Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001352909.2

Sequence Length

2701 nt

GC Content

0.5024

GCCGUCCCACGUGGACCUGAGCCGCGCCGGUCGCGCGCCCGCCAGCCUGCCGCCUGGGCUGGGGGUCACGAAAGGAAACCUUACAGAAACAUGAAGCCCUCAACCAUCUGCUACUCAGUUAUUCGGGGCUGACGGCGGCUUCUAGAACAUCCAGGUGUUCUGCAGAUGCGAGAACUCAUCCUGUAGUCACCAGAUGGAGUCCCAAACAGCCAAGCAGAUGUAAGGCCUGUGCUGUGGCUCUGAGGCCCUGAAUACAGAAGGGUCACUUUCUUAGUGGCCAAAGAGCAGUUGUUGACAUUGAUGUCUAAUUAUUGAACACGACCAGUCAUUUUACUGAGCUGCGGUGAGGAAACACUGACCAUAGAAGAUCAAGCCAAAUGAGGGAUUGCAAAUUUCCUGAUUCUUUUGAAUUAGGAUUCCAGAUGGGGGCCUCAUUUCUACAGCCCCCAACAUUCCUAUAGCCGUUAUCACUGCCAUCACCACUGCCACCAGCAUCUUCUUGCAGAUUCCACCCCUGCUCCCCAGAGACUUCCUGCUUUGAAAGUGAGCAGAAAGGAAGCUCUCAGAAAAAUCUCUAGUGGUGGCUGCCGUCGCUCCAGACAAUCGGAAUCCUGCCUUCACCACCAUGGGCUGGCUUUUUCUAAAGGUUUUGUUGGCGGGAGUGAGUUUCUCAGGAUUUCUUUAUCCUCUUGUGGAUUUUUGCAUCAGUGGGAAAACAAGAGGACAGAAGCCAAACUUUGUGAUUAUUUUGGCCGAUGACAUGGGGUGGGGUGACCUGGGAGCAAACUGGGCAGAAACAAAGGACACUGCCAACCUUGAUAAGAUGGCUUCGGAGGGAAUGAGGUUUGUGGAUUUCCAUGCAGCUGCCUCCACCUGCUCACCCUCCCGGGCUUCCUUGCUCACCGGCCGGCUUGGCCUUCGCAAUGGAGUCACACGCAACUUUGCAGUCACUUCUGUGGGAGGCCUUCCGCUCAACGAGACCACCUUGGCAGAGGUGCUGCAGCAGGCGGGUUACGUCACUGGGAUAAUAGGUUUUGAUUACUACUUUGGAAUCCCAUAUAGCCAUGAUAUGGGCUGUACUGAUACUCCAGGCUACAACCACCCUCCUUGUCCAGCGUGUCCACAGGGUGAUGGACCAUCAAGGAACCUUCAAAGAGACUGUUACACUGACGUGGCCCUCCCUCUUUAUGAAAACCUCAACAUUGUGGAGCAGCCGGUGAACUUGAGCAGCCUUGCCCAGAAGUAUGCUGAGAAAGCAACCCAGUUCAUCCAGCGUGCAAGCACCAGCGGGAGGCCCUUCCUGCUCUAUGUGGCUCUGGCCCACAUGCACGUGCCCUUACCUGUGACUCAGCUACCAGCAGCGCCACGGGGCAGAAGCCUGUAUGGUGCAGGGCUCUGGGAGAUGGACAGUCUGGUGGGCCAGAUCAAGGACAAAGUUGACCACACAGUGAAGGAAAACACAUUCCUCUGGUUUACAGGAGACAAUGGCCCGUGGGCUCAGAAGUGUGAGCUAGCGGGCAGUGUGGGUCCCUUCACUGGAUUUUGGCAAACUCGUCAAGGGGGAAGUCCAGCCAAGCAGACGACCUGGGAAGGAGGGCACCGGGUCCCAGCACUGGCUUACUGGCCUGGCAGAGUUCCAGUUAAUGUCACCAGCACUGCCUUGUUAAGCGUGCUGGACAUUUUUCCAACUGUGGUAGCCCUGGCCCAGGCCAGCUUACCUCAAGGACGGCGCUUUGAUGGUGUGGACGUCUCCGAGGUGCUCUUUGGCCGGUCACAGCCUGGGCACAGGGUGCUGUUCCACCCCAACAGCGGGGCAGCUGGAGAGUUUGGAGCCCUGCAGACUGUCCGCCUGGAGCGUUACAAGGCCUUCUACAUUACCGCUGGAAAAGAAGUGCCUGCUCUCAACUCAAGAACCAAUGGCAUCAUCAGUGGAAUUCAAAGGAAGUCCCAUGAUUCUAAAUGAUUCUCAUCUUGGUAUUUAAAGUAUUGCAUGUCAAACUUUAGGUAAGUUAACAGUGAUUUAUAAAAUGCAGUUCCCUCUGAGUUGAUUAAUGUCUCAGGUUACGCUUUCCGAUUUUCAAAAAUAGAAAGACAUCUUCUUUGUACAGCAAAUGCCCUAUGCUCCUACAAAAGGGAAGCAUUUAUACCACUUUUAUUAGCAUUUUCAAACAAGAAAGAGGUCUUGCUGGGGAAGAAACCAUGAACUGUUCAAUGAUCUGCAUUGCUGUGUGGUAUGGAACGCUCCCUCAAUAUCCCAUAAAAGGUGGUCAGCUCUGUGACCACCUCCUCCAUACUGGGAGGUCUGCAGUUGGCAGGACUUUCAUGGAGAUUUCCACCCUUGACUGCUCAGAGCAGACUGCUGUGCUAGCAGGAAAUUAACUUCGAGCCCCUGUCUGGCCAAGCUCUUUAAAGGAAACAGCCUGCAAUCUCUGACACAACAGGAACGGGCAUGACACAAACAGACAGAAAGAAGGAAAUUUACAGCUGCGUUAGAUACCAAGUGUGAGGCAACAGGCGAACUCUGUAUAGCUAAUUUACUUGUAGUUUAUGAAGUCAAAAUGCAUUCAGGAUUUGUGUGCUGAAGACAAUUAGACGAGUGAUUGUGUCUUCCUUCUGUACCCAGCAAGGAUUUAUAAAAUCAACAGUCACAGUUUCCAUCUUAUUUCUUUGUUCAGAAAAUAAACUAGAGGAUGAGAACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-943.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -993.16

