Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001638.4

Sequence Length

1750 nt

GC Content

0.4886

AUCCUUCACUGAUCAUAGGGGAAAGCAAAUAUCUCCUUUCCUCAUGGGACACAGAACUAGGCAGAACAGGAUCAGGAAGCGAUCAAACCUACCAAGGCAGUCUCACUUCUCAAUGACUGGACUGUGUGGGUACUCUGCUCCAGACAUGCGUGGCCUCAGACUCAUCAUGAUACCAGUUGAGCUGCUACUUUGCUACCUCCUGCUGCACCCUGUGGAUGCCACUUCAUAUGGAAAGCAGACAAAUGUCUUGAUGCACUUUCCCUUGUCCUUGGAAUCCCAGACACCCUCCUCAGACCCCUUGUCCUGCCAAUUUCUGCACCCAAAGUCACUGCCUGGUUUCAGCCACAUGGCCCCUCUACCCAAGUUCUUGGUAAGCCUGGCUCUAAGGAAUGCCCUGGAGGAAGCUGGUUGUCAGGCUGAUGUUUGGGCUCUACAGCUACAGCUCUACCGCCAGGGUGGUGUGAAUGCUACACAGGUCCUCAUCCAGCAUCUUCGAGGGCUCCAGAAAGGCAGAAGCACAGAGAGGAACGUGUCAGUGGAAGCCCUGGCCUCUGCUCUGCAGCUGUUAGCCAGGGAGCAGCAAAGCACAGGAAGGGUCGGGCGCUCCCUCCCGACAGAGGACUGUGAGAAUGAGAAGGAGCAAGCUGUGCACAAUGUAGUCCAGCUGCUGCCAGGAGUGGGAACCUUCUACAACCUGGGCACAGCUUUGUAUUAUGCUACUCAAAACUGCCUGGGCAAGGCCAGGGAACGAGGCCGAGAUGGGGCCAUAGAUCUGGGAUAUGACCUUCUGAUGACCAUGGCUGGGAUGUCAGGGGGGCCUAUGGGUCUAGCGAUCAGUGCUGCACUUAAACCUGCAUUAAGGUCUGGGGUUCAGCAGUUGAUCCAGUAUUACCAAGAUCAGAAAGACGCAAACAUCUCUCAGCCGGAGACCACCAAGGAGGGUUUGAGGGCCAUCUCAGAUGUGAGUGACUUGGAAGAAACAACUACUCUGGCUUCUUUCAUAUCAGAAGUAGUAAGUUCAGCUCCCUACUGGGGGUGGGCCAUAAUCAAGAGCUAUGACUUAGAUCCUGGGGCUGGGAGUCUUGAGAUAUAAAAGAAUGUGGUAACCACAGAAUUAAUAACUGUACUACCCUGACAAGCUAUAUACAUGUCUUCAAAAUUUUAAUCUGAUUUAUCCAGGAGGAAGGCUGUACAGUAAAACGUAAGAACGUAAAUGUUUGGGUGUUGAAGUCACAGGGUUUGGUUUCGAAUCUAGGCUCCACUUGUUAGAGCCUCGGUGAUCACUGAAUAGUAACUUCUUUCUUGAACUAAGAUCAGUUUUGAAGUUUCUAAAGGAGAUAGAAUGAUUUUAACCUCAAUGAGUUGCCCUGUAAAUUUAAAAUGAUACAAUGAAUCUAAAAUGCUUAUCACAGUACUUUCAAUAAAUAGCUAUUAGCCAGGUGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUGUGAGAGGCUGAGGCGGGAUGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCAAGAUCAGCCUGGGCAACAUGGCGAAACCCCGUCUCUACAAUAAAUACAAAAAAUUAUCCUGGCGGAGUUAUGCACGCUUGUAGUCCCAACUACCUGGGAGGCUGAGGCGGGAGAAUCACCUGAGCCUGGGAGGUCGAGGCUGCAGCGAGCCGAGAUCGCGCCGCUGCAUUCCAGCCUGGGUGACAGAGCGAGACCAUGUCUCAAAAAAUAAAAAUAAAAAAAAAUUGUUUUCAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-572.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -603.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 355.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((.((((((...((((((((..........)))))))).(((.........)))..........)))))))))).)))......((((.(((((((((((((((((..(((..(.((((((((((((.(((((((((((((((.(((((.((((..............((((.(((..((......))...)))..))))....((((((.(((((((((....(((((((((((....))).)).....))))))..((((..(((....))))))).....((((((((((..(((((((........)).....((((((..((((((((...(((..(((((((.((.((((...((((((((...(((((((.........(((((((.((.((((((((((..((((.(....).))))..)))))..)))))...)).))))))).((((...((((.....(((((((.............))))))).......))))...)))).((((((...(((((........(((((((((.(((((.(((((((((........))))))....(((((.....((((((.(....).))))))......)))))....((((.((.((((((((((((.....(((((...)))))..(((((.((((((...))))))..)))))))))))).))))