Basic Information

Symbol
AQP7
RNA class
mRNA
Alias
Aquaporin 7 AQPap AQP7L AQP9 Aquaglyceroporin-7 Aquaporin Adipose Aquaporin-7 Aquaporin-7-Like GLYCQTL AQP-7
Location (GRCh38)
9:33383179-33402682
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001170.3
Sequence length
3064.0 nt
GC content
0.5349

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1179.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1234.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1019.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001170.3 NCBI
GGAGGAGCAGGAGCAGCGCUCGAGGCCGCCCUGGGAGAGCUGAGAGGCA… 3064 nt 0.5349
NM_001318156.2 NCBI
GGAGGAGCAGGAGCAGCGCUCGAGGCCGCCCUGGGAGAGCUGAGAGGCA… 2887 nt 0.5345
NM_001318157.2 NCBI
GGAGGAGCAGGAGCAGCGCUCGAGGCCGCCCUGGGAGAGCUGAGAGGCA… 1981 nt 0.5775
NM_001318158.2 NCBI
GGAGGAGCAGGAGCAGCGCUCGAGGCCGCCCUGGGAGAGCUGAGAGGCA… 1663 nt 0.5767
NM_001376191.1 NCBI
GGAGGAGCAGGAGCAGCGCUCGAGGCCGCCCUGGGAGAGCUGAGAGGCA… 3201 nt 0.5351
NM_001376192.1 NCBI
GGAGGAGCAGGAGCAGCGCUCGAGGCCGCCCUGGGAGAGCUGAGAGGCA… 3005 nt 0.5338
NM_001376193.1 NCBI
GGAGGAGCAGGAGCAGCGCUCGAGGCCGCCCUGGGAGAGCUGAGAGGCA… 3142 nt 0.5341
Summary

This gene encodes a member of the aquaporin family of water-selective membrane channels. The encoded protein localizes to the plasma membrane and allows movement of water, glycerol and urea across cell membranes. This gene is highly expressed in the adipose tissue where the encoded protein facilitates efflux of glycerol. In the proximal straight tubules of kidney, the encoded protein is localized to the apical membrane and prevents excretion of glycerol into urine. The encoded protein is present in spermatids, as well as in the testicular and epididymal spermatozoa suggesting an important role in late spermatogenesis. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding different isoforms. This gene is located adjacent to a related aquaporin gene on chromosome 9. Multiple pseudogenes of this gene have been identified. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in Wistar rats demonstrated that severe scald injury induced significant myocardial edema and synchronized upregulation of the AQP7 mRNA, with gene microarray analysis showing a 2.20-fold increase in the immediate fluid resuscitation group and a 3.73-fold increase in the delayed fluid resuscitation group at 12 hours post-injury compared to controls [Li et al. DOI:10.3906/sag-1401-149]. A study in mice and human forensic autopsy cases demonstrated that intrapulmonary aquaporin-5 (AQP5) expression is significantly suppressed in freshwater drowning compared to saltwater drowning and other causes of death, providing a potential tool for differentiation [Hayashi et al. DOI:10.1007/S00414-008-0235-5]. In a separate evaluation of human mRNA markers for blood identification, the AQP7 showed cross-reactivity with vaginal secretion and low expression in saliva, leading to its exclusion from further study in a multiplex body fluid identification system [Haas et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2010.09.006].