Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001024943.2
Sequence Length
2322 nt
GC Content
0.6016
AGUGGCGGGCGCGACACUAUCCGUGCGGCCAGGCGGAGGUGAGUGCGCGGCGGCCGGAUGGGCGGGACGGGCGUGGAGGACGCCGAGCACCGUGGCGCGCGCUCACGUCCGCGUCCCCAAGGGCUGCGCUCCCUCAAGCGCAGUGCCCAGAACUCGGAGCCAGCCCGGCCCGGGGGACCCUGCUGGCCAAGGAGGUCGUCAGUCCGGUCUUGUCUUCCAGACCCGGAGGACCGAAGCUUCCGGACGACGAGGAACCGCCCAACAUGGCCUCGGAGAGUGGGAAGCUUUGGGGUGGCCGGUUUGUGGGUGCAGUGGACCCCAUCAUGGAGAAGUUCAACGCGUCCAUUGCCUACGACCGGCACCUUUGGGAGGUGGAUGUUCAAGGCAGCAAAGCCUACAGCAGGGGCCUGGAGAAGGCAGGGCUCCUCACCAAGGCCGAGAUGGACCAGAUACUCCAUGGCCUAGACAAGGUGGCUGAGGAGUGGGCCCAGGGCACCUUCAAACUGAACUCCAAUGAUGAGGACAUCCACACAGCCAAUGAGCGCCGCCUGAAGGAGCUCAUUGGUGCAACGGCAGGGAAGCUGCACACGGGACGGAGCCGGAAUGACCAGGUGGUCACAGACCUCAGGCUGUGGAUGCGGCAGACCUGCUCCACGCUCUCGGGCCUCCUCUGGGAGCUCAUUAGGACCAUGGUGGAUCGGGCAGAGGCGGAACGUGAUGUUCUCUUCCCGGGGUACACCCAUUUGCAGAGGGCCCAGCCCAUCCGCUGGAGCCACUGGAUUCUGAGCCACGCCGUGGCACUGACCCGAGACUCUGAGCGGCUGCUGGAGGUGCGGAAGCGGAUCAAUGUCCUGCCCCUGGGGAGUGGGGCCAUUGCAGGCAAUCCCCUGGGUGUGGACCGAGAGCUGCUCCGAGCAGAACUCAACUUUGGGGCCAUCACUCUCAACAGCAUGGAUGCCACUAGUGAGCGGGACUUUGUGGCCGAGUUCCUGUUCUGGGCUUCGCUGUGCAUGACCCAUCUCAGCAGGAUGGCCGAGGACCUCAUCCUCUACUGCACCAAGGAAUUCAGCUUCGUGCAGCUCUCAGAUGCCUACAGCACGGGAAGCAGCCUGAUGCCCCAGAAGAAAAACCCCGACAGUUUGGAGCUGAUCCGGAGCAAGGCUGGGCGUGUGUUUGGGCGGUGUGCCGGGCUCCUGAUGACCCUCAAGGGACUUCCCAGCACCUACAACAAAGACUUACAGGAGGACAAGGAAGCUGUGUUUGAAGUGUCAGACACUAUGAGUGCCGUGCUCCAGGUGGCCACUGGCGUCAUCUCUACGCUGCAGAUUCACCAAGAGAACAUGGGACAGGCUCUCAGCCCCGACAUGCUGGCCACUGACCUUGCCUAUUACCUGGUCCGCAAAGGGAUGCCAUUCCGCCAGGCCCACGAGGCCUCCGGGAAAGCUGUGUUCAUGGCCGAGACCAAGGGGGUCGCCCUCAACCAGCUGUCACUGCAGGAGCUGCAGACCAUCAGCCCCCUGUUCUCGGGCGACGUGAUCUGCGUGUGGGACUACGGGCACAGUGUGGAGCAGUAUGGUGCCCUGGGCGGCACUGCGCGCUCCAGCGUCGACUGGCAGAUCCGCCAGGUGCGGGCGCUACUGCAGGCACAGCAGGCCUAGGUCCUCCCACACCUGCCCCCUAAUAAAGUGGGCGCGAGAGGAGGCUGCUGUGUGUUUCCUGCCCCAGCCUGGCUCCCUCGUUGCUGGGCUUUCGGGGCUGGCCAGUGGGGACAGUCAGGGACUGGAGAGGCAGGGCAGGGUGGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGAAGGGCAAGGUGCGAGGAUGCUUGAGGCCAGGAGUUUGACACAGCCUGGGCAACACAGGGAGACCCCCAUCUCUACUCAAUAAUAAAACAAAUAGCCUGGCGUGGUGGCCCAUGCAUAUAGUCCCAGCUACUUGUAAGGCUGAGGUGAGAGGACACUUGUGCCCAGGAGUGGAGGCUGCAGUGAGCUAUGAUCACGCCACUGCAUUCCAGCCUGGAUAACAGAGUGAGAACCUAUCUCUAAAAAUAAAUAAAUAAACGAAAAAUAAAUGGAAGCGGAGAAAACUGGGCAAGGGCAAUGAGAGUCGUAGACGGGAAGGGAAGAGGGGGCUCCCAUCAUAGCCUCUGCUCUGUCCAGGCCCCAUCCCCUUCAGACAGGGUAUCACAGUGACCUCCUAGGCCAGGAGCGAUGGCUCACGCCUGUAAUCCUAGCAUUUUGGGAGGCCUGGGCAACAGGAAGACUCCAACUACCAUAUUAAAAAAAACAUGAAUGAAAGCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-996.34 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1033.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 447.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((((((........)))))(.(((((((((.(((((((((((.(.(((.....)))...((((((.(((......))).)).))))).))))))))))).)))))((((((..((((((((((......))))))..))))......(((.(((.....))))))))))))....((((((.(((((((((.(.((((.((((.(((((((......)))))))((((((((((.(.(..(((((..(((.......))))))))..)..).))))))))))(((((.((((((.((((..(((((((((.(.....((((....))))..).))))))))))))))))))))))))...(((((.(((((((..((((......))))..))).((((((((((.(.(((((.((((((((((((((((...(((((........))))))))))........))).))))))))..((((((((((((.....((((..(((((((..((......(((((((.((((((((((.((.......)).))))))))))......(((((...(((((((((((....(((......(((((....))))).....)))...)))))..))))))...)))))(((.(((.(((.(((..((.((.(((((((.((((..((((((((...((((.(((((((........)).))))).))))(((....)))...(.(((..((((((((......))))).))).))).)..........))))))))..))))...))).)))).)).))..))).)))))).))).((((((((.((((..((((..(((.((.(((((.......((((.((((.....(((((((((((((((((.(.((((.(((.....(((((((((((((.((....(((((...((.(((......((((((((.((((....)))).))))))))..))).)))))))