Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000045.4
Sequence Length
1447 nt
GC Content
0.4257
GUCACUGAGGGUUGACUGACUGGAGAGCUCAAGUGCAGCAAAGAGAAGUGUCAGAGCAUGAGCGCCAAGUCCAGAACCAUAGGGAUUAUUGGAGCUCCUUUCUCAAAGGGACAGCCACGAGGAGGGGUGGAAGAAGGCCCUACAGUAUUGAGAAAGGCUGGUCUGCUUGAGAAACUUAAAGAACAAGAGUGUGAUGUGAAGGAUUAUGGGGACCUGCCCUUUGCUGACAUCCCUAAUGACAGUCCCUUUCAAAUUGUGAAGAAUCCAAGGUCUGUGGGAAAAGCAAGCGAGCAGCUGGCUGGCAAGGUGGCAGAAGUCAAGAAGAACGGAAGAAUCAGCCUGGUGCUGGGCGGAGACCACAGUUUGGCAAUUGGAAGCAUCUCUGGCCAUGCCAGGGUCCACCCUGAUCUUGGAGUCAUCUGGGUGGAUGCUCACACUGAUAUCAACACUCCACUGACAACCACAAGUGGAAACUUGCAUGGACAACCUGUAUCUUUCCUCCUGAAGGAACUAAAAGGAAAGAUUCCCGAUGUGCCAGGAUUCUCCUGGGUGACUCCCUGUAUAUCUGCCAAGGAUAUUGUGUAUAUUGGCUUGAGAGACGUGGACCCUGGGGAACACUACAUUUUGAAAACUCUAGGCAUUAAAUACUUUUCAAUGACUGAAGUGGACAGACUAGGAAUUGGCAAGGUGAUGGAAGAAACACUCAGCUAUCUACUAGGAAGAAAGAAAAGGCCAAUUCAUCUAAGUUUUGAUGUUGACGGACUGGACCCAUCUUUCACACCAGCUACUGGCACACCAGUCGUGGGAGGUCUGACAUACAGAGAAGGUCUCUACAUCACAGAAGAAAUCUACAAAACAGGGCUACUCUCAGGAUUAGAUAUAAUGGAAGUGAACCCAUCCCUGGGGAAGACACCAGAAGAAGUAACUCGAACAGUGAACACAGCAGUUGCAAUAACCUUGGCUUGUUUCGGACUUGCUCGGGAGGGUAAUCACAAGCCUAUUGACUACCUUAACCCACCUAAGUAAAUGUGGAAACAUCCGAUAUAAAUCUCAUAGUUAAUGGCAUAAUUAGAAAGCUAAUCAUUUUCUUAAGCAUAGAGUUAUCCUUCUAAAGACUUGUUCUUUCAGAAAAAUGUUUUUCCAAUUAGUAUAAACUCUACAAAUUCCCUCUUGGUGUAAAAUUCAAGAUGUGGAAAUUCUAACUUUUUUGAAAUUUAAAAGCUUAUAUUUUCUAACUUGGCAAAAGACUUAUCCUUAGAAAGAGAAGUGUACAUUGAUUUCCAAUUAAAAAUUUGCUGGCAUUAAAAAUAAGCACACUUACAUAAGCCCCCAUACAUAGAGUGGGACUCUUGGAAUCAGGAGACAAAGCUACCACAUGUGGAAAGGUACUAUGUGUCCAUGUCAUUCAAAAAAUGUGAUUUUUUAUAAUAAACUCUUUAUAACAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-383.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -410.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 460.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......((((.((((.(((.(((((..((((....(((((((((((((.((((((((.((.((((((.((((..(((((.((((((.((((.(((((((((((((....((((........)))).......))))......)))))))))(((((((((.(((((..((((..(((.......(((((((((..((((((((.((((((.(((.(((((....((((.....((((.((.(((((.....))))).......)).))))))))..)))))((.((.((((((.(((.((((((((((..(((((..((((((((.((((..((((((((.(((.((((((...(((((....)))))......)))))).)))..(((((((((((.....(((((((((((((((((.((((.((((((.((..........((((((..........))))))....((((.((....))))))((((((((((....))).......)))))))....)).))))..)).)))).)))))))))))))..........(((((..((((...)))).)))))..))))...)))))))))))....))))....((((...(((.(((.(((((((....))).)))).))).)))...))))((((....((((..((((.(......).))))..))))....))))...........))))..)))).)))..)))))....)))))...)))...))))))).).)))))))).)).))...........)))))))))..))))........)))).))))))))).......)))........(((.((((.(((..((.....))..))).))))..)))....((((........))))...))))..))))).)))...)).)))))))).)))))))))))....)))).))))))))..(((((((((.(((.........))).))))))..)))..........(((((((....))).))))....))))).)))..)))))).(((((....)))))..)))))))..)))).))))).)))......(.((((.(((((((........(((((((((((((((((((..((((((.......((((((........))))))))))))........(((((.........))))).)))))....)))).))))..)))))).........))))))))))).)....(((((.((((.............(((.(((....((((....))))..))))))(((((.......)))))....)))))))))(((.(((.((.((((...........)))))).))).)))..)))).)))).....)))))...((((((........)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......((((.((((((((.{((({.,((((,{{,{{,,,,.{{{{{{.,||,|{{{|{{(((((((.((((..{((((,{({(((,({({,(((((((((((((.,..((((........)))).......))))......)))))))))|{{{{|{((.(((((..((({..,,,.......(((((((({,,{({,{(((,((((((,((({(((((....((((.....((((.{({(({{,.....,}}},.....,,)).))))))))..|||,|((.,,.{|||{|,|||,||||{|||||..(((((.,((((((((.((((..((((,,,,,(((.((((((,..(((({....}))))......)))))).))),.(((((((((((.....{{,,(((((((((((((.((((.(({{((,{{....,.....((((((..........))))))....{(((.((....)))))|(((((((({{....}},......})))))))}...,}.))))..)).)))).)))))))))))))..,,...,,.(((((..((((...}}}}.)))))..))}}.,.))))))))))).,..||||.,..{(((,,.({{.{{{.{{{{.,,...,})),))}}.})).))),..)}},((((....((((..((((.(......,.))))..))))....))))...........))))..)))).)))..)))))..,.)))))...}))..,))))))),),)}}}}))},||||}...}}}}}.,,))}}))}||,.}}},.{{{{,..,)))})}}))}})),......}))........{{{.{{||}|||.,{{.....}}..|||.,}}|..})).,..((((,.......))))...}}}}..})}}}.}})...}}.}})}}))).)))))}))))),,.,}))).))))))))}}(({|((({{.{||...{{{.,{|||{||,}},..,||,,.,..,...,,||||,....}}}|||....,,),,,)})))}})))),,.{((((....))))}..,}}}}}}.,}},|{|||||||,|||||{{({({,,.{|||||.}}}}....||}}}}|||.,|||,,,.,,}}}}},,..,{{{{((((((........)))))).},))}}..,,,...,,|||||||..,,,,,,|{||,,.,{{{||||.||||,.,,,,,||,.,,.}},}}}})},}})).,...,{{|||,|||},......,}}}}}|||.||,....|{||,...}}},..,,}}},(((((.......))))).((((((....)))))),,,.||,|,,(,,,{{||....,})))}})))})))).)))).)))).....))))},,.{(((((........)))))}.,,..
Back