....).)).))))....)))..)))))))))))))).....((((.......))))...((((((((((((..(((((((((..(((....)))...)))))))))(((....))).....(((((((((((..((((.((((......)))).))))...))))).))))))..))))).)).))))).....))))).....)))))))))))).)...))))))))))))..)))))))))((((....))))(((..((((((((.((.......))..))))))))..)))(((........))).((((((....)))))).)))...)))).)).))..)))))).......))))).))).))).))))........))).)))))).))))))...................))))...)))))...)))))))...(((((((((.(((((((.((.((((((((((((((.((((..((((...((((......))))...))))...(((((.(((((((....)))))))((((((.........))))))..))))).)))).)))))..))))))))).))....)))))))..))))))))).....)))).))))..(((((.....(((.((((((........))))))...)))......))))).....)))))).)))))).)..))).......(((((.(((...(((((.((((((.((((.(((((...(((.((.....)))))((((((((.(((.(.((((....)))).).)))......(((..(....)..))).....)))))))).................)))))...)))))))))))))))))).)))))((((......))))(((((.(((.((.....)).))).)))))))))))).))))))((((((.((((....)).))))))))......)))).)))).......(((((...)))))....(((.(((((((.......))))))).))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((((.((((((...((((({({......,,},))}|||}}.,||,........||.,......,.,)))))))))).))}......((((.(((((((((((((((((...,((((.{..(((((.((((((((((((((((((..(((((..{((.((((.,.{{....))}.)))))))))))..,((..,,....},.}},..((((((.(((((((((....(((((((((((....)))}.}..,,.})))))..((((..(((....))))))).....((((((((((..(((((({........}},.((,(((((({{{,{((((,...|||}.((((((((((.((((...((((((((...(((((((.....,,..(((((((.((,((((((((((.,((((.{....}.)))}..)))))..})))).,.)).))))))),((((...((({.,...{((((((....,,...,,,.))))))),..,...})))...)))).((((({...(((((........(((((((((.(((((.(((((((((........))))))....(((((.....((((((.{....}.))))))......)))))....((((.((.((((((((((((.....(((((...)))))..(((((.((((({...})))))..)))))))))))))}}))....).)).))))....)))..)))))))))))))).....((((.......))))...((((((((((((..(((((((((,.(((....)))..,)))))))))(((....)))...,.(((((((((((.{((({.((((......)))).}}))}}.))))).))))))}.})))}.)),})))).....))))).....)))))))))))).)...))))))))))))..))))))))),,{{...,}}))))))))))..||,...((((((((({.,.........))))}})))))..{|||,{(((((....))))))))))...,,,|{.|,,|,,,,,}})}).,,.,))))).))).)))},)))........))).)))))).))))))........(((((((..,(,,((((.{.......}.))))....,,,{{......,|},},.{{|,,,.))}}))..)))))))...((((....))))..)))))))),(((((.((..((.((((((.(((.....((((((((...((((,,.,.{((((((((((({||,....({{{(({{....{{((..({((((({,{{{{,..|{((({...)))))))))}))))))))..,}}}}.|||||}}{{{{{..,||,,....|||.......,,,......((({.(((((((.{,...........(({...|}}((((((.({....}).)))))),......}),))))))).}))),,|})}})}.}))))))).))))),..,,...))))...))))))))......))).)))))).))..)).))))}..................)))))))}})).))))).}.))))((((......)))){((((.(((.((.....)).))).)))))))))))).)))))|((((((.((((....)).))))))))......)))).)))).......(((((...)))))....{{{.(((((({.......))))))).,},.