Basic Information

Symbol
ASL
RNA class
mRNA
Alias
Argininosuccinate Lyase ASAL Arginosuccinase EC 4.3.2.1 Argininosuccinase ASLD
Location (GRCh38)
7:66075800-66094697
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000048.4
Sequence length
2140.0 nt
GC content
0.5902

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-884.64 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -918.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 425.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((((((........)))))(.((((((.....(((((((..(((((((((((.(.(..(((((..(((.......))))))))..)..).)))))))))))((((.((((((.((((..(((((((((.(.....((((....))))..).))))))))))))))))))))))).(((((((((.(.(((...((((......))))......((((((((((.(.(((((.((((((((((((((((...(((((........))))))))))........))).))))))))..((((((((((((.....((((..(((((((..((......(((((((.((((((((((.((.......)).))))))))))......(((((...(((((((((((....(((......(((((....))))).....)))...)))))..))))))...)))))(((.(((.(((.(((..((.((.(((((((.((((..((((((((...((((.(((((((........)).))))).))))(((....)))...(.(((..((((((((......))))).))).))).)..........))))))))..))))...))).)))).)).))..))).)))))).))).((((((((.((((..((((..(((.((.(((((.......((((.((((.....(((((((((((((((((.(.((((.(((.....(((((((((((((.((....(((((...((.(((......((((((((.((((....)))).))))))))..))).)))))))((.(((......))))))))))))))(((((.....))))).......))))))..))).)))).).)))))))))....(((((.((((((.(...((((((..((((((((.....((((.......))))....)))....)).)))))))))..).)))))))))))((.((((.(((.((((..(((...))).))))...))).))))))...............((((((.(((((.((..((((((((....)))))))).....((.((((((((..(((((...(((((((.......))))..)))..)))))..)))..))))).)).(((...((((........))))))).))..))))))))....)))))))))))..)))))))).(((((..(((((.....))))).))))).(((((.(((...(((...((((.....)))))))...))))))))....((((((...)))))).......))))))).)))..)))))))))))))))))))))))........))..)).)))))))))..))))))))))))(((..((((.(((((((((((..(((((......))))).....)))))).(((((.(((((((((.((....(((((.(.(....((((.((.....)).))))).).)))))))))))))))).)..(((((((((((((((((((((..(.(((((.((....)).))))).)..)))))..))))))..))))...))))))))))..((((((...((((..((((((((......))))))))..)))).....))))))))))).)).))..))).((((......(((((.(((((.(((((.(((................((((.((.((((((((..((((..((((....))))..)))).)))).((((.......(((((((..(((((..(((((..(((((((.((.........)))))))))))))).)))))...))).))))...)))).(((((...................................)))))..)))).))..)))).......(((...)))))).)))))...))))))))))......))))))))).).))))))))))...((((......))))....))).).)))))))))((.((((.....(((....))).....)))).)).)))))))..)))))).)....(((....)))..)).)))).............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.(((((((........)))))(.((((((,,...{||((({,.(((((((((((.{.(..(((((..(({.......})))))))..)..).)))))))))))(((,{((((({{(((({.,((((((((.{.....{({{....}))}..}.))))))))))))))))))))))).{{{((((({,(,((({..((((......))))..})),((((((((((.(.(((((,((((((((((((((((,..{((((........))))))))))........))).)))))))}..((((((((((((.....((((..(((({.,..{{.|,...(((((((.((((((((((.((.......)).)))))))))).....,(((((...(((((((((((....(((......(((((....))))).....)))...)))))..))))))...)))))|((.(((.(((.(((..((.((.(((((((.((((..((((((((,.,((((.{(((({(,,,,....)))))))),)))|((,....)))...{.(((..((((((((......))))).))).))).}..,,},..,.))))))))..))))...))).)))).)).))..))).)))))).))}.(((((((,,((((..((((..(((.((.(((((.......(((,,((((,,...((((((({(((((((((.,,((((.(((.,...(((((((((((((.{{....(((((..,((.(((......((((((((,(({(....}))).))))))))..))),)))))))((.(((......)))))}})))))))(((((.....))))).......))))))..))).)))),).)))))))))....(((((.{(((((.{...((((((..(((,({.{,.......{.{{{{,,|,}}}}.}}},.}}.)).))}))))))..).)))}}}))))){(,((((.(((.((((..(({...})).))))...))).))))}}...............{(((((.(((((.,{..((((((((....)))))))).....((.((((((((..(((((...{((((((.......)))),.}}}..)))))..)))..))))).)).(((...{(((........))))))).,,..))))))))....))}))))))))..)))))))).{((((..(((((.....))))).))))}.(((((.(((...(((.,.{{((....,))))))).,.)))))))).,,.((((((...))))))...,...))))))).)))..))))))))))))))))))))))}....}...)}},}},)))))))))..))))))))))))(((..((((.((((({(({((,.(((((......))))).,,{{|||}}}.(((({.(((((((({,((,...{((((.,.{...{((((.((.....)).))))).).)))))))))))))))).}..(((((((((((((((((((((,,{,(((((.((....)).))))),),})))),.}))))))..))))...)))))))))),.|{{|||}},((((..((((((((......))))))))..))))...,.)}))}}))))).)).))..))).|(((......(((((.(((((.(((((.(((................((((.(({((({{((||,{((,..,,({{{{{|||,..||,..))))|{(({(...,,.|||||{(,,(((((..(((({..(((((((.((.........)))))))))})))).)))))...}))}}))|,,..}}}.)))).............................,,...,}}}.....,))).))..)))).,,....|||.,.,,,))).)))))...))))))))))......)))}))))).).)))))))))),,,||||,,....})))....,,..,.})))))||{((.,{(({{...,||}}..)))},...||||,|,..,))))),.)))))).)....(((....)))..)).)))).............................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000048.4 NCBI
AGUGGCGGGCGCGACACUAUCCGUGCGGCCAGGCGGAGACCCGGAGGAC… 2140 nt 0.5902
NM_001024943.2 NCBI
AGUGGCGGGCGCGACACUAUCCGUGCGGCCAGGCGGAGGUGAGUGCGCG… 2322 nt 0.6016
NM_001024944.2 NCBI
AGUGGCGGGCGCGACACUAUCCGUGCGGCCAGGCGGAGGUGAGUGCGCG… 2262 nt 0.6030
NM_001024946.2 NCBI
AGUGGCGGGCGCGACACUAUCCGUGCGGCCAGGCGGAGGUGAGUGCGCG… 2244 nt 0.5989
Summary

This gene encodes a member of the lyase 1 family. The encoded protein forms a cytosolic homotetramer and primarily catalyzes the reversible hydrolytic cleavage of argininosuccinate into arginine and fumarate, an essential step in the liver in detoxifying ammonia via the urea cycle. Mutations in this gene result in the autosomal recessive disorder argininosuccinic aciduria, or argininosuccinic acid lyase deficiency. A nontranscribed pseudogene is also located on the long arm of chromosome 22. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that non-targeted metabolomic profiling of iliopsoas muscle identified numerous differential metabolites for discriminating fatal hypothermia from hypoxia and control deaths, with six machine learning models achieving high predictive accuracy [Li et al. DOI:10.1016/J.Jflm.2026.103089]. A study in humans demonstrated that the ASL serves as a marker for Bas-I keratinocytes in acute skin wound healing [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013], while a separate transcriptomic analysis of post-mortem tissues from sepsis patients found the ASL was downregulated as part of the inhibited metabolism of amino acids and derivatives pathway in the hippocampus and kidney [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].