Basic Information

Symbol
ASB2
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat And SOCS Box Containing 2 ASB-2 Ankyrin Repeat And SOCS Box Protein 2 Ankyrin Repeat And SOCS Box-Containing Protein 2a Ankyrin Repeat And SOCS Box-Containing 2
Location (GRCh38)
14:93933783-93978831
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001202429.2
Sequence length
2608.0 nt
GC content
0.5962

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1058.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1099.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 679.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001202429.2 NCBI
GAACUGCCUGGCAGAGCAGCCAGAAGCUUGGGGCCAGGGCAGAAGGAAA… 2608 nt 0.5962
NM_016150.5 NCBI
ACAGCAGCUGUGUCCAGCACACAGAGGACCCGGCCAUCUGCUUUGGUUC… 2369 nt 0.6003
Summary

This gene encodes a member of the ankyrin repeat and SOCS box-containing (ASB) protein family. These proteins play a role in protein degradation by coupling suppressor of cytokine signalling (SOCS) proteins with the elongin BC complex. The encoded protein is a subunit of a multimeric E3 ubiquitin ligase complex that mediates the degradation of actin-binding proteins. This gene plays a role in retinoic acid-induced growth inhibition and differentiation of myeloid leukemia cells. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

A study in mice and humans identified the ASB2 as a novel disease gene for sepsis-induced myocardial dysfunction, where it was found to be down-regulated in heart tissue and validated via qRT-PCR and external datasets [Yao et al. DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110911].