Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001130410.2
Sequence Length
1420 nt
GC Content
0.5873
GAGAUGUGGUUCUGCGCGUGUGCGGACGGCUGUCUGUUAACUCCGCGGUCAGUUCCCGGACUGGUGGCUGGUCUGCAGGGUUGACCUGCGCAAUGCAGAGGCUGCAGGUAGUGCUGGGCCACCUGAGGGGUCCGGCCGAUUCCGGCUGGAUGCCGCAGGCCGCGCCUUGCCUGAGCGGUGCCCCGCAGGCCUCGGCCGCGGACGUGGUGGUGGUGCACGGGCGGCGCACGGCCAUCUGCCGGGCGGGCCGCGGCGGCUUCAAGGACACCACCCCCGACGAGCUUCUCUCGGCAGUCAUGACCGCGGUUCUCAAGGACGUGAAUCUGAGGCCGGAACAGCUGGGGGACAUCUGUGUCGGAAAUGUGCUGCAGCCUGGGGCCGGGGCAAUCAUGGCCCGAAUCGCCCAGUUUCUGAGUGACAUCCCGGAGACUGUGCCUUUGUCCACUGUCAAUAGACAGUGUUCGUCGGGGCUACAGGCAGUGGCCAGCAUAGCAGGUGGCAUCAGAAAUGGGUCUUAUGACAUUGGCAUGGCCUGUGGGAUAACCUCUGAGAAUGUGGCUGAGCGGUUUGGCAUUUCACGGGAGAAGCAGGAUACCUUUGCCCUGGCUUCCCAGCAGAAGGCAGCAAGAGCCCAGAGCAAGGGCUGUUUCCAAGCUGAGAUUGUGCCUGUGACCACCACGGUCCAUGAUGACAAGGGCACCAAGAGGAGCAUCACUGUGACCCAGGAUGAGGGUAUCCGCCCCAGCACCACCAUGGAGGGCCUGGCCAAACUGAAGCCUGCCUUCAAGAAAGAUGGUUCUACCACAGCUGGGCUGACAGUGAGUGACGUGGACAUCUUCGAGAUCAAUGAGGCCUUUGCAAGCCAGGCUGCCUACUGUGUGGAGAAGCUACGACUCCCCCCUGAGAAGGUGAACCCCCUGGGGGGUGCAGUGGCCUUAGGGCACCCACUGGGCUGCACUGGGGCACGACAGGUCAUCACGCUGCUCAAUGAGCUGAAGCGCCGUGGGAAGAGGGCAUACGGAGUGGUGUCCAUGUGCAUCGGGACUGGAAUGGGAGCCGCUGCCGUCUUUGAAUACCCUGGGAACUGAGUGAGGUCCCAGGCUGGAGGCGCUACGCAGACAGUCCUGCUGCUCUAGCAGCAAGGCAGUAACACCACAAAAGCAAAACCACAUGGGAAAACUCAGCACUGGUGGUGGUGGCAGUGGACAGAUCAAGGCACUUCAACUCAUUUGGAAAAUGUGAACACUGAUGACAUGGUAUAGGAGUGGGUGGGGUGUUGAGCCACCCAUCAGACCCUCUUUAGCUGUGCAAGAUAAAAGCAGCCUGGGUCACCCAGGCCACAAGGCCAUGGUUAAUUCUUAAGGCAAGGCAAAUCCAUGGAUGAGAAGUGCAAUGGGCAUAGUAAAAGUGCAUGAAUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-592.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -617.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((.(((...((((.(....(((((((((((((((.((((((((((.((.....)).)))))).)))).))))))))((((.....))))..(((.(((((((.((..((((...((.((.(((((((((....))))))))).)).))))))..)).))))))))))((.(((((((.(((((..(((.(((.((.((((((.((((.(.....).)))).))))))))))))))))))))))).))).))..(((((((((((((((((((..(((((((((.((..((.((.((((((.(......).))).))).)).))..)).)))))))))...)).)))))).....((((((...(((((((((((((((......((((((((((.((((((((.((....((((((.((.(((((((..(((((((((((....)))))))........((((((.....)))))).((...))....(((.(((....))))))....))))..))))))).)).)))))).....)).))))....)))).))))))))((.((((....)))).)).))......))))))))))..)))))......))))))..(((((.......)))))(((((......)))))(((((((.......((((((....(((((((..((((((...((......))...))).))).(((((....)))))(((((((..(((((((((..((((((((......((.((((....((..(((.((((..((((((((.((((......))))..)))..))))))))))))..))......)))).)).....))))))))..))).)).))))....(((((..(.((((((..((..((....))..)))))))).)..)))))......((((((...))).))).))))))).......)))))))((((((((...))))...)))))))))).....))))))).)).))))))))).........(((((((...((.((((.(((.(((...........(((((((.((.....)).))))))).))).)))))).).))..)))))))(((((....))))).)))))))....)))))...))).))))))))........(((((((((((..((((((..((((.(...(((..((((((((.(((((((.....((((.(.......).)))).......))))))))))))))))))))))))))))).))).......(((((((............(((((((...)))))))......(((.((.((........)).)).)))....(((((.((.....)).).)))))))))))...))))).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((((.(((...((((.{....(((((((((((((((.((((((((((.((,...,)).)))))).)))).))))))))((((,...,))))..(((,(((((((.((,.((((.{{({.((.(((((((((....))))))))).)).||))||,.||,}|||||||||({.(((((((.((((,,.(((.(((.((.((((((.((((.(.....).)))).))))))))))))))))))))))).))).})..(({{,,,,{{((({,,,{(({,,((,((((..(((.((,(((({(((....}}}})})..})))).))))}}.{|||||,||,{{{((((,,,}}},..}||,||.|||||||((((((((,{,..,.})}))),,.{{((.(((((((({{(.,..{{{{||,||,|||{{{{..{{{{(((((((....))))))),,}}|,}}||||{|,,||,|{{{{{,.|...}}.}})})).{{{,...}}}|||....)))}..)))}))),)),)))})).,})))},))|..}}}))}.}))||||||{{{({((,{,||,||{{{((....{{{{(((,(({{((({,,.((.....,|,}|..}|||||}}.}}}})))))})))),..}})),)},,})))),..||||..,,((({|{.((((((({.(((((({,.{{,.,,,.,}..,|||,||}.(((((....)))))(((((((..(((((((((.,((((((((......((,((((....((..({((((((..((((((((.((((......))))..)))..))))))))))))..))......)))).)),,...)))))))).,))}.)).)))).,,.(((((..(.((((((...{..((....}},,)})))))).)..))))).,,...((((((...))).))).)))))))......})))))},{{{{{(({...}}}}...}))}{{|||},...,,}}),},})).,)))))))).))}.)}}}|||||||...||}{{|||||||||||||,.,.....{(((((|,({.....))}))))))),))},)))))}.),))}.}}))))}(((((....))))).)))))))....}))))...))).))))))))....,,,.((((((((((({,(((((({.,{{{.....{({..(((((((,,(((((((.....((((.{.......}.)))).......))))))))))))))))}}))))))))))).}}},...,,.(((((((.........|,.(((((((...))))))),.....|((.({|{,...,{{{.,,.||.|}}....||{||.,|,,,,.}},).,)))))))))).,,))))).))).,,,.
Back