Basic Information

Symbol
ARSG
RNA class
mRNA
Alias
Arylsulfatase G KIAA1001 N-Sulfoglucosamine-3-Sulfatase ASG EC 3.1.6.15 EC 3.1.6.1 EC 3.1.6.4 EC 3.1.6 USH4
Location (GRCh38)
17:68259182-68422731
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001267727.2
Sequence length
2554.0 nt
GC content
0.5329

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-923.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -973.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 681.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001267727.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 2554 nt 0.5329
NM_001352899.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 2985 nt 0.5243
NM_001352900.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 4555 nt 0.5012
NM_001352901.2 NCBI
ACUUUGCUGCACCGGCAGCAGCGGCAGCAACAGCAUCCGCGUUGCGCGA… 4530 nt 0.4971
NM_001352902.2 NCBI
ACUUUGCUGCACCGGCAGCAGCGGCAGCAACAGCAUCCGCGUUGCGCGA… 3261 nt 0.5274
NM_001352903.2 NCBI
GUCGCUGUCCCCGGCUGCGCCCAGGCCGGCGGGCCCAGCAGCUGCGAAC… 4651 nt 0.5029
NM_001352904.2 NCBI
GUCGCUGUCCCCGGCUGCGCCCAGGCCGGCGGGCCCAGCAGCUGCGAAC… 3165 nt 0.5333
NM_001352905.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 3064 nt 0.5062
NM_001352906.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 2982 nt 0.5241
NM_001352907.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 4468 nt 0.4955
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the sulfatase enzyme family. Sulfatases hydrolyze sulfate esters from sulfated steroids, carbohydrates, proteoglycans, and glycolipids. They are involved in hormone biosynthesis, modulation of cell signaling, and degradation of macromolecules. This protein displays arylsulfatase activity at acidic pH, as is typical of lysosomal sulfatases, and has been shown to localize in the lysosomes. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012]

Forensic Context

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