Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_024666.5
Sequence Length
3132 nt
GC Content
0.4285
GCCUGACGGAACCGGCUCGCGAGCGCAGCUAUGGCUGCUGGCGUACCCUGUGCGUUAGUCACCAGCUGCUCCUCCGUCUUCUCAGGAGACCAGCUGGUCCAACAUAUCCUUGGAACAGAAGAUCUUAUUGUGGAAGUGACUUCCAAUGAUGCUGUGAGAUUUUAUCCCUGGACCAUUGAUAAUAAAUACUAUUCAGCAGACAUCAAUCUAUGUGUGGUGCCAAACAAAUUUCUUGUUACUGCAGAGAUUGCAGAAUCUGUCCAAGCAUUUGUGGUUUACUUUGACAGCACACAAAAAUCGGGCCUUGAUAGUGUCUCCUCAUGGCUUCCACUGGCAAAAGCAUGGUUACCUGAGGUGAUGAUCUUGGUCUGCGAUAGAGUGUCUGAAGAUGGUAUAAACCGACAAAAAGCUCAAGAAUGGUGCAUCAAACAUGGCUUUGAAUUGGUAGAACUUAGUCCAGAGGAGUUGCCUGAGGAGGAUGAUGACUUCCCAGAAUCUACAGGAGUAAAGCGAAUUGUCCAAGCCCUGAAUGCCAAUGUGUGGUCCAAUGUAGUGAUGAAGAAUGAUAGGAACCAAGGCUUUAGCCUUCUCAACUCAUUGACUGGAACAAACCAUAGCAUUGGGUCAGCAGAUCCCUGUCACCCAGAGCAACCCCAUUUGCCAGCAGCAGAUAGUACUGAAUCCCUCUCUGAUCAUCGGGGUGGUGCAUCUAACACAACAGAUGCCCAGGUUGAUAGCAUUGUGGAUCCCAUGUUAGAUCUGGAUAUUCAAGAAUUAGCCAGUCUUACCACUGGAGGAGGAGAUGUGGAGAAUUUUGAAAGACUCUUUUCAAAGUUAAAGGAAAUGAAAGACAAGGCUGCGACGCUUCCUCAUGAGCAAAGAAAAGUGCAUGCAGAAAAGGUGGCCAAAGCAUUCUGGAUGGCAAUCGGGGGAGACAGAGAUGAAAUUGAAGGCCUUUCAUCUGAUGAAGAGCACUGAAUUAUUCAUACUAGGGUUUGACCAACAAAGAUGCUAGCUGUCUCUGAGAUACCUCUCUACUCAGCCCAGUCAUAUUUUGCCAAAAUUGCCCUUAUCAUGUUGGCUGCCUGACUUGUUUAUAGGGUCCCCUUAAUUUUAGUUUUUAGUAGGAGGUUAAGGAGAAAUCUUUUUUUUCCUCAGUAUAUUGUAAGAGAGUGAGGAAUACAGUGAUAGUAAUGAGUGAGGAUUUCUUAAAUAUACUUUUUUUUUGUUCUAGGAAUGAGGGUAGGAUAAAUCUCAGAGGUCUGUGUGAUUUACUCAAGUUGAAGACAACCUCCAGGCCAUUCCUGGUCAACCUUUUAAGUAGCAUUUCCAGCAUUCACACUUGAUACUGCACAUCAGGAGUUGUGUCACCUUUCCUGGGUGAUUUGGGUUUUCUCCAUUCAAGGAGCUUGUAGCUCUGAGCUAUGAUGCUUUUAUUGGGAGGAAAGGAGGCAGCUGCAGAAUUGAUGUGAGCUAUGUGGGGCCGAAGUCUCAGCCCGCAGCUAAGUCUCUACCUAAGAAAAUGCCUCUGGGCAUUCUUUUGAAGUAUAGUGUCUGAGCUCAUGCUAGAAAGAAUCAAAAAGCCAGUGUGGAUUUUUAGACUGUAAUAAAUGAGGCAAAGGAUUUCUAUUCCAGUGGGAAGAAAACCUCUCUACUGAGUUGUGGGGGAUAUGUUGUAUGUUAGAGAGAACCUUAAGGAGUCCUUGUAUGGGCCAUGGAGACAGUAUGUGAUAACAUACCGUGAUUUUCAUGAAGAAAUUCUUCUGUCUUAGAGUUCUCCCCUGCUGCUUGAGAUGCCAGAGCUGUGUUGUUGCACACCUGCAAAACAAGGCACAUUUCCCCCUUUCUCUUUAAAGCCAAAGAGAGAUCACUGCCAAAGUGGGAGCACUAAGGGGUGGGUGGGGAAGUGAAAUGUUAGGCGAUGAAUUCCUGAGCACCUUGUUUUUCUUCCAAGGUUCGUAGCUCCUCUCUGCCCUUCCAAGCCUGUAACCUCGGAGGACUAUCUUUUGUUCUUUAUCCUUUGUCUUGUUUGAGUGGGUCAGCCCCAGAGGAACUGAUAAGCAAAUGGCAAGUUUUUAAAGGAAGAGUGGAAAGUACUGCAAAUAAAAAUCCUUAUUUGUUUUUGUAGACUUUGUAAUGCAUAUCAUUAGCCCUCACUGUGAUCAUUACUGCUGUGGCUCUGAACUGGCACAUAGUACAGUGGAUGGAAGGUGCCCGCACACCAGCUGAGAACUGGUUCUGGCCUAGGUGGGCUCUAGAACCAUUUACACAGCAUGAAAGAAACAGGUUGGGUUAGGAGCAGAAAGAAAUAAGGCUCACACCCCUCCAGACACUACCUUAUAAGCACUGCAGAACCUGAAACAGAUGGCAGAAGGAAUGGAAUGCUACAGGGGCCAGCAGGAGUGACCACAGGGAGGGGACAGCUCAGUGACUGGAGCAUUCAGGAAGAGGCUUUCCAGGGAACACUGGACAUUGCUUAGUGACCUUUUGUUCCUUUUUUUUUUUUUUUCUUUUACUGUUCUGAAAGACUUUGAGUCUGUGGUUCACCACCAGCCCAUCAGUGUUUCUUUGAGGUGAUUGCAUUAGGGAAGUUGGCUCUGGGAUUGCAAAAAAAAAAAAAAGGUGGAACAUGUUUUCCUUAAAAGAUGGAAGGUUUUAGAAAAUAUACUAGGCCAUCUGGUUAGAAAAAACAGACCAGACUAGAAAAAGCUGUGAAUUUGAUUUUGUAGAUUAAACAAAGCCAGAUGAUUAAAAUGUGAUUUAUUUAUAAACUGUGCUAAUGUCUAUUAUUAUGAUUUUGUGGUUUUUUAUUAGGGGGUAUGAGUGAGGGAAGCCCUAUAUCCUUCAUUGGAUUAGACAUAUAUAGUGAAUAGUGGAAGAGUCUGUCAAGCUCACUAUUUUAGAAUUUACCCUGCAUAUGUAAUGUCAUGUUUUUAAGACCUCAGCUAUGCAGGGAUAUUGGCCUCUUCUAGGGACAUAUGGGAUGAAGGUCUCUAGUGAAAUCUACUAAAAGCCCAUGUUAGAAUAGUGAUCAUGAGCUAACACUACAGUAAUAGCUGCAGUCUAUCUAAAGUGACCUAUGUUCAUGCUACCACAAGUUGUUACAGAAUUGCCAGCUGGAAUUUAAAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-927.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -988.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 824.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((..(((...(.((((..((((..((..((((((((((...))))))))))..))))))))))).)))..))))))))...(((((((((......((((..(((..(((((((((((((..((((((...))))))........))))))))))....)))..)))..))))............((.((.((((......)))).)).))...(((((.....))))).(((((.....)))))..(((((...((((((((((((((((((((.(((.((((......((((((..(((...(((.(((((.((...(((...((....)).)))...))))))).))).)))..)))))).......))))))).....(((....))).......((((((....((((((.((.(((((((((((....(((((((.....(((((((((((....(((.(((((.......))))))))......((((.((...((.....))....))))))...((((((((.((((((((((.((.((((.((...............((((((..((((((((((((.((((.(((((..(((((((((.((((((..((((....)))).)))))).))......((((((.....))))))...........((.((((((...)))))).)).((((((........))))))(((((((..(((((...(((...))))))))))))))).......(((((((((((((....((((.............))))..(((((((((((....))))))))))).....(((((((..(((.(((((.(((....((((((.(((......((((((.(((..((((((((((((......((((((((((((..(((((((((((((((((((.........)))))))).(((((.............))))).((((.((((.........)))).))))))))))))((((....)))).......))).........)))))).....(((((...((.(((((....))))).)).....))))).((((((.((((((........(((((..((..(((((((((((...(((((((.(............).)))))))...................)))))))))))...))..)))))........)))))).))))))...((((((((.((........)).)))))).))..((((....)))).)))))).......))))).)))))))..))))))))).(((...(((....)))..)))((((((((.(((((((((((((.....))))))).....((((((((.....((((((((((((((...)))))))).))))))