Basic Information

Symbol
AOC1
RNA class
mRNA
Alias
Amine Oxidase Copper Containing 1 DAO Diamine Oxidase ABP1 ABP Amiloride Binding Protein 1 (Amine Oxidase (Copper-Containing)) Amine Oxidase Copper Domain-Containing Protein 1 Diamine Oxidase [Copper-Containing] Amiloride-Binding Protein 1 Kidney Amine Oxidase Histaminase KDAO KAO Amiloride-Sensitive Amine Oxidase Amiloride-Binding Protein EC 1.4.3.22 DAO1
Location (GRCh38)
7:150824627-150861504
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001091.4
Sequence length
2609.0 nt
GC content
0.6025

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1052.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1097.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 567.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001091.4 NCBI
GCAAAGGCUGGAAGCAGAGCGAACUGGGAGCAGAGCACACAGAGCCGUG… 2609 nt 0.6025
NM_001272072.2 NCBI
GCAAAGGCUGGAAGCAGAGCGAACUGGGAGCAGAGCACACAGAGCCGUG… 2666 nt 0.6050
Summary

This gene encodes a metal-binding membrane glycoprotein that oxidatively deaminates putrescine, histamine, and related compounds. The encoded protein is inhibited by amiloride, a diuretic that acts by closing epithelial sodium ion channels. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.