Basic Information

Symbol
ANXA2
RNA class
mRNA
Alias
Annexin A2 Annexin II ANX2L4 CAL1H LPC2D LIP2 ANX2 Placental Anticoagulant Protein IV Calpactin I Heavy Chain Calpactin-1 Heavy Chain Lipocortin II Annexin-2 Protein I PAP-IV P36 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Epididymis Secretory Protein Li 270 Calpactin I Heavy Polypeptide Chromobindin 8 Chromobindin-8 HEL-S-270 LPC2
Location (GRCh38)
15:60347134-60402883
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004039.3
Sequence length
1554.0 nt
GC content
0.4736

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-461.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -491.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 363.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002857.2 NCBI
GCUCAGCAUUUGGGGACGCUCUCAGCUCUCGGCGCACGGCCCAGGUUAU… 1635 nt 0.4740
NM_001002858.3 NCBI
GCUCAGCAUUUGGGGACGCUCUCAGCUCUCGGCGCACGGCCCAGGUAAG… 1626 nt 0.4859
NM_001136015.3 NCBI
GCUCAGCAUUUGGGGACGCUCUCAGCUCUCGGCGCACGGCCCAGGGUGA… 1659 nt 0.4653
NM_004039.3 NCBI
GCUCAGCAUUUGGGGACGCUCUCAGCUCUCGGCGCACGGCCCAGCUUCC… 1554 nt 0.4736
Summary

This gene encodes a member of the annexin family. Members of this calcium-dependent phospholipid-binding protein family play a role in the regulation of cellular growth and in signal transduction pathways. This protein functions as an autocrine factor which heightens osteoclast formation and bone resorption. This gene has three pseudogenes located on chromosomes 4, 9 and 10, respectively. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Annexin A2 expression has been found to correlate with resistance to treatment against various cancer forms. [provided by RefSeq, Dec 2019]

Forensic Context

A study in mouse fetal cortical neurons identified a 156-nt cis-acting region within the NR1 mRNA 3'-UTR that specifically binds trans-acting proteins from polysomes, with this binding activity significantly upregulated by chronic ethanol exposure [Anji & Kumari DOI:10.1111/J.1460-9568.2006.04776.X].