Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001314051.2
Sequence Length
3556 nt
GC Content
0.3453
CGGCUAAGUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUUGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCUUGACCUCGUGAUCCACCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCGCCCGGCGGUACUAAAUCAAACUUCUCGACUUGAGAUACAGCUGCUGGAGAAUUCAUUAUCCACCUACAAGCUAGAGAAGCAACUUCUUCAACAGACAAAUGAAAUCUUGAAGAUCCAUGAAAAAAACAGUUUAUUAGAACAUAAAAUCUUAGAAAUGGAAGGAAAACACAAGGAAGAGUUGGACACCUUAAAGGAAGAGAAAGAGAACCUUCAAGGCUUGGUUACUCGUCAAACAUAUAUAAUCCAGGAGCUGGAAAAGCAAUUAAACAGAGCUACCACCAACAACAGUGUCCUUCAGAAGCAGCAACUGGAGCUGAUGGACACAGUCCACAACCUUGUCAAUCUUUGCACUAAAGAAGGUGUUUUACUAAAGGGAGGAAAAAGAGAGGAAGAGAAACCAUUUAGAGACUGUGCAGAUGUAUAUCAAGCUGGUUUUAAUAAAAGUGGAAUCUACACUAUUUAUAUUAAUAAUAUGCCAGAACCCAAAAAGGUGUUUUGCAAUAUGGAUGUCAAUGGGGGAGGUUGGACUGUAAUACAACAUCGUGAAGAUGGAAGUCUAGAUUUCCAAAGAGGCUGGAAGGAAUAUAAAAUGGGUUUUGGAAAUCCCUCCGGUGAAUAUUGGCUGGGGAAUGAGUUUAUUUUUGCCAUUACCAGUCAGAGGCAGUACAUGCUAAGAAUUGAGUUAAUGGACUGGGAAGGGAACCGAGCCUAUUCACAGUAUGACAGAUUCCACAUAGGAAAUGAAAAGCAAAACUAUAGGUUGUAUUUAAAAGGUCACACUGGGACAGCAGGAAAACAGAGCAGCCUGAUCUUACACGGUGCUGAUUUCAGCACUAAAGAUGCUGAUAAUGACAACUGUAUGUGCAAAUGUGCCCUCAUGUUAACAGGAGGAUGGUGGUUUGAUGCUUGUGGCCCCUCCAAUCUAAAUGGAAUGUUCUAUACUGCGGGACAAAACCAUGGAAAACUGAAUGGGAUAAAGUGGCACUACUUCAAAGGGCCCAGUUACUCCUUACGUUCCACAACUAUGAUGAUUCGACCUUUAGAUUUUUGAAAGCGCAAUGUCAGAAGCGAUUAUGAAAGCAACAAAGAAAUCCGGAGAAGCUGCCAGGUGAGAAACUGUUUGAAAACUUCAGAAGCAAACAAUAUUGUCUCCCUUCCAGCAAUAAGUGGUAGUUAUGUGAAGUCACCAAGGUUCUUGACCGUGAAUCUGGAGCCGUUUGAGUUCACAAGAGUCUCUACUUGGGGUGACAGUGCUCACGUGGCUCGACUAUAGAAAACUCCACUGACUGUCGGGCUUUAAAAAGGGAAGAAACUGCUGAGCUUGCUGUGCUUCAAACUACUACUGGACCUUAUUUUGGAACUAUGGUAGCCAGAUGAUAAAUAUGGUUAAUUUCAUGUAAAACAGAAAAAAAGAGUGAAAAAGAGAAUAUACAUGAAGAAUAGAAACAAGCCUGCCAUAAUCCUUUGGAAAAGAUGUAUUAUACCAGUGAAAAGGUGUUAUAUCUAUGCAAACCUACUAACAAAUUAUACUGUUGCACAAUUUUGAUAAAAAUUUAGAACAGCAUUGUCCUCUGAGUUGGUUAAAUGUUAAUGGAUUUCAGAAGCCUAAUUCCAGUAUCAUACUUACUAGUUGAUUUCUGCUUACCCAUCUUCAAAUGAAAAUUCCAUUUUUGUAAGCCAUAAUGAACUGUAGUACAUGGACAAUAAGUGUGUGGUAGAAACAAACUCCAUUACUCUGAUUUUUGAUACAGUUUUCAGAAAAAGAAAUGAACAUAAUCAAGUAAGGAUGUAUGUGGUGAAAACUUACCACCCCCAUACUAUGGUUUUCAUUUACUCUAAAAACUGAUUGAAUGAUAUAUAAAUAUAUUUAUAGCCUGAGUAAAGUUAAAAGAAUGUAAAAUAUAUCAUCAAGUUCUUAAAAUAAUAUACAUGCAUUUAAUAUUUCCUUUGAUAUUAUACAGGAAAGCAAUAUUUUGGAGUAUGUUAAGUUGAAGUAAAAGCAAGUACUCUGGAGCAGUUCAUUUUACAGUAUCUACUUGCAUGUGUAUACAUACAUGUAACUUCAUUAUUUUAAAAAUAUUUUUAGAACUCCAAUACUCACCCUGUUAUGUCUUGCUAAUUUAAAUUUUGCUAAUUAACUGAAACAUGCUUACCAGAUUCACACUGUUCCAGUGUCUAUAAAAGAAACACUUUGAAGUCUAUAAAAAAUAAAAUAAUUAUAAAUAUCAUUGUACAUAGCAUGUUUAUAUCUGCAAAAAACCUAAUAGCUAAUUAAUCUGGAAUAUGCAACAUUGUCCUUAAUUGAUGCAAAUAACACAAAUGCUCAAAGAAAUCUACUAUAUCCCUUAAUGAAAUACAUCAUUCUUCAUAUAUUUCUCCUUCAGUCCAUUCCCUUAGGCAAUUUUUAAUUUUUAAAAAUUAUUAUCAGGGGAGAAAAAUUGGCAAAACUAUUAUAUGUAAGGGAAAUAUAUACAAAAAGAAAAUUAAUCAUAGUCACCUGACUAAGAAAUUCUGACUGCUAGUUGCCAUAAAUAACUCAAUGGAAAUAUUCCUAUGGGAUAAUGUAUUUUAAGUGAAUUUUUGGGGUGCUUGAAGUUACUGCAUUAUUUUAUCAAGAAGUCUUCUCUGCCUGUAAGUGUCCAAGGUUAUGACAGUAAACAGUUUUUAUUAAAACAUGAGUCACUAUGGGAUGAGAAAAUUGAAAUAAAGCUACUGGGCCUCCUCUCAUAAAAGAGACAGUUGUUGGCAAGGUAGCAAUACCAGUUUCAAACUUGGUGACUUGAUCCACUAUGCCUUAAUGGUUUCCUCCAUUUGAGAAAAUAAAGCUAUUCACAUUGUUAAGAAAAAUACUUUUUAAAGUUUACCAUCAAGUCUUUUUUAUAUUUAUGUGUCUGUAUUCUACCCCUUUUUGCCUUACAAGUGAUAUUUGCAGGUAUUAUACCAUUUUUCUAUUCUUGGUGGCUUCUUCAUAGCAGGUAAGCCUCUCCUUCUAAAAACUUCUCAACUGUUUUCAUUUAAGGGAAAGAAAAUGAGUAUUUUGUCCUUUUGUGUUCCUACAGACACUUUCUUAAACCAGUUUUUGGAUAAAGAAUACUAUUUCCAAACUCAUAUUACAAAAACAAAAUAAAAUAAUAAAAAAAGAAAGCAUGAUAUUUACUGUUUUGUUGUCUGGGUUUGAGAAAUGAAAUAUUGUUUCCAAUUAUUUAUAAUAAAUCAGUAUAAAAUGUUUUAUGAUUGUUAUGUGUAUUAUGUAAUACGUACAUGUUUAUGGCAAUUUAACAUGUGUAUUCUUUUAAUUGUUUCAGAAUAGGAUAAUUAGGUAUUCGAAUUUUGUCUUUAAAAUUCAUGUGGUUUCUAUGCAAAGUUCUUCAUAUCAUCACAACAUUAUUUGAUUUAAAUAAAAUUGAAAGUAAUAUUUGUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-812.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -885.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 987.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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