Frequency: 0.0000

Diversity: 477.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((...(((((.......)))))((..(((.(.((((.(((((((.......)))))))))))).)))..))...................((((((.......(((.....)))......)))))))))))).((.((((((((((....)))))))..))).)).....((((((((.((((((((((((....(((((...((((..(((......((((((((.(((((((.(((.((..((((.((((((((((.(((.......(((((((..((((.(((((...((.((((.....)))).))...)))))((((......))))..(((.(((.((......)).))).))).................((((.((......(((((((((....))))))))).......(((((((............))))))).)).))))..(((((((((((((.((((((((.(((((.((((((((.....((((...(((((.(((.......((((((((((((((.......))))....)))))).))))(((....))).))).))))))))).(((......)))....(((((((((..(((((..((.(.(((.(((((((...)))))))..))).).))..))))).....)))))))))(((.(((((((((...(((((((....))))))).))))))))).))).((((((............)))))).)))).).)))))))))))))..))).)).......(((((............))))).....))))..)))))))..((((((..((((....(((((................)))))...)))))))))).((((....(((((((...(((((((..((.(((((((((((((........))))(((((.(((((((((..((((...((((.....)).))...)))).))))))))))))))...((.(((((((((((.((((((...((((..........))))....))))))(((((((........)))))))(((......)))(((((((.........))))..)))((((..((((..(((.((.((.....))..)).)))......)))).))))))))))))))).)).......(((.....))).)))))))))))))))))).....)))))))....))))....((((((((.((.(((......)))..))))))))))...(((.((((((((....))))))))....)))))))))).))))......))))))))..)))))..))))...))..))).))))))).))))..))))......)))..)))).)))))........))))))))((((((((..(((....((((..(((..(((((((((.(..((((((.((((........))))......((((((.((((((......)))))).))))))))))))..).))))))))).....)))..)))).((((((((((((((((.(((((((((((..(((((...(((((((.((((((....(.(((((((..((((((((((((.((((((((((((((..(((((((.((........)))))))))))))).....))))).))..)).)))..)))))))))..((((((..((((((((((.....)))))...)))))..))))))......))))))))...))))))))..((((.((.((((((..((((((((((.((((..(((.((((((........)))))).)))((((((.((((((..(((((((((...((.((...)))).))))).))))....((((((((.((((((((((.(((((...((((((.((..((....))..)))))))).))))).).)))..)))).........(((((((............((((((((....))))))))...)))))))....)))))))))).)))))).))))))....((((((............(((.(((((.((((.(((((.....((((((...((((((((......))).))))).................))))))....))))).)))).))))).)))))))))....((((((...))).)))..)))).))))))).)))..)))))))).))))..............(((((((((......))))))))))))))...)))))..))))))..))))).)))))))).((((....)))))))))))).((((.(((....((((((...))))))........))).)))).)))))))))))....((((...))))....(((((...((.(((......))))).)))))........((((((.(((((((.(((((((...........(((((..((((((...(((.(((((.....)))))...)))....))))))..)))))....(((.((.((..(((((.((....)).)))))..)).)).)))..((((((((....((((((((....))).)))))............))))))))))))))).)))).))).))))))