....))))))))....)))))).).....))))))).)))..)))))).....))).)))))(((((((((((((((.(((.........(((((((((((((((((..((((((((......))).))))).)))))))).(((((.(((...))).))))).((((....(((((((((((((((((........(((((((.((.....)).)))))))......((((((.((((...........((((((.((((((.((((......))))((((((((((((((((....))))))..)).)))))))).((((....)))).)))))).))))))..(((..((.......))))).(((.((((.(((((....))))))))).))))))).))))))(((((((((......)))))))))...((.(((...))).))......(((((((((..(((((..........((((..((....(((.(.((((((.........)))))).).)))....))..)))))))))..))))...)))))(((((((........))))))))))))))))))))))))....)))).).))))))))...(((((.(((....((((((((.(((((....((((.....))))((((((((......))))))))))))).)))).))))..))).)))))....(((((.(((((.((((..((((((.(.(((((...(((((........((((..((((.((((......)))).((((.(((.((((((((((((....)))))..))))))).)).).))))................((((...((((.............))))..)))).))))..)))).((((.......((((.....(((...)))...)))))))).......)))))))))).)))))))..)))).))))).)))))((..((((........))))..))))).))))))))(((((......)))))....(((((((((((((((((((((((((((((((((.....(((((.....((((.(((.((.((..((((....))))..)).))..))).)))).....))))).((((((((((.......))))))...))))))))))))))))))).((((......))))......)))))))))))...........)))))))..(((((((..........)))))))........))))))).(((((.((((((.......)))))).)))))........)))..)))))))....)))).)))))).))).............)))))))))))))))).)))).)))).)))))))))))).)))))).)))))))))).)))).......(((((((....(((.((....)))))))))))).........(((((((((.((...(((.((....)).)))....)))))))))))....)))))))))))..))))....(((((....)))))........))))))))))).))))))).))...)).))))))))))...(((.((((....)))).))).....))))))))..............)))))))).)))))))))...)))))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((,{,.||,.,((({{.({((,.((((((,({(,{((((((((((...))))))))),.{|||||||}||||||}..,,,,}}))}}.{||||||||......((((..(((..(((((((((((((.{((((((...)))))}.....,}.))))))))))....)))..)))..))))....,{{{{{,.(,.(({((((...{{,||||{||.||.,,(((((,....}|||}.((((({,..})}}}}..{{{{{..,||{||||||||{,,,,||||.||,}||||......((((((..(((..,(((.(((((.((...(((.,.((....)).)))...))))))).))),)))..)))))).,}},}})))))))..}}}|||},..,,,.......((((((.,,.(({({,.((.((((((((((,...,(((((((..,,.(((({{(((((..,,(((.(((((.......))))))))......((((.((...({,....})....))))))...{{{{((((.((((((((((.((.((((.{{.....,,{,....,,((({,,.,|||{((({(((({(,,,.(((,...,{|||{,((.((((((..((((....)))).)))))).)).,{{({((((((.....))))))......,.,,,((.((((((...