Basic Information

Symbol
ARG1
RNA class
mRNA
Alias
Arginase 1 Arginase-1 Liver-Type Arginase Arginase, Liver Type I Arginase EC 3.5.3.1
Location (GRCh38)
6:131470832-131584332
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000045.4
Sequence length
1447.0 nt
GC content
0.4257

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-383.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -410.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 460.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000045.4 NCBI
GUCACUGAGGGUUGACUGACUGGAGAGCUCAAGUGCAGCAAAGAGAAGU… 1447 nt 0.4257
NM_001244438.2 NCBI
GUCACUGAGGGUUGACUGACUGGAGAGCUCAAGUGCAGCAAAGAGAAGU… 1471 nt 0.4215
NM_001369020.1 NCBI
GUCACUGAGGGUUGACUGACUGGAGAGCUCAAGUGCAGCAAAGAGAAGU… 1192 nt 0.4119
Summary

Arginase catalyzes the hydrolysis of arginine to ornithine and urea. At least two isoforms of mammalian arginase exist (types I and II) which differ in their tissue distribution, subcellular localization, immunologic crossreactivity and physiologic function. The type I isoform encoded by this gene, is a cytosolic enzyme and expressed predominantly in the liver as a component of the urea cycle. Inherited deficiency of this enzyme results in argininemia, an autosomal recessive disorder characterized by hyperammonemia. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in human burn patients demonstrated that early expression of the ARG1 gene in peripheral blood mononuclear cells was significantly increased compared to healthy controls and strongly correlated with burn severity, acute lung injury, pulmonary infection, and mortality [Mahung et al. DOI:10.1097/TA.0000000000003602].