..........)))).))))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((,,.(((((.,,...|}}}}){,}}{{(.{.((((.((((((({.....,)))))))))))).))}{(({...}))}.{,......,,.((((((.,,....(((.....)))...,,.)))))))))))).((.((((((((((....)))))))..))).)).....((((((((.((((((((((((,...(((((...((((..(((...,..((((((((.(((((((.(((.((..((((.((((((((((.(((.......((((((,.,((((.(((((.,.((.((((.....)))).))...)))))((((......))))..(((.(((.((......)).))).}}}.....,,,,{{....{{(((,..{{,....(((((((((....))))))))).......(((((((............))))))).||{{{{{..(((((((((((((.((((((((.(((((.((((((((.{({{(,(({..((((.{((({{....,((({((((((((((.......))))}...}))))),)))}{({,.,.,||||,{,{{{({|,|}.{||,.|,,.}}}....||{{,,{,{|,,,{|||,||.|,||,.||||{||,,,,}})))}..},,})}))}.))),)..}}}))))),|||(...(((((((((...{((((((....))))))).))))))))).)))}((((((.,........,.)))))).)))).).)))))))))))))..))).)).......(((((............))))).....)))),.,))))))..{{||||,,|((({{..((((,...,},,}},,..}}}))},,.}}),,,)))))}.((((....(((((((...(((((((..(,{(((((((((((({........,,,|(((((.(((((((((,((,((.,,({{{.....}),)},,.)))}.))))))))))))))}..((.(((((((((((.,({..((((((.{(((({.......,{((((,{,.{{(((((((........))))))).|},...))))||.......,....((((((,,,,..{,{{({{,,,,,}}.))))},..}))))}....)))}}}...))))))},}))))))))))).)).,,....,||....,))..)))))))))))))))))).....)))))))....)))).,..((((((((.((.(((......)))..))))))))))...{{,.((((((({....})))))))...,})})))))))))}))..,...))))))))..)))))..))))...))..))).))))))).))))..)))).,,,..)))..)))).)))))......,.))))))))((((((({,,,((....((((,.(((..(((((((((.{..((((((.{((((.....))))})......((((((.((((((......)))))).))))))})))))..).))))))))).....)))..)))).((((((((((((((((.(((((((((((..(((((...(((((((.((((((....{.(((((((..((((((((((((.((((((((((((((,.(((((((.((........)))))))))))))).....)))),.)).})).)))..)))))))))..((((((..((((((((((.....)))))...)))))..))))))......)))))))}...))))))))..((((.((.((((((..((((((((((.((((..(((.((((((.,....,.)))))).)))((((((.((((((..(((((((((...{{.{{...)).,.))))).))))....((((((({,({((((((((.(((((...((((({{((..((....))..)))))))).})))).},))}.,))))...,,,,{,{((({{{..,,,||||,,.{(((((({....)))))))}...))))}}}....)))))))))).)))))).))))))....(((((,.{{{,....,,,|,|}|||{{.{{(({(((,{.{{({(({,((,..((((((((......))),,)))).................}}}}||,|..,,,,)})))}}))}))}))))})))),...((((({...})),,))..)))).))))))).)))..)))))))).))))..............(((((((((......))))))))))))))...)))))..))))))..))))).)))))))).((((....)))))))))))),((((.{((,,..{({(({,..})))))....,...})).}})),)})))))))))....(((,...,))}..,.(((((...((.(((......))))).))))).||...,.({{(((.{({((((.(((((({....,,,.({,{((((..((((((...(((.(((((.....}))))...)))....))))))..)))))}}..(((.{{.((..(((((.((....)).)))))..)).}}.)))..((((((((,...((((((((....))).)))))..........,.})))))))})))))).)))).}}),)))))).,........)))).))))))))......