}))))).)).((((((........))))))(((((((..(((((,.{,({...)))))))))))))))...,{{{{{{{{{..((((((((.((.,....))..))))}.}))..|||||||||{,..,,|||}}}}}}}},..,,,(((((,(((({.(((((.(((....((((((,(((......{{((((.(((..((((((((((((.........(((((((....((((({(((((,,((((((,,....{{.||||||,,.||}}|}.}}.,}.}},..})))).((((.((((.........)))).))))))))|||{(((({...{{,{{({,{.{({{({(((....,,(({{,...,{{,,,...{|.{||||}...,})))||}.....})))}.{(((((,((((({.....,..{{{{{||||,,{((((((((({.,.(((((((.{..........,.}.)))))))..,..,.,,.,,.,,,},,))))))))))}...||.,}}}}}....,,..}))))).))))))}}}|},,,|||}||}|,{{||,,,,|||||,.,,,.|||{.,,}),,)))))..))))}})}))))),,))))))..))))))))},{{{.,.{({...,||||.}}}((({(({{.(((((({((((((.....))))))}.....{(((((((.....((((((((((((((...)))))))).)))))}....)))))))),,,,)))))),).....))))))).))).,))))))..,..))).)))))((((((({(((((((.(((.........(((((((((((((((((..((((((((......))).))))).)))))))).{((({.(({...})).))))).((((....(((((((((((((((((,{{,.,{{({{{{||}||,,..,,}{||}}}})}}..},((((((.((({.{{..{{,.{.((((((.((((({.((((......))))((((((((({((((((....))))))..)).)))))))).((({...,)))}.}))))).)))))).,,|||,{{{{,...,|||||.{,({(((,..,|||}},})))).,})),})))))).))))))(((((((((......))))))))).{{((.{{..||})}.,,,,,,..(((((((((..(((((..........((((..((....(((.(.((((((.........)))))).).)))....)).,}))))))))..))))...))))){((((((........))))))}}))))))))))))))))....)))).)}))))))))...{((((.(((....{{{({(((.{{{{{,...{{((.,,,,|}||((((((({,.....,})))))},)))),)))))))})..))).)))))....(((((.(((((.((((..((((((.(.(((((...(((((..,.....((((..((((.((((......)))).((((.(((.((((((((((((....))))}..))))))).)).,.))))................((({...((((.............))))..)))).))))..)))).((({.....{,((((,,...|||...))).,.}}},})))..},...)))))))))).)))))))..)))).))))).))))),,..((((,,...,,.))))..))))).)))))))}(((((......)))))....((((((((((((({(((((({(((((((((((((,...(((((.....((((.(((.{(.(,{{((((....)))),})|,}}..))).))))...,.))))},{(({{{{{((.......)))))),..))))))))))))))))))).||||},....||||......}}})))))))}..........,)))))))..(((((((.,......,.)))))))........))))))).,{((({(({.,,}}}}}},}...(((((({{{{.{(({..,...}))).))))...))).)))..})))).)}))}..,,,,,))))))))})),})}}}))))}))))}))))}}}}}))),)))))).)))))))))).))))...,.,,((((((({{..{{{.||..,.,}})))))))}}.........(((((((((.{(...(((.{{....}}.)))....}})))))))))..,.})))}})))))..)))).,..(((((....)))))..,},...)))))))))))})}))))).))...,),})),))))))....,,.||||.,,}))))}}|}|..,,...,}})},...,{{....,,.}}}}}}))},)}})))},.,,))}))))))............
Back