Basic Information

Symbol
ATP5MC3
RNA class
mRNA
Alias
ATP Synthase Membrane Subunit C Locus 3 ATP5G3 ATP Synthase, H+ Transporting, Mitochondrial F0 Complex, Subunit C3 (Subunit 9) ATP Synthase, H+ Transporting, Mitochondrial Fo Complex Subunit C3 (Subunit 9) ATP Synthase Proton-Transporting Mitochondrial F(0) Complex Subunit C3 Dicyclohexylcarbodiimide (DCCD)-Reactive Proteolipid Subunit ATP Synthase F(0) Complex Subunit C3, Mitochondrial ATP Synthase Proteolipid P3 ATP Synthase Subunit 9 ATPase Protein 9 ATPase Subunit C ATP Synthase, H+ Transporting, Mitochondrial F0 Complex, Subunit C (Subunit 9) Isoform 3 ATP Synthase, H+ Transporting, Mitochondrial Fo Complex, Subunit C3 (Subunit 9) ATP Synthase Lipid-Binding Protein, Mitochondrial ATP Synthase, Mitochondrial, C Subunit-3 ATP Synthase Lipid-Binding Protein DYTSPG P3
Location (GRCh38)
2:175176258-175181764
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001689.5
Sequence length
2587.0 nt
GC content
0.3846

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-682.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -733.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 702.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002258.5 NCBI
AGUCCCACUCCUUCGACCUCUGCCGCAGCCCGUGCCGCCGCCGCCUCCU… 2776 nt 0.4056
NM_001190329.2 NCBI
AGUCCCACUCCUUCGACCUCUGCCGCAGCCCGUGCCGCCGCCGCCUCCU… 3241 nt 0.3737
NM_001689.5 NCBI
AGUCCCACUCCUUCGACCUCUGCCGCAGCCCGUGCCGCCGCCGCCUCCU… 2587 nt 0.3846
Summary

This gene encodes a subunit of mitochondrial ATP synthase. Mitochondrial ATP synthase catalyzes ATP synthesis, utilizing an electrochemical gradient of protons across the inner membrane during oxidative phosphorylation. ATP synthase is composed of two linked multi-subunit complexes: the soluble catalytic core, F1, and the membrane-spanning component, Fo, comprising the proton channel. The catalytic portion of mitochondrial ATP synthase consists of 5 different subunits (alpha, beta, gamma, delta, and epsilon) assembled with a stoichiometry of 3 alpha, 3 beta, and a single representative of the other 3. The proton channel seems to have nine subunits (a, b, c, d, e, f, g, F6 and 8). This gene is one of three genes that encode subunit c of the proton channel. Each of the three genes have distinct mitochondrial import sequences but encode the identical mature protein. Alternatively spliced transcript variants encoding different proteins have been identified. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ATP5MC3 was up-regulated among shared neuronal differentially expressed genes in the ventral tegmental area during the addicting phase of nicotine self-administration [Fan et al. DOI:10.1016/J.Jgg.2024.08.009].