Basic Information

Symbol
AQP5
RNA class
mRNA
Alias
Aquaporin 5 Aquaporin-5 AQP-5 PPKB
Location (GRCh38)
12:49961811-49965682
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001651.4
Sequence length
1449.0 nt
GC content
0.6384

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-647.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -671.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 277.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001651.4 NCBI
AGGCCGCCAGCCUCGGAGUGGGCGCGGGACAGUGCGCGGCGCCCCGCAG… 1449 nt 0.6384
Summary

Aquaporin 5 (AQP5) is a water channel protein. Aquaporins are a family of small integral membrane proteins related to the major intrinsic protein (MIP or AQP0). Aquaporin 5 plays a role in the generation of saliva, tears and pulmonary secretions. AQP0, AQP2, AQP5, and AQP6 are closely related and all map to 12q13. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that intrapulmonary expression of the AQP5 was significantly suppressed at both gene and protein levels specifically in freshwater drowning (FWD) compared to saltwater drowning (SWD), postmortem immersion, and control groups [Hayashi et al. DOI:10.1007/S00414-008-0235-5]. A study in human lung tissue from forensic autopsy cases demonstrated that the AQP5 mRNA expression was significantly lower in smothering and choking groups compared to strangulation, sudden cardiac death, and acute brain injury groups [Wang et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2012.02.013].