Basic Information

Symbol
ARHGEF4
RNA class
mRNA
Alias
Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor 4 APC-Stimulated Guanine Nucleotide Exchange Factor 1 KIAA1112 ASEF1 STM6 ASEF Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor (GEF) 4 APC-Stimulated Guanine Nucleotide Exchange Factor SMIM39 Asef1 GEF4 Asef
Location (GRCh38)
2:130836914-131047263
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001367493.1
Sequence length
6735.0 nt
GC content
0.5988

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2848.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2960.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1484.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001367493.1 NCBI
GUAGUGCUGCGGCCGGGCUCCGGGCGUCCCGGCGGCCACCAUGCUCAGC… 6735 nt 0.5988
NM_001375900.1 NCBI
GUAGUGCUGCGGCCGGGCUCCGGGCGUCCCGGCGGCCACCAUGCUCAGC… 3222 nt 0.5999
NM_001375901.1 NCBI
GUAGUGCUGCGGCCGGGCUCCGGGCGUCCCGGCGGCCACCAUGCUCAGC… 3247 nt 0.6015
NM_001375902.1 NCBI
GUGCGCGCGUGCGUGAGCGCGUGCCGACCGGGCCCGCGACCCGCACUGG… 3222 nt 0.6344
NM_001375903.1 NCBI
GUGCGCGCGUGCGUGAGCGCGUGCCGACCGGGCCCGCGACCCGCACUGG… 3165 nt 0.6354
NM_001375904.1 NCBI
GUGCGCGCGUGCGUGAGCGCGUGCCGACCGGGCCCGCGACCCGCACUGG… 3305 nt 0.6345
NM_001395416.1 NCBI
AGGCGCCCCGCCUCUCCCCGGGCGCUGCGGGCCACCGGCUCGGCCCUGU… 2859 nt 0.6208
NM_015320.4 NCBI
GUAGUGCUGCGGCCGGGCUCCGGGCGUCCCGGCGGCCACCAUGCUCAGC… 6400 nt 0.5980
Summary

Rho GTPases play a fundamental role in numerous cellular processes that are initiated by extracellular stimuli that work through G protein coupled receptors. The protein encoded by this gene may form complex with G proteins and stimulate Rho-dependent signals. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jun 2013]

Forensic Context

A study in humans analyzed peripheral blood mRNA expression profiles from 127 Chinese individuals and identified 79 differentially expressed genes (DEGs), including the ARHGEF4 which was identified for the first time as an age-related gene involved in the Rho GTPase signaling pathway [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].