Basic Information

Symbol
ABI1
RNA class
mRNA
Alias
Abl Interactor 1 E3B1 SSH3BP1 ABI-1 Spectrin SH3 Domain-Binding Protein 1 Eps8 SH3 Domain-Binding Protein Abl-Binding Protein 4 Abelson Interactor 1 Spectrin SH3 Domain Binding Protein 1 Abl-Interactor Protein 1 Long Interactor Protein AblBP4 Nap1 Binding Protein Eps8-Binding Protein Nap1-Binding Protein Abl-Interactor 1 ABLBP4 NAP1BP SSH3BP AblBP4 Nap1BP Abi-1
Location (GRCh38)
10:26745942-26861094
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001012750.3
Sequence length
3515.0 nt
GC content
0.3804

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-897.05 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -968.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 895.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178125.2 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3059 nt 0.3678
NM_001348029.2 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3593 nt 0.3838
NM_001348030.2 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3413 nt 0.3756
NM_001348031.2 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3332 nt 0.3745
NM_001348032.2 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3509 nt 0.3799
NM_001348033.2 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3506 nt 0.3796
NM_001348034.2 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3419 nt 0.3791
NM_001410909.1 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3497 nt 0.3798
NM_005470.4 NCBI
GGUUUGUAUCCGGGCUGUGAGGUGCUCGGAGCCUCGGCGGACCUUGCUG… 3596 nt 0.3840
Showing 11 to 19 of 19 entries
Summary

This gene encodes a member of the Abelson-interactor family of adaptor proteins. These proteins facilitate signal transduction as components of several multiprotein complexes, and regulate actin polymerization and cytoskeletal remodeling through interactions with Abelson tyrosine kinases. The encoded protein plays a role in macropinocytosis as a component of the WAVE2 complex, and also forms a complex with EPS8 and SOS1 that mediates signal transduction from Ras to Rac. This gene may play a role in the progression of several malignancies including melanoma, colon cancer and breast cancer, and a t(10;11) chromosomal translocation involving this gene and the MLL gene has been associated with acute myeloid leukemia. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 14. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the ABI1 as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].