Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016150.5

Sequence Length

2369 nt

GC Content

0.6003

ACAGCAGCUGUGUCCAGCACACAGAGGACCCGGCCAUCUGCUUUGGUUCAGAGCCCUGUGUCUGUCAGUCAGUCUCUCCCUGGCUCUCCCUCCAUCCUCAUUCCUGCCUGAAGCCAUGACCCGCUUCUCCUAUGCAGAGUACUUUUCCCUCUUUCACUCCUGCUCUGCACCCUCCAGGUCCACUGCACCUCCUGAGAGUUCGCCGGCCCGGGCCCCAAUGGGCUUGUUCCAAGGGGUCAUGCAGAAAUACAGCAGCAGCUUGUUCAAGACCUCCCAGCUGGCGCCUGCGGACCCCUUGAUAAAGGCCAUCAAGGAUGGCGAUGAAGAGGCCUUGAAGACCAUGAUCAAGGAAGGGAAGAAUCUCGCAGAGCCCAACAAGGAGGGCUGGCUGCCGCUGCACGAGGCCGCAUACUAUGGCCAGGUGGGCUGCCUGAAAGUCCUGCAGCGAGCGUACCCAGGGACCAUCGACCAGCGCACCCUGCAGGAGGAAACAGCCGUUUACUUGGCAACGUGCAGGGGCCACCUGGACUGUCUCCUGUCACUGCUCCAAGCAGGGGCAGAGCCGGACAUCUCCAACAAAUCCCGAGAGACACCGCUCUACAAAGCCUGCGAGCGCAAGAACGCGGAGGCCGUGAAGAUUCUGGUGCAGCACAAUGCAGACACCAACCACCGCUGCAACCGCGGCUGGACCGCUCUGCACGAGUCUGUGUCUCGCAAUGACCUGGAGGUCAUGCAGAUCCUGGUGAGCGGAGGAGCCAAGGUGGAAUCCAAGAACGCCUACGGCAUCACCCCCUUGUUCGUGGCCGCCCAGAGUGGACAGUUGGAGGCCUUGAGGUUCUUAGCCAAGUACGGUGCUGACAUCAACACGCAGGCCAGCGACAACGCGUCUGCCCUCUACGAGGCCUGCAAGAAUGAGCAUGAGGAGGUGGUGGAGUUUCUGCUGUCACAGGGUGCCGACGCCAACAAGACCAACAAGGACGGCUUGCUCCCGCUGCACAUCGCCUCCAAGAAGGGCAACUACAGGAUCGUGCAGAUGCUGCUGCCGGUGACCAGCCGCACGCGCAUACGCCGUAGCGGCGUCAGUCCGCUGCACCUGGCGGCCGAGCGCAACCACGACGAGGUGCUGGAGGCGCUGCUGAGCGCGCGCUUCGACGUGAACACGCCGCUGGCCCCCGAGCGCGCGCGCCUCUACGAAGACCGGCGCAGCUCCGCGCUGUACUUCGCGGUGGUCAACAACAACGUGUACGCCACCGAGCUGCUGCUGCAACACGGCGCCGACCCCAACCGCGACGUCAUCAGCCCCUUGCUCGUGGCCAUCCGCCACGGCUGCCUGCGCACAAUGCAGCUGCUGCUGGACCACGGCGCGAACAUCGACGCCUAUAUCGCCACGCACCCCACCGCCUUCCCCGCCACCAUCAUGUUCGCCAUGAAGUGCCUGUCGCUGCUCAAGUUCCUCAUGGACCUGGGCUGCGACGGCGAGCCCUGCUUCUCAUGCCUCUACGGCAACGGCCCGCACCCGCCGGCCCCGCAGCCCUCCAGCAGGUUCAACGACGCGCCCGCGGCCGACAAGGAGCCCAGCGUGGUGCAGUUCUGUGAGUUCGUAUCUGCCCCAGAGGUGAGCCGCUGGGCGGGGCCCAUCAUCGAUGUCCUCCUGGACUACGUGGGCAACGUGCAGCUCUGCUCGCGGCUGAAGGAACACAUCGACAGCUUUGAGGACUGGGCCGUCAUCAAGGAGAAGGCAGAACCUCCAAGACCUCUGGCUCACCUUUGCCGACUGCGGGUUCGAAAGGCCAUUGGGAAAUACCGUAUAAAACUCCUAGACACCUUGCCGCUCCCAGGCAGGCUGAUUAGAUACCUGAAAUACGAGAACACCCAGUAACUGGGGCCACGGGGAGAGAGGAGUAGCCCCUCAGACUCUUCUUACUAAGUCUCAGGACGUCGGUGUUCCCAACUCCAAGGGGACCUGGUGACAGACGAGGCUGCAGGCUGCCUCCCUCUCAGCCUGGACAGCUACCAGGAUCUCACUGGGUCUCAGGGCCCAGAGCUUUGGCCAGAGCAGAGAACAGAAUGUGUCAAGGAGAAGAAUCAUUUGUUUACAAACUGAUGAGCAGAUCCCAGACCUUCUCUACCUUCAGGAAUGGCAGAAACCUCUAUUCCUGGGGCCAGGGCAGAGCUUGAGGUGUUCUGGGGAAGGUGGUGCUCAGAGCCUUCCCUGUGCCCCUCCACUUGUUCUGGAAAACUCACCACUUGACUUCAGAGCUUUCUCUCCAAAGACUAAGAUGAAGACGUGGCCCAAGGUAGGGGGUAGGGGGAGCCUGGGUCUUGGAGGGCUUUGUUAAGUAUUAAUAUAAUAAAUGUUACACAUGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-958.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -995.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 504.82

