Basic Information

Symbol
ATG10
RNA class
mRNA
Alias
Autophagy Related 10 APG10L Ubiquitin-Like-Conjugating Enzyme ATG10 Autophagy-Related Protein 10 DKFZP586I0418 FLJ13954 ATG10 Autophagy Related 10 Homolog (S. Cerevisiae) APG10 Autophagy 10-Like (S. Cerevisiae) ATG10 Autophagy Related 10 Homolog APG10 Autophagy 10-Like APG10-Like EC 2.3.2.- Pp12616 APG10
Location (GRCh38)
5:81971615-82276857
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_031482.5
Sequence length
3029.0 nt
GC content
0.4322

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-915.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -971.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 685.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001131028.2 NCBI
GCAGUGCGCACGCUCCGACUCGGCCGUGGCGGACCUGACUGAAGGAGGC… 3164 nt 0.4384
NM_031482.5 NCBI
GCAGUGCGCACGCUCCGACUCGGCCGUGGCGGACCUGACUGAAGGAGGC… 3029 nt 0.4322
Summary

Autophagy is a process for the bulk degradation of cytosolic compartments by lysosomes. ATG10 is an E2-like enzyme involved in 2 ubiquitin-like modifications essential for autophagosome formation: ATG12 (MIM 609608)-ATG5 (MIM 604261) conjugation and modification of a soluble form of MAP-LC3 (MAP1LC3A; MIM 601242), a homolog of yeast Apg8, to a membrane-bound form (Nemoto et al., 2003 [PubMed 12890687]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ATG10 is associated with the inhibited autophagy pathway in the brain and lungs during sepsis [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].