Basic Information

Symbol
AP2B1
RNA class
mRNA
Alias
Adaptor Related Protein Complex 2 Subunit Beta 1 CLAPB1 ADTB2 Clathrin Assembly Protein Complex 2 Beta Large Chain Plasma Membrane Adaptor HA2/AP2 Adaptin Beta Subunit Adaptor Related Protein Complex 2 Beta 1 Subunit Adaptor-Related Protein Complex 2 Subunit Beta Adaptor Protein Complex AP-2 Subunit Beta AP-2 Complex Subunit Beta Beta-2-Adaptin Beta2-Adaptin Beta-Adaptin AP105B Clathrin-Associated/Assembly/Adaptor Protein, Large, Beta 1 Adapter-Related Protein Complex 2 Beta Subunit Adapter-Related Protein Complex 2 Subunit Beta Testicular Tissue Protein Li 22 Adaptin, Beta 2 (Beta) AP2-BETA
Location (GRCh38)
17:35578046-35726417
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001030006.2
Sequence length
5700.0 nt
GC content
0.4661

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1754.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1861.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1497.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001030006.2 NCBI
AGACCUAGAAAAGAAUCGUGACGGGCAGGAAACCAUUACACCACCACCU… 5700 nt 0.4661
NM_001282.3 NCBI
AGACCUAGAAAAGAAUCGUGACGGGCAGGAAACCAUUACACCACCACCU… 5658 nt 0.4648
Summary

The protein encoded by this gene is one of two large chain components of the assembly protein complex 2, which serves to link clathrin to receptors in coated vesicles. The encoded protein is found on the cytoplasmic face of coated vesicles in the plasma membrane. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans analyzing blood samples from burn patients identified the AP2B1 as a Temporal Expression Profile Gene exhibiting a significantly increasing expression trend from 0 to 7 days after severe burn injury [Wu et al. DOI:10.1016/j.burns.2018.08.022].