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((((((...((.(((((.((((((((((((((((..((((((...((((((((.....(((.(((...((((.(.((.((((...(((.(((((((((((..(((((........)))))......))))..........(((((((((((.....((((((.((((((((((..(((((((.....((((((..(((((((((((((....)))))))...(((((((((.(((((.......((..(((((...............)))))..))))))))))))))))......((((((...))))))..........((((((.........))))))...........((((((((((((........)))))((..(((.(((((((..((((......((((((((((.....)))))....((((((((.(.((((.....((.....)).....)))).).)))))))).......))))).....))))..))))))).)))..))((((.(((((((((((.(((((...))))).))))).)..)))))..))))..........((((......)))).......)))))))(((......)))..))))).)..))))))))))))).....(((((((((..((...((.((((...((((.....))))..)))))).))..)))))).)))..))))))))))...))))))....)))))).))))).(((.(((((...........)))))..))).........((((((((((....)))...)))))))(((.(((((((((((.((...(((......)))...)).........((((((..(((....)))))))))))))...))))))).)))))))))).))).)))))).).))))...)))))).))))))))((((...((..............)).)))).(((.......)))....((((.......)))).......)))))).))))))).....)))))((((..((((((((.((....))))).))))))))))))).))).....((((((((.(((...(((((((((((.(((((.((((.(((.((((((((((((((..((....))(((...)))...)))).))))))).)))..(((((..((((((......))))))..)))))(((((((..(((......)))..))))))).((.((((........))))))...........))).)))).))))).))))).)))))).....)))..)))))))))).))...))))))))))))......((((((((((...))).))))......((...))........((((((.(((.(((..(((((.....))))).))).).(((((.(((((.((.((....)))).))))).)))))((((.((((.(.((((((((((.....))))..(((........)))((((((((......(((((.((((((.....((((((((((((......).)))..))).)))))..(((((.(.((........)).)))))).))))))))))))))))))).....(((((((..((((......((((((((..((...))..)))))))).....))))..)))))))......))))))).)))))))).....)).))))))....((((((((((((..(((((.((((((((..((((.((((.....))))((((((......(((((.......((((.((.((((((.......)))))).)).)))).........)))))......))))))..((.((((((((..(((((.(((((((((...(((.(((.((((((((.(((((.(((.((.((.....)).)))))...))))).)))))..))).))).)))..))))).)))))))))..(((((.......)))))......(((((((....)))))))((((((((..((((.((((..(.(((...((((((((((((..(((((((((((........)))))))))....)).))))))...((((((((((((.((....))))))))))))))((((((((.((...((((.((.(.(((((((((..........)))))))))).)).))))..))))))))))...........))))))))).)..)))))))))))))).))..........)))))))).))))))..))))))))))))).))))))))))))((((....))))..((((((.....)))))).....))