Basic Information

Symbol
APOF
RNA class
mRNA
Alias
Apolipoprotein F Lipid Transfer Inhibitor Protein Apo-F LTIP
Location (GRCh38)
12:56360568-56362857
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001638.4
Sequence length
1750.0 nt
GC content
0.4886

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-572.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -603.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 355.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001638.4 NCBI
AUCCUUCACUGAUCAUAGGGGAAAGCAAAUAUCUCCUUUCCUCAUGGGA… 1750 nt 0.4886
Summary

The product of this gene is one of the minor apolipoproteins found in plasma. This protein forms complexes with lipoproteins and may be involved in transport and/or esterification of cholesterol. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A review of proteomics in forensic science notes that the APOF is an indicator of cardiorespiratory fitness in human plasma [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].