Basic Information

Symbol
ANAPC7
RNA class
mRNA
Alias
Anaphase Promoting Complex Subunit 7 APC7 Anaphase-Promoting Complex Subunit 7 Cyclosome Subunit 7 FERBON
Location (GRCh38)
12:110372900-110403730
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016238.3
Sequence length
3023.0 nt
GC content
0.4780

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-969.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1025.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 905.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001137664.2 NCBI
AUUUUGGAGUCUUCCCUAAGGAUCCUCUACCGGCUUUUCGAGUCAGUGC… 2181 nt 0.4328
NM_001385208.1 NCBI
AGACGGAGUCUCGCUCUGCACGAUCUUGGCUCACUGCAAGCUUCGCCUU… 3341 nt 0.4855
NM_001385209.1 NCBI
AUUUUGGAGUCUUCCCUAAGGAUCCUCUACCGGCUUUUCGAGUCAGUGC… 3827 nt 0.5080
NM_001385210.1 NCBI
AGACGGAGUCUCGCUCUGCACGAUCUUGGCUCACUGCAAGCUUCGCCUU… 3438 nt 0.4855
NM_001385211.1 NCBI
AUUUUGGAGUCUUCCCUAAGGAUCCUCUACCGGCUUUUCGAGUCAGUGC… 2798 nt 0.4825
NM_001385212.1 NCBI
AUUUUGGAGUCUUCCCUAAGGAUCCUCUACCGGCUUUUCGAGUCAGUGC… 2911 nt 0.4765
NM_016238.3 NCBI
AUUUUGGAGUCUUCCCUAAGGAUCCUCUACCGGCUUUUCGAGUCAGUGC… 3023 nt 0.4780
Summary

This gene encodes a tetratricopeptide repeat containing component of the anaphase promoting complex/cyclosome (APC/C), a large E3 ubiquitin ligase that controls cell cycle progression by targeting a number of cell cycle regulators such as B-type cyclins for 26S proteasome-mediated degradation through ubiquitination. The encoded protein is required for proper protein ubiquitination function of APC/C and for the interaction of APC/C with certain transcription coactivators. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that traumatic brain injury (TBI) induces widespread changes in gene expression, with 104 genes showing differential expression in pericontusional tissue [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].