Basic Information
Symbol
ANGPT1
RNA class
mRNA
Alias
Angiopoietin 1
KIAA0003
AGPT-1
Ang1
Angiopoietin-1
ANG-1
AGP1
AGPT
HAE5
Location (GRCh38)
8:107249482-107498055
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
Wound age identification
MANE select
Transcript ID
NM_001146.5
Sequence length
4230.0 nt
GC content
0.3565
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-986.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1073.13 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1025.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGCAGAUCUGCAGCAGAUAGGGUAGAGGAAAGGGUCUAGAAUAUGUACA… | 4230 nt | 0.3565 | |
| AGCAGAUCUGCAGCAGAUAGGGUAGAGGAAAGGGUCUAGAAUAUGUACA… | 4227 nt | 0.3563 | |
| CGGCUAAGUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUUGC… | 3556 nt | 0.3453 |
Summary
This gene encodes a secreted glycoprotein that belongs to the angiopoietin family. Members of this family play important roles in vascular development and angiogenesis. All angiopoietins bind with similar affinity to an endothelial cell-specific tyrosine-protein kinase receptor. The protein encoded by this gene is a secreted glycoprotein that activates the receptor by inducing its tyrosine phosphorylation. It plays a critical role in mediating reciprocal interactions between the endothelium and surrounding matrix and mesenchyme and inhibits endothelial permeability. The protein also contributes to blood vessel maturation and stability, and may be involved in early development of the heart. Mutations in this gene are associated with hereditary angioedema. [provided by RefSeq, Aug 2020]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that angiopoietin 1 (Angpt1) mRNA levels were significantly upregulated on days 3, 6, and 12 following skeletal muscle contusion injury, identifying it as a key angiogenic factor involved in the regeneration process. The expression of the ANGPT1 was positively correlated with specific long non-coding RNAs, including Malat1 and H19, which were also upregulated post-injury [Zheng et al. DOI:10.3892/etm.2019.7871]. A study in mice demonstrated that following controlled cortical impact traumatic brain injury, juvenile animals exhibited increased mRNA expression of Angiopoietin-1 in magnetically isolated CD31+ endothelial cells compared to adults, which correlated with enhanced blood-brain barrier stability and reduced lesion volume [Brickler et al. DOI:10.1523/JNEUROSCI.0914-18.2018]. Pharmacological inhibition of the Tie2 receptor, which binds the ANGPT1, abolished these juvenile protective effects, significantly increasing barrier disruption and lesion size.