Basic Information

Symbol
ARF4
RNA class
mRNA
Alias
ARF GTPase 4 ARF2 ADP Ribosylation Factor 4 ADP-Ribosylation Factor 2 ADP-Ribosylation Factor 4
Location (GRCh38)
3:57571363-57598220
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001660.4
Sequence length
1596.0 nt
GC content
0.3954

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-422.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -454.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 330.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001660.4 NCBI
AGUCGCCUAGCAGGUCCUCUACCGGCUUAUUCCUGUGCCGGAUCUUCAU… 1596 nt 0.3954
Summary

This gene is a member of the human ARF gene family whose members encode small guanine nucleotide-binding proteins that stimulate the ADP-ribosyltransferase activity of cholera toxin and play a role in vesicular trafficking and as activators of phospholipase D. The gene products include 5 ARF proteins and 11 ARF-like proteins and constitute one family of the RAS superfamily. The ARF proteins are categorized as class I, class II and class III; this gene is a class II member. The members of each class share a common gene organization. The ARF4 gene spans approximately 12kb and contains six exons and five introns. This gene is the most divergent member of the human ARFs. Conflicting map positions at 3p14 or 3p21 have been reported for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue demonstrated that the ARF4 was down-regulated in the motor cortex of alcoholic cases compared to controls, as identified through cDNA microarray profiling and validated by Bayesian statistical analysis and hierarchical clustering [Liu et al. DOI:10.1111/J.1471-4159.2004.02570.X].