Basic Information

Symbol
ARMC5
RNA class
mRNA
Alias
Armadillo Repeat Containing 5 Armadillo Repeat-Containing Protein 5 FLJ13063 AIMAH2
Location (GRCh38)
16:31458080-31467172
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001105247.2
Sequence length
3108.0 nt
GC content
0.6721

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1515.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1565.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1066.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001105247.2 NCBI
GCGGAGUCUGAGGCCCGAGCCAAGAUGGCGGCUGCGAAGCCAACCCUCA… 3108 nt 0.6721
NM_001288767.2 NCBI
GGCUUUUAGCGGUGUGAGCGCGCUGGUGCUGGAUCAGGUUGGAGCUGAC… 3462 nt 0.6649
NM_001301820.1 NCBI
AUGCCAGCUCCUGAGCUCACGAGCACGUCCAGAGCGGAGGACACUCGGG… 3664 nt 0.6657
NM_024742.2 NCBI
UCCUCUGACCGAGCGAGGGCUCCCCGUCUGCGGCGCGGUCAGGACCCCG… 4707 nt 0.6435
Summary

This gene encodes a member of the ARM (armadillo/beta-catenin-like repeat) superfamily. The ARM repeat is a tandemly repeated sequence motif with approximately 40 amino acid long. This repeat is implicated in mediating protein-protein interactions. The encoded protein contains seven ARM repeats. Mutations in this gene are associated with primary bilateral macronodular adrenal hyperplasia, which is also known as ACTH-independent macronodular adrenal hyperplasia 2. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.