
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005688.4
Sequence length
5790.0 nt
GC content
0.5055

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1983.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2089.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1696.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001023587.3 NCBI
AUGCUCGGGAGCGUGGUUGAGCGGCUGGCGCGGUUGUCCUGGAGCAGGG… 1918 nt 0.4755
NM_001320032.2 NCBI
AUGCUCGGGAGCGUGGUUGAGCGGCUGGCGCGGUUGUCCUGGAGCAGGG… 5905 nt 0.5053
NM_005688.4 NCBI
AUGCUCGGGAGCGUGGUUGAGCGGCUGGCGCGGUUGUCCUGGAGCAGGG… 5790 nt 0.5055
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. This protein functions in the cellular export of its substrate, cyclic nucleotides. This export contributes to the degradation of phosphodiesterases and possibly an elimination pathway for cyclic nucleotides. Studies show that this protein provides resistance to thiopurine anticancer drugs, 6-mercatopurine and thioguanine, and the anti-HIV drug 9-(2-phosphonylmethoxyethyl)adenine. This protein may be involved in resistance to thiopurines in acute lymphoblastic leukemia and antiretroviral nucleoside analogs in HIV-infected patients. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in the Oncopig (Sus scrofa) model of alcohol-induced liver fibrosis demonstrated that the ABCC5 was upregulated in fibrotic livers and its altered expression is associated with chemotherapeutic efflux, such as for 5-fluorouracil, contributing to mechanisms of drug resistance [Yasmin et al. DOI:10.1016/J.Biochi.2020.12.022].