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((((((...((((.(((((...{(((((.,,,((((((,{,.(((((...((((((.(((((((({(,((((.{((((((,((((((((.((({{(((({,,(((((........))))).....{((((((((...................))))))))}..(((((((............)))).)))...,,.(((((((((((....)))))))...(((((((((.(((((.......((..(((((.{.............)))))..))))))))))))))))....,)))}....})))))).))))..))))((((((.........))))))..((((....}))),.))))))......))))))))))))(((.(((((((.,,,,,....,,,,{(((((((({{{.|||||....((((((((.(.((((.....((.....}}..,,.)))).).)))))))).....},)),))}))}}))))..))))))).)))....((((.((((({(((((.(((((...})))).))))).)..)))))..)))).........)).)))))).))))).}}}))){((({..(....)..))))).))))).)....))))))))).||,,..{((((,{,,........{|||||...(((({{{{{{{({(({((((((,|({{{{{||.((|,(((((....)))))))))))|,.,{(((((((({({((((.(((((...........))))).,,,{((((((,(({(((((((,,((((.....)))).}..(((.(((((((((((,,,..,{{{......}||{.||,...,..,..((((((..(((....)))))))))}}}}..}))))))).))}..))))))).}})).))))))),,||.,|||||{{|.},}((((,...}}}}.....,,|{.....}),,)))}}}))}}}))),)})...((((.......))))....})))),))))))))).||.,,.}}}))|,.}}}||}}}..({({,..,}},||{|||||,,..).)))))))....((((((((.(((...(((((((((((.(((((.((((,(((.({(((((((({{{(.,({....,}|{{|,|}|,...)}))})))))))},}}..(((((..((((((......))))))..)))))(((((((..(((......)))..))))))).{{.({,{,||.....)))))},,.........))).)))).))))).))))).)))))).....)))..))))))))})})}...,))))))}))))}}},..{{{(((((((...))).))))......,|,..||........((((((.({{.{((..(((((.....))))).)))},.(((((.(((((.(.(((....)))},))))).)))))((((.((((.(.((((({((((.....))))..(((,.,,....))}|(((((((......(((((.((((({.,..,((((((((((((......).)))..))).))))).,|{(((.(.((........)),,))))}|})))))))))))))))))|.....{(({{((,,{{{{,,,,..{{{||||{.,||...))..}))))))).,,,.}))}..}}})))}......))))))).)))))))).....)).)))))).,..((((((((((((..(((((.((((((((..((((.((({.....))))((((((......(((((.......((((.((.((((((.......)))))).)).)))).........)))))......))))))..((.((((((((..(((((.(((((((((...(((.(((.((((((((.(((((.(((.((.((.....)).)))))...))))).))))),.})).))).)))..)))))},))))))))..(((((.......)))))......(((((((....)))))))((((((((..((((.((((..{.(((...((((((((((((..{{((((((((({,...,}.)))))))))....}}.))))))..,((((((((((((.((....))))))))))))))(((((((({{(.,.((((.((.,.(((((((((..........)))))))))).)).)))).,))))))))))...........))))))))).}..)))))))))))))).))..........)))))))).))))))..))))))))))))).))))))))))))((((....}}}}..,{{{{|.....}||},,..,,,))).