Basic Information

Symbol
ARSG
RNA class
mRNA
Alias
Arylsulfatase G KIAA1001 N-Sulfoglucosamine-3-Sulfatase ASG EC 3.1.6.15 EC 3.1.6.1 EC 3.1.6.4 EC 3.1.6 USH4
Location (GRCh38)
17:68259182-68422731
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001267727.2
Sequence length
2554.0 nt
GC content
0.5329

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-923.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -973.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 681.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352909.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 2701 nt 0.5024
NM_001352910.2 NCBI
GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUG… 3381 nt 0.5152
NM_014960.5 NCBI
GUCGCUGUCCCCGGCUGCGCCCAGGCCGGCGGGCCCAGCAGCUGCGAAC… 4654 nt 0.5030
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the sulfatase enzyme family. Sulfatases hydrolyze sulfate esters from sulfated steroids, carbohydrates, proteoglycans, and glycolipids. They are involved in hormone biosynthesis, modulation of cell signaling, and degradation of macromolecules. This protein displays arylsulfatase activity at acidic pH, as is typical of lysosomal sulfatases, and has been shown to localize in the lysosomes. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012]

Forensic Context

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