Basic Information

Symbol
AAGAB
RNA class
mRNA
Alias
Alpha And Gamma Adaptin Binding Protein P34 Alpha- And Gamma-Adaptin-Binding Protein P34 FLJ11506 Punctate Palmoplantar Keratoderma Type I PPKP1A KPPP1 PPKP1
Location (GRCh38)
15:67200667-67255195
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024666.5
Sequence length
3132.0 nt
GC content
0.4285

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-927.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -988.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 824.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271885.2 NCBI
GUGAACGGUUUUAGAGUUUUCCCAGAGGCAGAAAGUCCUGCUUCUGGGG… 3091 nt 0.4232
NM_001271886.2 NCBI
GCCUGACGGAACCGGCUCGCGAGCGCAGCUAUGGCUGCUGGCGUACCCU… 3277 nt 0.4406
NM_024666.5 NCBI
GCCUGACGGAACCGGCUCGCGAGCGCAGCUAUGGCUGCUGGCGUACCCU… 3132 nt 0.4285
Summary

The protein encoded by this gene interacts with the gamma-adaptin and alpha-adaptin subunits of complexes involved in clathrin-coated vesicle trafficking. Mutations in this gene are associated with type I punctate palmoplantar keratoderma. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.