((.(((......))))))))))))))(((((.....))))).......))))))..))).)))).).)))))))))....(((((.((((((.(...((((((..((((((((.....((((.......))))....)))....)).)))))))))..).)))))))))))((.((((.(((.((((..(((...))).))))...))).))))))...............((((((.(((((.((..((((((((....)))))))).....((.((((((((..(((((...(((((((.......))))..)))..)))))..)))..))))).)).(((...((((........))))))).))..))))))))....)))))))))))..)))))))).(((((..(((((.....))))).))))).(((((.(((...(((...((((.....)))))))...))))))))....((((((...)))))).......))))))).)))..)))))))))))))))))))))))........))..)).)))))))))..))))))))))))(((..((((.(((((((((((..(((((......))))).....)))))).(((((.(((((((((.((....(((((.(.(....((((.((.....)).))))).).)))))))))))))))).)..(((((((((((((((((((((..(.(((((.((....)).))))).)..)))))..))))))..))))...))))))))))..((((((...((((..((((((((......))))))))..)))).....))))))))))).)).))..))).((((......(((((.(((((.(((((.(((................((((.((.((((((((..((((..((((....))))..)))).)))).((((.......(((((((..(((((..(((((..(((((((.((.........)))))))))))))).)))))...))).))))...)))).(((((...................................)))))..)))).))..)))).......(((...)))))).)))))...))))))))))......))))))))).).))))))))))))))))))))))).)).....)).)))))))))).))))))((((....))))..(((.....((((((....))))))))))))).)....(((....)))..)).)))).............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((({.{(((((.,......})))),)))..(((((.(((((((((((.(.(((.....))){{.,(,((({(,,...}}})),.)}.))})).))))))))))).)))))((((((..((((((((((......)))))),.})))......(((.(((.....)))))))))))),((.((((((.(((((((((,{.,(((.((((.(((((((......))))))|((((((((((.{.(..(((((..(({.......})))))))..)..).))))))))))|(((,{((((({{(((({.,((((((((.{.....{({{....}))}..}.)))))))))))))))))))))))}...(((((.(((((((..((((......))))..))).((((((((((.(.(((((,((((((((((((((((,..{((((........))))))))))........))).)))))))}..((((((((((((.....((((..(((({.,..{{.|,...(((((((.((((((((((.((.......)).)))))))))).....,(((((...(((((((((((....(((......(((((....))))).....)))...)))))..))))))...)))))|((.(((.(((.(((..((.((.(((((((.((((..((((((((,.,((((.{(((({(,,,,....)))))))),)))|((,....)))...{.(((..((((((((......))))).))).))).}..,,},..,.))))))))..))))...))).)))).)).))..))).)))))).))}.(((((((,,((((..((((..(((.((.(((((.......(((,,((((,,...((((((({(((((((((.,,((((.(((.,...(((((((((((((.{{....(((((..,((.(((......((((((((,(({(....}))).))))))))..))),)))))))((.(((......)))))}})))))))(((((.....))))).......))))))..))).)))),).)))))))))....(((((.{(((((.{...((((((..(((,({.{,.......{.{{{{,,|,}}}}.}}},.}}.)).))}))))))..).)))}}}))))){(,((((.(((.((((..(({...})).))))...))).))))}}...............{(((((.(((((.,{..((((((((....)))))))).....((.((((((((..(((((...{((((((.......)))),.}}}..)))))..)))..))))).)).(((...{(((........))))))).,,..))))))))....))}))))))))..)))))))).{((((..(((((.....))))).))))}.(((((.(((...(((.,.{{((....,))))))).,.)))))))).,,.((((((...))))))...,...))))))).)))..))))))))))))))))))))))}....}...)}},}},)))))))))..))))))))))))(((..((((.((((({(({((,.(((((......))))).,,{{|||}}}.(((({.(((((((({,((,...{((((.,.{...{((((.((.....)).))))).).)))))))))))))))).}..(((((((((((((((((((((,,{,(((((.((....)).))))),),})))),.}))))))..))))...)))))))))),.|{{|||}},((((..((((((((......))))))))..))))...,.)}))}}))))).)).))..))).|(((......(((((.(((((.(((((.(((................((((.(({((({{((||,{((,..,,({{{{{|||,..||,..))))|{(({(...,,.|||||{(,,(((((..(((({..(((((((.((.........)))))))))})))).)))))...}))}}))|,,..}}}.)))).............................,,...,}}}.....,))).))..)))).,,....|||.,.,,,))).)))))...))))))))))......)))}))))).).))))))))))})))))))))))).})}....,}.,})))))))).)))))),||,....||||,.((({....((((({....})))))})).)))))....(((....)))..,,.,}}}.............................
Back