Basic Information

Symbol
ACAA1
RNA class
mRNA
Alias
Acetyl-CoA Acyltransferase 1 Lnc-Myd88 Peroxisomal 3-Oxoacyl-Coenzyme A Thiolase 3-Ketoacyl-CoA Thiolase, Peroxisomal Acetyl-Coenzyme A Acyltransferase 1 Peroxisomal 3-Oxoacyl-CoA Thiolase Acetyl-CoA C-Myristoyltransferase Beta-Ketothiolase EC 2.3.1.16 PTHIO ACAA Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Testicular Tissue Protein Li 197 Acetyl-CoA Acyltransferase EC 2.3.1.155 EC 2.3.1.9 EC 2.3.1 THIO
Location (GRCh38)
3:38103129-38137647
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001607.4
Sequence length
1699.0 nt
GC content
0.5833

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-708.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -738.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 473.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130410.2 NCBI
GAGAUGUGGUUCUGCGCGUGUGCGGACGGCUGUCUGUUAACUCCGCGGU… 1420 nt 0.5873
NM_001607.4 NCBI
GAGAUGUGGUUCUGCGCGUGUGCGGACGGCUGUCUGUUAACUCCGCGGU… 1699 nt 0.5833
Summary

This gene encodes an enzyme operative in the beta-oxidation system of the peroxisomes. Deficiency of this enzyme leads to pseudo-Zellweger syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ACAA1 gene, involved in fatty acid degradation, was up-regulated by Gentiana dahurica Fisch ethanol extract intervention in a model of alcoholic liver disease [Cao et al. DOI:10.1016/J.Jep.2020.113422].