Basic Information

Symbol
ASB10
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat And SOCS Box Containing 10 Ankyrin Repeat And SOCS Box Protein 10 GLC1F Ankyrin Repeat And SOCS Box-Containing 10 Glaucoma 1, Open Angle, F (Adult-Onset) ASB-10
Location (GRCh38)
7:151175695-151187832
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001142459.2
Sequence length
1793.0 nt
GC content
0.6386

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-810.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -836.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 491.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142459.2 NCBI
AGCCUCGGAGCGUGGGACACAGGGGCCUUCUGUCUGUCUGUAUUUCCCU… 1793 nt 0.6386
NM_001142460.1 NCBI
AGGUCCUAAGGGCUUGAGUGAAAGGAGAAGCCCCCGGCUGUUUCUCCCC… 1820 nt 0.6346
NM_080871.4 NCBI
GCACCCACCUGCCCAGUCCACCAGCAACAUCGCUGGGAGUCGUGCUGCU… 1698 nt 0.6525
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the ankyrin repeat and SOCS box-containing (ASB) family of proteins. The SOCS box serves to couple suppressor of cytokine signaling (SOCS) proteins and their binding partners with the elongin B and C complex, possibly targeting them for degradation. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the ASB10 as a shared downregulated differentially expressed gene between rhesus and adult human hypertrophic cardiomyopathy [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].