Basic Information

Symbol
ARHGAP1
RNA class
mRNA
Alias
Rho GTPase Activating Protein 1 CDC42GAP P50rhoGAP RhoGAP Rho-Related Small GTPase Protein Activator Rho-Type GTPase-Activating Protein 1 GTPase-Activating Protein RhoGAP Rho GTPase-Activating Protein 1 CDC42 GTPase-Activating Protein RHOGAP1 GTPase-Activating Protein RhoOGAP GTPase-Activating Protein, Rho, 1 P50-RhoGAP
Location (GRCh38)
11:46677075-46700977
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004308.5
Sequence length
3395.0 nt
GC content
0.5729

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1283.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1339.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 954.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004308.5 NCBI
GUUCCACCGCGGAGCCGGAUGUUUGCCGAGCCUUGACAGGCGUGGCAGA… 3395 nt 0.5729
Summary

This gene encodes a member of a large family of proteins that activate Rho-type guanosine triphosphate (GTP) metabolizing enzymes. The encoded protein contains a SRC homology 3 domain and interacts with Bcl-2-associated protein family members. [provided by RefSeq, Aug 2012]

Forensic Context

A study in human ischemic cardiomyopathy (ICM) patients demonstrated that the ARHGAP1 is increased in cardiomyocytes in both single-nucleus RNA sequencing and proteomic data [Simonson et al. DOI:10.1016/j.celrep.2023.112086]. A study in humans demonstrated that the ARHGAP1 mRNA exhibited differential expression in pericontusional brain tissue following traumatic brain injury, showing down-regulation by 19% in patient T3 and 30% in T4, and up-regulation by 58% in patient T7 [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].