Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001651.4
Sequence Length
1449 nt
GC Content
0.6384
AGGCCGCCAGCCUCGGAGUGGGCGCGGGACAGUGCGCGGCGCCCCGCAGCCAGGCCCCCGCCCCCGCCGCAUCCACCUCCUCCGCCGCCUGCGACCCAACGGGCGCCCCCCGCCGCGGCAGCUGCCGCCGGGCCCCCGCGGCCACCAUGAAGAAGGAGGUGUGCUCCGUGGCCUUCCUCAAGGCCGUGUUCGCAGAGUUCUUGGCCACCCUCAUCUUCGUCUUCUUUGGCCUGGGCUCGGCCCUCAAGUGGCCGUCGGCGCUGCCUACCAUCCUGCAGAUCGCGCUGGCGUUUGGCCUGGCCAUAGGCACGCUGGCCCAGGCCCUGGGACCCGUGAGCGGCGGCCACAUCAACCCCGCCAUCACCCUGGCCCUCUUGGUGGGCAACCAGAUCUCGCUGCUCCGGGCUUUCUUCUACGUGGCGGCCCAGCUGGUGGGCGCCAUUGCCGGGGCUGGCAUCCUCUACGGUGUGGCACCGCUCAAUGCCCGGGGCAAUCUGGCCGUCAACGCGCUCAACAACAACACAACGCAGGGCCAGGCCAUGGUGGUGGAGCUGAUUCUGACCUUCCAGCUGGCACUCUGCAUCUUCGCCUCCACUGACUCCCGCCGCACCAGCCCUGUGGGCUCCCCAGCCCUGUCCAUUGGCCUGUCUGUCACCCUGGGCCACCUUGUCGGAAUCUACUUCACUGGCUGCUCCAUGAACCCAGCCCGCUCUUUUGGCCCUGCGGUGGUCAUGAAUCGGUUCAGCCCCGCUCACUGGGUUUUCUGGGUAGGGCCCAUCGUGGGGGCGGUCCUGGCUGCCAUCCUUUACUUCUACCUGCUCUUCCCCAACUCCCUGAGCCUGAGUGAGCGUGUGGCCAUCAUCAAAGGCACGUAUGAGCCUGACGAGGACUGGGAGGAGCAGCGGGAAGAGCGGAAGAAGACCAUGGAGCUGACCACCCGCUGACCAGUGUCAGGCAGGGGCCAGCCCCUCAGCCCCUGAGCCAAGGGGGAAAAGAAGAAAAAGUACCUAACACAAGCUUCCUUUUUGCACAACCGGUCCUCUUGGCUGAGGAGGAGGAGCUGGUCACCCUGGCUGCACAGUUAGAGAGGGGAGAAGGAACCCAUGAUGGGACUCCUGGGGUAGGGGCCAGGGGCUGGGGUCUGCUGGGGACAGGUCUCUCUGGGACAGACCUCAGAGAUUGUGAAUGCAGUGCCAAGCUCACAGGCUGCAAGGGCCAGGCCAGAAAAGGGCGGGCCUGCAGCCUGCACCCCCCACCUUCCCCAACCCUUCCUCAAGAGCUGAAGGGAUCCCAGCCCCUAGGUGGGCAGAGGCAGACCCUCCCCAGAGCUCCUUAGGAAGAAGACAGACUGGUUCAUUGAAUGCCGCCUUAUUUAUUUCUGGUGAGGAUGCAUGCGUGGGGCUGCUGGUGUUUAGAGUGGGGGCUACCCAAUAAAUCACUGAUACUCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-647.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -671.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 277.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((...((((((((.((((....(.(((.((.(((.........))).))))))....)))).)))).))))...))((((((........))))))...((((..(((((....))))))))).....)))))).....(((((.((((.....))))..((((((....))))))......(((((((.(((((((.(((((((....(((((....(((((((((.((((((....).))))).(((((.((((((....((.((.((.(((....))).)).))..))...))))))))))))))))))))..)))))..))))).)).)))))........(((((((((.(((((((((....((.(((..((((((.....((((((((((..........((((((.((((.....))))))))))(((((....))))).......(((((...)))))......))))))))))))))))..))).))(((................))))))))))))...)))))))))(((((............))))))).))))))).)))))(((((((((......(((((...(((((((..(((((....)))))....((.(((((.(((((((..((((((.......(((((...........)))))(((.(((.((((((((...(((.....)))...((((.(((..((((....)))))))))))...))))))))..))))))((((((((((((((((((((....)))))).((((((.(((((.((.((((((((((..((((((.(((((..((.(((((((((((.........))).))))))...)).)).))).)).)).))))..).))))))))))).)))))....(((......)))(((.(((((..(((.(((.(((((((((((.((((....(((.(((((((((((..((((((...((((...........)))).))))))..........))))))))))).)))..)))).))))))..))))).)))))).)))))...)))..)))))).))))))))))).)))((((((.((((((((((((((((((((...((((((.((((.((((((((......))))))))..((((..((........))))))((((((((..((((.(.((......)).).)))))))))))).........))))))))))..(((((..(....)..)))))))))))))))))).)))..((....))...)))))))))).....)))))).....))))))).)).))).)).((((..(((((((.......)))))))..))))....))))))).))))).....))))))))).........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((,....}}}},(({(((((,(((((...{.((({((.,..}}}}.)),.,}},))))),)))}).{{{..{(((((((.,({((((((........})))))}..,,,(,,(((({....}}}}},}))}..,,))))),.....,..|.})))))))}))}}}|{((((({....})))))},|...(((((((.({(((((.(((((((....(((((....(((((((((.((((({....}.))))).(((((.((((((....{{.{(,((.(((....))),)),}}..))...))))))))))))))))))))..)))))..))))).)).)))))........(((((((((.(((((((((,,{{(({(((..((((((.....((((((((((..........((((({{((((.....)))))))))){({((,.,,|}|||,,.....{||||,.,)})))......))))))))))))))))..}}}.,,|||,...............,),)))))))))...)))))))))(((((............))))))).)))))))......(((((((((......(((((...(((((((,.(((((....)))))....((.(((((.(((((((.,((((((({{,,..{,{((.......|||,.||||{{{,({{,({{{{({(.||{{,.....))},,.((((.(((..((({....}))))))))))...}}))))}}..}))))}|||(((((((((((((((((....)))))).({{,,,.(((((.{(,((((((((((..((((((.(((((..((.(((((((((((.........))).))))))..,)).)).))).)).)).))))..).))))))))))).)))))...,|||},}.,.)),(((.(((((..(((.(((.(((((((((((.((((..,.(((.(((((((((((,,{{((((...{{({...........}))).))))))..........))))))))))).))).,)))).)))))},.))))).)))))).)))))...)))..,}})),.))))))))))).|||{(((((.((((((((((((((((((((...((((((.((((.((((((((......)))))))).,(({,..{|,,......))}}}|(((((((,.{((((.{,((......}),).))))))))))))}........)))))))))).{(((((..{....)..)))))))))))))))))).)))..((....))...)))))))))),},|||,.,)),....))))))).))}})).}).((((..(((((((.......)))))))..))))....))))))).))))).....)))))))))................,,.......
Back